MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 chromosome

Total Repeats: 5741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006361	CCGGG	2	10	1763	1772	0 %	0 %	60 %	40 %	54021965
2	NC_006361	ACCAC	2	10	1874	1883	40 %	0 %	0 %	60 %	54021965
3	NC_006361	GCGCG	2	10	3682	3691	0 %	0 %	60 %	40 %	54021966
4	NC_006361	GCGCT	2	10	4978	4987	0 %	20 %	40 %	40 %	54021967
5	NC_006361	GCCCG	2	10	5877	5886	0 %	0 %	40 %	60 %	54021968
6	NC_006361	CCGGC	2	10	6169	6178	0 %	0 %	40 %	60 %	54021968
7	NC_006361	GGCGT	2	10	6867	6876	0 %	20 %	60 %	20 %	54021969
8	NC_006361	GTGCG	2	10	7129	7138	0 %	20 %	60 %	20 %	54021969
9	NC_006361	GCAGC	2	10	9310	9319	20 %	0 %	40 %	40 %	54021970
10	NC_006361	ACCGC	2	10	11453	11462	20 %	0 %	20 %	60 %	54021971
11	NC_006361	TGCTC	2	10	11678	11687	0 %	40 %	20 %	40 %	54021971
12	NC_006361	GGGCC	2	10	11769	11778	0 %	0 %	60 %	40 %	54021971
13	NC_006361	CCCGG	2	10	12334	12343	0 %	0 %	40 %	60 %	54021972
14	NC_006361	CCGGC	2	10	12737	12746	0 %	0 %	40 %	60 %	54021972
15	NC_006361	GCCCG	2	10	12906	12915	0 %	0 %	40 %	60 %	54021972
16	NC_006361	GTCCG	2	10	14028	14037	0 %	20 %	40 %	40 %	54021973
17	NC_006361	TCCGC	2	10	15017	15026	0 %	20 %	20 %	60 %	54021973
18	NC_006361	GCCCG	2	10	15108	15117	0 %	0 %	40 %	60 %	54021973
19	NC_006361	TCCGC	2	10	16713	16722	0 %	20 %	20 %	60 %	54021975
20	NC_006361	CGCGG	2	10	17316	17325	0 %	0 %	60 %	40 %	54021977
21	NC_006361	ACGAC	2	10	18236	18245	40 %	0 %	20 %	40 %	54021978
22	NC_006361	CGCAG	2	10	18279	18288	20 %	0 %	40 %	40 %	54021978
23	NC_006361	CGCGC	2	10	18366	18375	0 %	0 %	40 %	60 %	54021978
24	NC_006361	CTCGC	2	10	20097	20106	0 %	20 %	20 %	60 %	54021983
25	NC_006361	CGACC	2	10	20265	20274	20 %	0 %	20 %	60 %	54021983
26	NC_006361	CGGGC	2	10	20359	20368	0 %	0 %	60 %	40 %	54021983
27	NC_006361	CGCTG	2	10	22251	22260	0 %	20 %	40 %	40 %	54021987
28	NC_006361	GCGCA	2	10	26965	26974	20 %	0 %	40 %	40 %	54021999
29	NC_006361	ACCGC	2	10	28933	28942	20 %	0 %	20 %	60 %	54022003
30	NC_006361	CGCAG	2	10	31163	31172	20 %	0 %	40 %	40 %	54022005
31	NC_006361	GACCA	2	10	32333	32342	40 %	0 %	20 %	40 %	54022006
32	NC_006361	CCGGA	2	10	34476	34485	20 %	0 %	40 %	40 %	54022009
33	NC_006361	ATCCC	2	10	34637	34646	20 %	20 %	0 %	60 %	54022010
34	NC_006361	GAGGG	2	10	34877	34886	20 %	0 %	80 %	0 %	54022010
35	NC_006361	CGGCC	2	10	37466	37475	0 %	0 %	40 %	60 %	54022015
