MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 421

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006362	TC	3	6	116	121	0 %	50 %	0 %	50 %	54027649
2	NC_006362	CA	3	6	209	214	50 %	0 %	0 %	50 %	54027649
3	NC_006362	GC	3	6	231	236	0 %	0 %	50 %	50 %	54027649
4	NC_006362	GC	3	6	357	362	0 %	0 %	50 %	50 %	54027649
5	NC_006362	CG	3	6	597	602	0 %	0 %	50 %	50 %	54027649
6	NC_006362	CG	3	6	732	737	0 %	0 %	50 %	50 %	54027650
7	NC_006362	CG	3	6	794	799	0 %	0 %	50 %	50 %	54027650
8	NC_006362	CG	3	6	898	903	0 %	0 %	50 %	50 %	54027650
9	NC_006362	AG	3	6	972	977	50 %	0 %	50 %	0 %	54027650
10	NC_006362	CG	3	6	1820	1825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006362	CA	3	6	1853	1858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_006362	GC	4	8	2109	2116	0 %	0 %	50 %	50 %	54027651
13	NC_006362	TG	3	6	2256	2261	0 %	50 %	50 %	0 %	54027651
14	NC_006362	GC	3	6	2947	2952	0 %	0 %	50 %	50 %	54027651
15	NC_006362	AC	3	6	3023	3028	50 %	0 %	0 %	50 %	54027652
16	NC_006362	TG	3	6	3515	3520	0 %	50 %	50 %	0 %	54027652
17	NC_006362	GC	3	6	3694	3699	0 %	0 %	50 %	50 %	54027652
18	NC_006362	AC	3	6	4472	4477	50 %	0 %	0 %	50 %	54027653
19	NC_006362	AG	3	6	5020	5025	50 %	0 %	50 %	0 %	54027654
20	NC_006362	CG	3	6	5082	5087	0 %	0 %	50 %	50 %	54027654
21	NC_006362	CG	3	6	5317	5322	0 %	0 %	50 %	50 %	54027654
22	NC_006362	GC	3	6	5487	5492	0 %	0 %	50 %	50 %	54027654
23	NC_006362	CT	4	8	6510	6517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006362	CG	3	6	7297	7302	0 %	0 %	50 %	50 %	54027656
25	NC_006362	GA	3	6	7409	7414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006362	GC	3	6	7603	7608	0 %	0 %	50 %	50 %	54027657
27	NC_006362	GC	3	6	8035	8040	0 %	0 %	50 %	50 %	54027657
28	NC_006362	GA	3	6	8434	8439	50 %	0 %	50 %	0 %	54027657
29	NC_006362	CG	3	6	9916	9921	0 %	0 %	50 %	50 %	54027658
30	NC_006362	CA	3	6	10098	10103	50 %	0 %	0 %	50 %	54027658
31	NC_006362	AT	3	6	10244	10249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006362	GT	3	6	10400	10405	0 %	50 %	50 %	0 %	54027659
33	NC_006362	GC	3	6	11029	11034	0 %	0 %	50 %	50 %	54027659
34	NC_006362	CG	3	6	11219	11224	0 %	0 %	50 %	50 %	54027660
35	NC_006362	GC	3	6	11296	11301	0 %	0 %	50 %	50 %	54027660
36	NC_006362	GC	3	6	11525	11530	0 %	0 %	50 %	50 %	54027661
37	NC_006362	GC	3	6	11612	11617	0 %	0 %	50 %	50 %	54027661
38	NC_006362	GA	3	6	11860	11865	50 %	0 %	50 %	0 %	54027661
39	NC_006362	CG	3	6	11927	11932	0 %	0 %	50 %	50 %	54027662
40	NC_006362	GC	3	6	12014	12019	0 %	0 %	50 %	50 %	54027662
41	NC_006362	CG	3	6	12583	12588	0 %	0 %	50 %	50 %	54027664
42	NC_006362	GC	3	6	12655	12660	0 %	0 %	50 %	50 %	54027664
43	NC_006362	CG	3	6	12998	13003	0 %	0 %	50 %	50 %	54027664
44	NC_006362	GC	3	6	13033	13038	0 %	0 %	50 %	50 %	54027664
45	NC_006362	CA	3	6	13328	13333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006362	GT	3	6	13636	13641	0 %	50 %	50 %	0 %	54027665
47	NC_006362	CG	3	6	14057	14062	0 %	0 %	50 %	50 %	54027665
48	NC_006362	CG	3	6	14328	14333	0 %	0 %	50 %	50 %	54027665
49	NC_006362	CG	3	6	14870	14875	0 %	0 %	50 %	50 %	54027665
50	NC_006362	GC	3	6	15017	15022	0 %	0 %	50 %	50 %	54027665
51	NC_006362	GC	3	6	15138	15143	0 %	0 %	50 %	50 %	54027665
