MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 3052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006362	GTT	2	6	16	21	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027649
2	NC_006362	GGC	2	6	69	74	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027649
3	NC_006362	CAC	2	6	75	80	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027649
4	NC_006362	GCG	2	6	127	132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027649
5	NC_006362	CAG	2	6	155	160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027649
6	NC_006362	TGG	2	6	163	168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027649
7	NC_006362	CAG	3	9	246	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027649
8	NC_006362	AGC	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027649
9	NC_006362	TCA	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027649
10	NC_006362	AAT	2	6	487	492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54027649
11	NC_006362	GTG	2	6	622	627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027649
12	NC_006362	GAA	2	6	767	772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027650
13	NC_006362	TCG	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027650
14	NC_006362	ATC	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027650
15	NC_006362	CGT	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027650
16	NC_006362	CGG	2	6	1287	1292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027650
17	NC_006362	CCG	2	6	1381	1386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027650
18	NC_006362	GAA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027650
19	NC_006362	CTC	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027650
20	NC_006362	GTG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027650
21	NC_006362	AGC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027650
22	NC_006362	AGT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027650
23	NC_006362	CGG	2	6	2213	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
24	NC_006362	CGG	2	6	2262	2267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
25	NC_006362	GCG	2	6	2295	2300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
26	NC_006362	TGC	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027651
27	NC_006362	AGG	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027651
28	NC_006362	GAC	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027651
29	NC_006362	GCG	2	6	2468	2473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
30	NC_006362	GTC	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027651
31	NC_006362	GCA	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027651
32	NC_006362	GAA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027651
33	NC_006362	CGG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
34	NC_006362	CAG	2	6	2737	2742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027651
35	NC_006362	GTG	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027651
36	NC_006362	GGC	2	6	2814	2819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
37	NC_006362	GCC	2	6	2837	2842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027651
38	NC_006362	CGG	2	6	2880	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
39	NC_006362	GGC	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
40	NC_006362	GCG	3	9	3177	3185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
41	NC_006362	TGC	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027652
42	NC_006362	CGT	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027652
43	NC_006362	ACC	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027652
44	NC_006362	CAG	3	9	3585	3593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027652
45	NC_006362	GCG	2	6	3595	3600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
46	NC_006362	GCG	2	6	3610	3615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
47	NC_006362	GGC	2	6	3641	3646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
48	NC_006362	CGT	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027652
49	NC_006362	CGA	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027652
50	NC_006362	GCG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
51	NC_006362	CGA	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027652
52	NC_006362	GCC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027652
53	NC_006362	GGT	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027652
54	NC_006362	CGG	2	6	3840	3845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
55	NC_006362	GCG	2	6	3852	3857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
56	NC_006362	GCG	2	6	3946	3951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
57	NC_006362	CCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027652
58	NC_006362	GCG	2	6	4076	4081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
59	NC_006362	GCC	3	9	4177	4185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027652
60	NC_006362	AGC	2	6	4426	4431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027653
61	NC_006362	GTC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027653
62	NC_006362	GCC	2	6	4628	4633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027653
63	NC_006362	GCA	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027653
64	NC_006362	CGG	2	6	4673	4678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027653
65	NC_006362	GCT	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027653
66	NC_006362	AGG	2	6	4777	4782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027653
67	NC_006362	CTC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027653
68	NC_006362	ACC	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027653
69	NC_006362	CCG	3	9	4810	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027653
70	NC_006362	TTC	2	6	5090	5095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027654
71	NC_006362	GGC	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
72	NC_006362	GCA	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027654
73	NC_006362	GGT	2	6	5152	5157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027654
74	NC_006362	CGC	2	6	5169	5174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027654
75	NC_006362	GTC	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
76	NC_006362	GTC	2	6	5279	5284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
77	NC_006362	GCT	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
78	NC_006362	TCG	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
79	NC_006362	GGC	2	6	5325	5330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
80	NC_006362	GTC	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
81	NC_006362	GGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
82	NC_006362	CGG	2	6	5526	5531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
83	NC_006362	TGG	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027654
84	NC_006362	GCG	2	6	5663	5668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
85	NC_006362	GGA	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027655
86	NC_006362	CGC	2	6	6041	6046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027655
87	NC_006362	CGA	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027655
88	NC_006362	TCG	2	6	6119	6124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
89	NC_006362	TCG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
90	NC_006362	TCG	2	6	6209	6214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
91	NC_006362	GGC	2	6	6241	6246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027655
92	NC_006362	TCG	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