36	NC_006361	CGGCG	2	10	37517	37526	0 %	0 %	60 %	40 %	54022015
37	NC_006361	CGGGC	2	10	37753	37762	0 %	0 %	60 %	40 %	54022015
38	NC_006361	CACGA	2	10	42031	42040	40 %	0 %	20 %	40 %	54022017
39	NC_006361	GCCCG	2	10	43471	43480	0 %	0 %	40 %	60 %	54022018
40	NC_006361	CCGGC	2	10	44258	44267	0 %	0 %	40 %	60 %	54022019
41	NC_006361	CCCGG	2	10	44275	44284	0 %	0 %	40 %	60 %	54022019
42	NC_006361	CGGCG	2	10	44508	44517	0 %	0 %	60 %	40 %	54022019
43	NC_006361	GCCCG	2	10	44619	44628	0 %	0 %	40 %	60 %	54022019
44	NC_006361	CCGGC	2	10	45535	45544	0 %	0 %	40 %	60 %	54022020
45	NC_006361	CGGCT	2	10	45999	46008	0 %	20 %	40 %	40 %	54022020
46	NC_006361	TCGCA	2	10	47071	47080	20 %	20 %	20 %	40 %	54022022
47	NC_006361	TCGGC	2	10	48384	48393	0 %	20 %	40 %	40 %	54022025
48	NC_006361	GCGCG	2	10	48589	48598	0 %	0 %	60 %	40 %	54022025
49	NC_006361	ACGGG	2	10	48666	48675	20 %	0 %	60 %	20 %	54022025
50	NC_006361	CGTCG	2	10	48884	48893	0 %	20 %	40 %	40 %	54022026
51	NC_006361	GACTG	2	10	49488	49497	20 %	20 %	40 %	20 %	54022026
52	NC_006361	TCAGC	2	10	51727	51736	20 %	20 %	20 %	40 %	54022031
53	NC_006361	GCACT	2	10	52134	52143	20 %	20 %	20 %	40 %	54022032
54	NC_006361	CACCG	2	10	52624	52633	20 %	0 %	20 %	60 %	54022033
55	NC_006361	GCAGC	2	10	52709	52718	20 %	0 %	40 %	40 %	54022033
56	NC_006361	CGCGC	2	10	52867	52876	0 %	0 %	40 %	60 %	54022033
57	NC_006361	CGGCT	2	10	53397	53406	0 %	20 %	40 %	40 %	54022034
58	NC_006361	CGGCG	2	10	53945	53954	0 %	0 %	60 %	40 %	54022034
59	NC_006361	TCGGG	2	10	57217	57226	0 %	20 %	60 %	20 %	54022038
60	NC_006361	CTGAG	2	10	60565	60574	20 %	20 %	40 %	20 %	54022042
61	NC_006361	GCTGA	2	10	60611	60620	20 %	20 %	40 %	20 %	54022043
62	NC_006361	TGGGC	2	10	61462	61471	0 %	20 %	60 %	20 %	54022044
63	NC_006361	AGCCG	2	10	61852	61861	20 %	0 %	40 %	40 %	54022044
64	NC_006361	TCGGC	2	10	62026	62035	0 %	20 %	40 %	40 %	54022044
65	NC_006361	CGAGT	2	10	62252	62261	20 %	20 %	40 %	20 %	54022044
66	NC_006361	GGCGC	2	10	62654	62663	0 %	0 %	60 %	40 %	54022044
67	NC_006361	GGCCG	2	10	63131	63140	0 %	0 %	60 %	40 %	54022045
68	NC_006361	CGGCC	2	10	63649	63658	0 %	0 %	40 %	60 %	54022045
69	NC_006361	GCCCG	2	10	63690	63699	0 %	0 %	40 %	60 %	54022045
70	NC_006361	GGTCG	2	10	64363	64372	0 %	20 %	60 %	20 %	54022045
71	NC_006361	CGGCG	2	10	65285	65294	0 %	0 %	60 %	40 %	54022046