52	NC_006362	CG	3	6	15392	15397	0 %	0 %	50 %	50 %	54027666
53	NC_006362	CG	3	6	16645	16650	0 %	0 %	50 %	50 %	54027667
54	NC_006362	CG	3	6	17226	17231	0 %	0 %	50 %	50 %	54027667
55	NC_006362	CG	3	6	17257	17262	0 %	0 %	50 %	50 %	54027667
56	NC_006362	CG	3	6	17346	17351	0 %	0 %	50 %	50 %	54027667
57	NC_006362	GC	3	6	17706	17711	0 %	0 %	50 %	50 %	54027668
58	NC_006362	CG	3	6	17846	17851	0 %	0 %	50 %	50 %	54027668
59	NC_006362	GC	3	6	18539	18544	0 %	0 %	50 %	50 %	54027668
60	NC_006362	GC	3	6	20720	20725	0 %	0 %	50 %	50 %	54027670
61	NC_006362	GT	3	6	21613	21618	0 %	50 %	50 %	0 %	54027671
62	NC_006362	TC	3	6	22047	22052	0 %	50 %	0 %	50 %	54027671
63	NC_006362	GC	3	6	22176	22181	0 %	0 %	50 %	50 %	54027671
64	NC_006362	GC	3	6	22614	22619	0 %	0 %	50 %	50 %	54027671
65	NC_006362	CG	3	6	22670	22675	0 %	0 %	50 %	50 %	54027671
66	NC_006362	CG	3	6	22985	22990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_006362	AG	3	6	23046	23051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006362	AC	3	6	23188	23193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006362	TG	3	6	24154	24159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006362	GC	3	6	24529	24534	0 %	0 %	50 %	50 %	54027672
71	NC_006362	AC	3	6	24571	24576	50 %	0 %	0 %	50 %	54027672
72	NC_006362	CG	3	6	24836	24841	0 %	0 %	50 %	50 %	54027672
73	NC_006362	CG	3	6	25094	25099	0 %	0 %	50 %	50 %	54027672
74	NC_006362	AC	3	6	26875	26880	50 %	0 %	0 %	50 %	54027673
75	NC_006362	TG	3	6	26982	26987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006362	GC	3	6	27582	27587	0 %	0 %	50 %	50 %	54027674
77	NC_006362	AC	3	6	27897	27902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006362	CG	3	6	28108	28113	0 %	0 %	50 %	50 %	54027675
79	NC_006362	GC	3	6	29477	29482	0 %	0 %	50 %	50 %	54027676
80	NC_006362	AC	3	6	29822	29827	50 %	0 %	0 %	50 %	54027676
81	NC_006362	CG	3	6	30120	30125	0 %	0 %	50 %	50 %	54027676
82	NC_006362	GC	3	6	30412	30417	0 %	0 %	50 %	50 %	54027676
83	NC_006362	CG	3	6	32004	32009	0 %	0 %	50 %	50 %	54027677
84	NC_006362	GC	3	6	32230	32235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_006362	GC	3	6	32700	32705	0 %	0 %	50 %	50 %	54027678
86	NC_006362	CG	3	6	33161	33166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_006362	GC	3	6	36421	36426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006362	CG	4	8	36793	36800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006362	CG	3	6	36809	36814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006362	GT	3	6	37965	37970	0 %	50 %	50 %	0 %	54027679
91	NC_006362	GC	3	6	38098	38103	0 %	0 %	50 %	50 %	54027679
92	NC_006362	GC	3	6	38169	38174	0 %	0 %	50 %	50 %	54027679
93	NC_006362	CG	3	6	38794	38799	0 %	0 %	50 %	50 %	54027679
94	NC_006362	CT	3	6	40335	40340	0 %	50 %	0 %	50 %	54027681
95	NC_006362	CG	3	6	40636	40641	0 %	0 %	50 %	50 %	54027681
96	NC_006362	GT	3	6	41210	41215	0 %	50 %	50 %	0 %	54027681
97	NC_006362	CG	3	6	42580	42585	0 %	0 %	50 %	50 %	54027683
98	NC_006362	GC	3	6	43547	43552	0 %	0 %	50 %	50 %	54027683
99	NC_006362	CG	4	8	44734	44741	0 %	0 %	50 %	50 %	54027685
100	NC_006362	AT	3	6	45120	45125	50 %	50 %	0 %	0 %	54027685