93	NC_006362	GTT	2	6	6327	6332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027655
94	NC_006362	GTC	2	6	6346	6351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
95	NC_006362	GTT	2	6	6364	6369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027655
96	NC_006362	GGC	2	6	6451	6456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027655
97	NC_006362	GTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027655
98	NC_006362	ATC	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027655
99	NC_006362	TAG	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027656
100	NC_006362	GCG	2	6	6704	6709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027656
101	NC_006362	TCC	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027656
102	NC_006362	GTC	2	6	6766	6771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027656
103	NC_006362	GCG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027656
104	NC_006362	GAT	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027656
105	NC_006362	GGT	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027656
106	NC_006362	GGT	2	6	7003	7008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027656
107	NC_006362	TTG	2	6	7112	7117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027656
108	NC_006362	GTC	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027656
109	NC_006362	CGC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027656
110	NC_006362	GGC	2	6	7233	7238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027656
111	NC_006362	GCC	2	6	7246	7251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027656
112	NC_006362	CGC	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027656
113	NC_006362	TCG	2	6	7331	7336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027656
114	NC_006362	TCG	2	6	7516	7521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
115	NC_006362	CGG	2	6	7583	7588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
116	NC_006362	TCG	2	6	7639	7644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
117	NC_006362	ACG	2	6	7666	7671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027657
118	NC_006362	GCT	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
119	NC_006362	GGC	2	6	7698	7703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
120	NC_006362	CGG	2	6	7742	7747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
121	NC_006362	CGA	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027657
122	NC_006362	CGG	2	6	7772	7777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
123	NC_006362	GCC	2	6	7786	7791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027657
124	NC_006362	CGG	2	6	7793	7798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
125	NC_006362	CTC	2	6	7872	7877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027657
126	NC_006362	GGT	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027657
127	NC_006362	CCG	2	6	7982	7987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027657
128	NC_006362	GCC	2	6	7988	7993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027657
129	NC_006362	GTC	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
130	NC_006362	TCG	2	6	8080	8085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
131	NC_006362	AGC	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027657
132	NC_006362	CCG	2	6	8111	8116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027657
133	NC_006362	CTG	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
134	NC_006362	GGT	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027657
135	NC_006362	CGT	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
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137	NC_006362	CGA	2	6	8288	8293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027657
138	NC_006362	GTC	2	6	8326	8331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
139	NC_006362	GTC	2	6	8388	8393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
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141	NC_006362	CCA	2	6	8533	8538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027658
142	NC_006362	CGG	3	9	8557	8565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027658
143	NC_006362	CTG	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027658
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145	NC_006362	GTA	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027658
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148	NC_006362	GAG	2	6	8922	8927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027658
149	NC_006362	CCG	2	6	8928	8933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027658
150	NC_006362	CGA	2	6	8944	8949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027658
151	NC_006362	CCG	2	6	8965	8970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027658
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155	NC_006362	GCG	3	9	9055	9063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027658
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159	NC_006362	GGC	2	6	9206	9211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027658
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164	NC_006362	CGG	2	6	9385	9390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027658
165	NC_006362	CCG	2	6	9391	9396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027658
166	NC_006362	GGC	2	6	9405	9410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027658
167	NC_006362	GCC	2	6	9630	9635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027658
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256	NC_006362	GCC	2	6	14474	14479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027665
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258	NC_006362	TCG	2	6	14515	14520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027665
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260	NC_006362	ACG	2	6	14556	14561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027665
261	NC_006362	GCG	2	6	14581	14586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027665
262	NC_006362	GCC	2	6	14727	14732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027665
263	NC_006362	GCC	2	6	14741	14746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027665
264	NC_006362	GCG	2	6	14807	14812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027665
265	NC_006362	TAC	2	6	14841	14846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027665
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291	NC_006362	GAG	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027666
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293	NC_006362	CGT	2	6	16128	16133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027666
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295	NC_006362	CGC	2	6	16193	16198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027667
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373	NC_006362	ATG	2	6	20002	20007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027669
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385	NC_006362	TGT	2	6	20947	20952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027670
386	NC_006362	TCA	2	6	21295	21300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027671
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498	NC_006362	GCA	2	6	28916	28921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027676
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500	NC_006362	CGG	2	6	29084	29089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027676

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