MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006362	CG	3	6	1820	1825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006362	CA	3	6	1853	1858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006362	CT	4	8	6510	6517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006362	GA	3	6	7409	7414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006362	AT	3	6	10244	10249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006362	CA	3	6	13328	13333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006362	CG	3	6	22985	22990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006362	AG	3	6	23046	23051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006362	AC	3	6	23188	23193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006362	TG	3	6	24154	24159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006362	TG	3	6	26982	26987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006362	AC	3	6	27897	27902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006362	GC	3	6	32230	32235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006362	CG	3	6	33161	33166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006362	GC	3	6	36421	36426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006362	CG	4	8	36793	36800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006362	CG	3	6	36809	36814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006362	GC	3	6	45376	45381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006362	AC	3	6	47544	47549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006362	GC	3	6	47625	47630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006362	GC	3	6	59269	59274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006362	GC	3	6	63268	63273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006362	GT	3	6	63434	63439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006362	AT	3	6	63478	63483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006362	GC	3	6	63543	63548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006362	CA	4	8	65768	65775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006362	GC	3	6	65913	65918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006362	GC	3	6	71930	71935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006362	GC	3	6	79439	79444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006362	TC	3	6	79775	79780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006362	TC	3	6	81583	81588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006362	GT	3	6	83247	83252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006362	AT	3	6	91081	91086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006362	TA	4	8	91099	91106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006362	TG	3	6	95079	95084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006362	GC	3	6	95191	95196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006362	GC	3	6	95290	95295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006362	GT	3	6	95296	95301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006362	TG	3	6	96237	96242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006362	GC	3	6	96470	96475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006362	GC	3	6	96996	97001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006362	GC	3	6	100013	100018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_006362	GC	3	6	100460	100465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_006362	CA	3	6	100475	100480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006362	GC	3	6	100861	100866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006362	GA	3	6	101348	101353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006362	GT	3	6	101605	101610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006362	GA	3	6	103872	103877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006362	GC	3	6	104241	104246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006362	GC	3	6	104363	104368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006362	GC	3	6	111206	111211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006362	GC	3	6	111238	111243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006362	AT	3	6	111905	111910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006362	GC	3	6	112488	112493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006362	GC	3	6	113108	113113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_006362	AC	3	6	116718	116723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006362	GT	3	6	116738	116743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006362	CG	3	6	120656	120661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006362	CG	3	6	120907	120912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006362	GA	3	6	121904	121909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006362	CG	3	6	147699	147704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_006362	CA	3	6	147729	147734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006362	GC	3	6	154871	154876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006362	TG	3	6	170832	170837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006362	GA	3	6	170898	170903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006362	GC	4	8	174069	174076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_006362	CA	3	6	174659	174664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_006362	GC	4	8	175500	175507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006362	CG	3	6	179123	179128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_006362	CG	3	6	179179	179184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006362	GC	3	6	179239	179244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_006362	GC	3	6	179370	179375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006362	CG	3	6	179379	179384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006362	CA	3	6	180315	180320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006362	CG	3	6	180501	180506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006362	GT	3	6	181064	181069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006362	CG	3	6	182900	182905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006362	CA	3	6	183198	183203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006362	CA	3	6	183256	183261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006362	CG	3	6	183422	183427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006362	GA	3	6	183487	183492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006362	CT	3	6	183934	183939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.