101	NC_006362	TC	3	6	45291	45296	0 %	50 %	0 %	50 %	54027685
102	NC_006362	GC	3	6	45376	45381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_006362	GC	3	6	46325	46330	0 %	0 %	50 %	50 %	54027686
104	NC_006362	GC	3	6	46999	47004	0 %	0 %	50 %	50 %	54027687
105	NC_006362	AC	3	6	47544	47549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006362	GC	3	6	47625	47630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_006362	CG	3	6	48875	48880	0 %	0 %	50 %	50 %	54027689
108	NC_006362	GC	3	6	49326	49331	0 %	0 %	50 %	50 %	54027690
109	NC_006362	GC	4	8	49405	49412	0 %	0 %	50 %	50 %	54027690
110	NC_006362	CG	3	6	49590	49595	0 %	0 %	50 %	50 %	54027690
111	NC_006362	CG	3	6	50275	50280	0 %	0 %	50 %	50 %	54027691
112	NC_006362	CG	4	8	50728	50735	0 %	0 %	50 %	50 %	54027692
113	NC_006362	AC	3	6	51147	51152	50 %	0 %	0 %	50 %	54027692
114	NC_006362	CG	3	6	51810	51815	0 %	0 %	50 %	50 %	54027693
115	NC_006362	CG	3	6	52251	52256	0 %	0 %	50 %	50 %	54027694
116	NC_006362	GC	3	6	52802	52807	0 %	0 %	50 %	50 %	54027694
117	NC_006362	GT	3	6	52975	52980	0 %	50 %	50 %	0 %	54027695
118	NC_006362	TC	3	6	54092	54097	0 %	50 %	0 %	50 %	54027696
119	NC_006362	GC	3	6	56053	56058	0 %	0 %	50 %	50 %	54027698
120	NC_006362	GA	3	6	56183	56188	50 %	0 %	50 %	0 %	54027699
121	NC_006362	CA	3	6	57837	57842	50 %	0 %	0 %	50 %	54027701
122	NC_006362	GC	3	6	58371	58376	0 %	0 %	50 %	50 %	54027701
123	NC_006362	GC	3	6	58405	58410	0 %	0 %	50 %	50 %	54027701
124	NC_006362	GA	3	6	58462	58467	50 %	0 %	50 %	0 %	54027701
125	NC_006362	GC	3	6	59269	59274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_006362	CA	3	6	59644	59649	50 %	0 %	0 %	50 %	54027703
127	NC_006362	GA	3	6	59667	59672	50 %	0 %	50 %	0 %	54027703
128	NC_006362	GC	3	6	60206	60211	0 %	0 %	50 %	50 %	54027703
129	NC_006362	GC	3	6	60446	60451	0 %	0 %	50 %	50 %	54027703
130	NC_006362	GC	3	6	60843	60848	0 %	0 %	50 %	50 %	54027703
131	NC_006362	CG	4	8	60849	60856	0 %	0 %	50 %	50 %	54027703
132	NC_006362	CT	3	6	61109	61114	0 %	50 %	0 %	50 %	54027703
133	NC_006362	CT	3	6	62012	62017	0 %	50 %	0 %	50 %	54027704
134	NC_006362	CA	3	6	62448	62453	50 %	0 %	0 %	50 %	54027704
135	NC_006362	CG	3	6	62473	62478	0 %	0 %	50 %	50 %	54027704
136	NC_006362	GC	3	6	62864	62869	0 %	0 %	50 %	50 %	54027704
137	NC_006362	GC	3	6	63268	63273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_006362	GT	3	6	63434	63439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006362	AT	3	6	63478	63483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006362	GC	3	6	63543	63548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_006362	CG	3	6	63641	63646	0 %	0 %	50 %	50 %	54027705
142	NC_006362	CG	4	8	64125	64132	0 %	0 %	50 %	50 %	54027705
143	NC_006362	GT	3	6	64319	64324	0 %	50 %	50 %	0 %	54027706
144	NC_006362	CG	3	6	64943	64948	0 %	0 %	50 %	50 %	54027706
145	NC_006362	CA	4	8	65768	65775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_006362	GC	3	6	65913	65918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_006362	GC	3	6	67327	67332	0 %	0 %	50 %	50 %	54027708
148	NC_006362	GC	3	6	68338	68343	0 %	0 %	50 %	50 %	54027708
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.