72	NC_006361	GCTCG	2	10	65525	65534	0 %	20 %	40 %	40 %	54022046
73	NC_006361	AGGCC	2	10	66276	66285	20 %	0 %	40 %	40 %	54022047
74	NC_006361	GGGGA	2	10	67118	67127	20 %	0 %	80 %	0 %	54022047
75	NC_006361	AGGCC	2	10	67293	67302	20 %	0 %	40 %	40 %	54022047
76	NC_006361	CGGCG	2	10	68185	68194	0 %	0 %	60 %	40 %	54022048
77	NC_006361	GCCCG	2	10	69679	69688	0 %	0 %	40 %	60 %	54022050
78	NC_006361	GCCGC	2	10	69948	69957	0 %	0 %	40 %	60 %	54022050
79	NC_006361	CCGGG	2	10	70682	70691	0 %	0 %	60 %	40 %	54022050
80	NC_006361	ACGGC	2	10	72605	72614	20 %	0 %	40 %	40 %	54022052
81	NC_006361	CCGAC	2	10	72731	72740	20 %	0 %	20 %	60 %	54022052
82	NC_006361	GCGAA	2	10	73496	73505	40 %	0 %	40 %	20 %	54022052
83	NC_006361	GCCCG	2	10	73666	73675	0 %	0 %	40 %	60 %	54022052
84	NC_006361	CCCCG	2	10	74019	74028	0 %	0 %	20 %	80 %	54022052
85	NC_006361	CGCGG	2	10	74128	74137	0 %	0 %	60 %	40 %	54022052
86	NC_006361	CGACG	2	10	74292	74301	20 %	0 %	40 %	40 %	54022052
87	NC_006361	GGCCC	2	10	75433	75442	0 %	0 %	40 %	60 %	54022053
88	NC_006361	CGCCC	2	10	75469	75478	0 %	0 %	20 %	80 %	54022053
89	NC_006361	CGGTC	2	10	78211	78220	0 %	20 %	40 %	40 %	54022055
90	NC_006361	GCGCC	2	10	79882	79891	0 %	0 %	40 %	60 %	54022057
91	NC_006361	CCCCG	2	10	81443	81452	0 %	0 %	20 %	80 %	54022058
92	NC_006361	GGCCC	2	10	83298	83307	0 %	0 %	40 %	60 %	54022059
93	NC_006361	GCCGA	2	10	84702	84711	20 %	0 %	40 %	40 %	54022060
94	NC_006361	TCGCC	2	10	84985	84994	0 %	20 %	20 %	60 %	54022060
95	NC_006361	CCCGG	2	10	86229	86238	0 %	0 %	40 %	60 %	54022060
96	NC_006361	GCGCG	2	10	86684	86693	0 %	0 %	60 %	40 %	54022060
97	NC_006361	ACCCG	2	10	89631	89640	20 %	0 %	20 %	60 %	54022061
98	NC_006361	GGGCC	2	10	90592	90601	0 %	0 %	60 %	40 %	54022061
99	NC_006361	CCCGG	2	10	91984	91993	0 %	0 %	40 %	60 %	54022063
100	NC_006361	TGCGG	2	10	92032	92041	0 %	20 %	60 %	20 %	54022063
101	NC_006361	GCGCC	2	10	92221	92230	0 %	0 %	40 %	60 %	54022063
102	NC_006361	GGCCG	2	10	92567	92576	0 %	0 %	60 %	40 %	54022064
103	NC_006361	CGGAC	2	10	93087	93096	20 %	0 %	40 %	40 %	54022065
104	NC_006361	CCCGT	2	10	94073	94082	0 %	20 %	20 %	60 %	54022066
105	NC_006361	GCGCT	2	10	95146	95155	0 %	20 %	40 %	40 %	54022067
106	NC_006361	AACCG	2	10	96527	96536	40 %	0 %	20 %	40 %	54022067
107	NC_006361	CGCAG	2	10	97336	97345	20 %	0 %	40 %	40 %	54022067
108	NC_006361	GCCGC	2	10	98817	98826	0 %	0 %	40 %	60 %	54022071
109	NC_006361	CGATC	2	10	99570	99579	20 %	20 %	20 %	40 %	54022072
110	NC_006361	CACCC	2	10	99686	99695	20 %	0 %	0 %	80 %	54022072
111	NC_006361	CGAGC	2	10	100357	100366	20 %	0 %	40 %	40 %	54022073
112	NC_006361	CTCGG	2	10	103235	103244	0 %	20 %	40 %	40 %	54022077
113	NC_006361	CGGCG	2	10	103841	103850	0 %	0 %	60 %	40 %	54022078
114	NC_006361	CCACC	2	10	103954	103963	20 %	0 %	0 %	80 %	54022078
115	NC_006361	ACGGC	2	10	104068	104077	20 %	0 %	40 %	40 %	54022078
116	NC_006361	CGGGC	2	10	110657	110666	0 %	0 %	60 %	40 %	54022083
117	NC_006361	ACCGT	2	10	111001	111010	20 %	20 %	20 %	40 %	54022084
118	NC_006361	GCCCG	2	10	114089	114098	0 %	0 %	40 %	60 %	54022088
119	NC_006361	CCGGC	2	10	114178	114187	0 %	0 %	40 %	60 %	54022088
120	NC_006361	ACCGG	2	10	115271	115280	20 %	0 %	40 %	40 %	54022089
121	NC_006361	TGCCC	2	10	117716	117725	0 %	20 %	20 %	60 %	54022092
122	NC_006361	ACTTC	2	10	118241	118250	20 %	40 %	0 %	40 %	54022092
123	NC_006361	CCCGG	2	10	118327	118336	0 %	0 %	40 %	60 %	54022093
124	NC_006361	CCAGC	2	10	119883	119892	20 %	0 %	20 %	60 %	54022094
125	NC_006361	GCGCC	2	10	120323	120332	0 %	0 %	40 %	60 %	54022094
126	NC_006361	GCACC	2	10	120989	120998	20 %	0 %	20 %	60 %	54022095
127	NC_006361	GATCC	2	10	122061	122070	20 %	20 %	20 %	40 %	54022097
128	NC_006361	TCGGT	2	10	123584	123593	0 %	40 %	40 %	20 %	54022099
129	NC_006361	TCGCG	2	10	126154	126163	0 %	20 %	40 %	40 %	54022102
130	NC_006361	CGCAG	2	10	126931	126940	20 %	0 %	40 %	40 %	54022103
131	NC_006361	ACTCC	2	10	127111	127120	20 %	20 %	0 %	60 %	54022103
132	NC_006361	GCTGA	2	10	130852	130861	20 %	20 %	40 %	20 %	54022105
133	NC_006361	GGCCC	2	10	132185	132194	0 %	0 %	40 %	60 %	54022106
134	NC_006361	CAGCG	2	10	134015	134024	20 %	0 %	40 %	40 %	54022109
135	NC_006361	CGAGC	2	10	134044	134053	20 %	0 %	40 %	40 %	54022109
136	NC_006361	CGGGC	2	10	135165	135174	0 %	0 %	60 %	40 %	54022110
137	NC_006361	AGCGG	2	10	137262	137271	20 %	0 %	60 %	20 %	54022112
138	NC_006361	CGGCG	2	10	139276	139285	0 %	0 %	60 %	40 %	54022114
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399	NC_006361	CCGCG	2	10	452137	452146	0 %	0 %	40 %	60 %	54022401
400	NC_006361	GCACC	2	10	453312	453321	20 %	0 %	20 %	60 %	54022402
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