MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 232 chromosome

Total Repeats: 980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006360	CTTTT	2	10	635	644	0 %	80 %	0 %	20 %	54019970
2	NC_006360	ATTAA	2	10	817	826	60 %	40 %	0 %	0 %	54019970
3	NC_006360	ATTCG	2	10	944	953	20 %	40 %	20 %	20 %	54019970
4	NC_006360	ATATA	2	10	1509	1518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006360	AATTA	2	10	1911	1920	60 %	40 %	0 %	0 %	54019971
6	NC_006360	TTCGA	2	10	2498	2507	20 %	40 %	20 %	20 %	54019971
7	NC_006360	TATAA	2	10	3456	3465	60 %	40 %	0 %	0 %	54019972
8	NC_006360	TTGAA	2	10	3838	3847	40 %	40 %	20 %	0 %	54019972
9	NC_006360	CAAAG	2	10	4184	4193	60 %	0 %	20 %	20 %	54019972
10	NC_006360	GAAAA	2	10	5108	5117	80 %	0 %	20 %	0 %	54019974
11	NC_006360	AAATT	2	10	5685	5694	60 %	40 %	0 %	0 %	54019974
12	NC_006360	AGAAC	2	10	5709	5718	60 %	0 %	20 %	20 %	54019974
13	NC_006360	CAGAC	2	10	6156	6165	40 %	0 %	20 %	40 %	54019975
14	NC_006360	AATTT	2	10	6199	6208	40 %	60 %	0 %	0 %	54019975
15	NC_006360	GTTGA	2	10	6452	6461	20 %	40 %	40 %	0 %	54019975
16	NC_006360	CAATA	2	10	7399	7408	60 %	20 %	0 %	20 %	54019976
17	NC_006360	TTGTT	2	10	7557	7566	0 %	80 %	20 %	0 %	54019976
18	NC_006360	AATAA	2	10	8886	8895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006360	TCATT	2	10	10907	10916	20 %	60 %	0 %	20 %	54019978
20	NC_006360	CTTAA	2	10	11175	11184	40 %	40 %	0 %	20 %	54019979
21	NC_006360	CAAGA	2	10	11596	11605	60 %	0 %	20 %	20 %	54019979
22	NC_006360	AAGAT	2	10	12366	12375	60 %	20 %	20 %	0 %	54019980
23	NC_006360	TTATT	2	10	14009	14018	20 %	80 %	0 %	0 %	54019981
24	NC_006360	AGATC	2	10	14665	14674	40 %	20 %	20 %	20 %	54019982
25	NC_006360	AAAAG	2	10	15783	15792	80 %	0 %	20 %	0 %	54019984
26	NC_006360	ATTTT	2	10	16835	16844	20 %	80 %	0 %	0 %	54020307
27	NC_006360	ATTTT	2	10	16923	16932	20 %	80 %	0 %	0 %	54020307
28	NC_006360	ATTTT	2	10	17106	17115	20 %	80 %	0 %	0 %	54020307
29	NC_006360	TATAA	2	10	17683	17692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006360	ATATT	2	10	19031	19040	40 %	60 %	0 %	0 %	54019986
31	NC_006360	ATTTT	2	10	19313	19322	20 %	80 %	0 %	0 %	54019986
32	NC_006360	AAAAT	2	10	19611	19620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006360	TTGAG	2	10	21488	21497	20 %	40 %	40 %	0 %	54020310
34	NC_006360	AATTA	2	10	22188	22197	60 %	40 %	0 %	0 %	54020310
35	NC_006360	TTATT	2	10	22241	22250	20 %	80 %	0 %	0 %	54020310
36	NC_006360	AATTA	2	10	22410	22419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006360	AATTA	2	10	24519	24528	60 %	40 %	0 %	0 %	54020311
38	NC_006360	AATTA	2	10	24624	24633	60 %	40 %	0 %	0 %	54020311
39	NC_006360	AATTA	2	10	24769	24778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006360	AATTA	2	10	25810	25819	60 %	40 %	0 %	0 %	54020312
41	NC_006360	AGTGA	2	10	26330	26339	40 %	20 %	40 %	0 %	54020312
42	NC_006360	GTTTT	2	10	26633	26642	0 %	80 %	20 %	0 %	54020312
43	NC_006360	TAAAA	2	10	26716	26725	80 %	20 %	0 %	0 %	54020312
44	NC_006360	AATTA	2	10	27025	27034	60 %	40 %	0 %	0 %	54020312
45	NC_006360	CATTT	2	10	29289	29298	20 %	60 %	0 %	20 %	54020314
46	NC_006360	TTTGA	2	10	29674	29683	20 %	60 %	20 %	0 %	54020314
47	NC_006360	GTTTT	2	10	29893	29902	0 %	80 %	20 %	0 %	54020314
48	NC_006360	TAAAA	2	10	29976	29985	80 %	20 %	0 %	0 %	54020314
49	NC_006360	AATTA	2	10	30180	30189	60 %	40 %	0 %	0 %	54020314
50	NC_006360	AATTA	2	10	30285	30294	60 %	40 %	0 %	0 %	54020314
51	NC_006360	AATTA	2	10	31811	31820	60 %	40 %	0 %	0 %	54020315
52	NC_006360	GTTTT	2	10	32331	32340	0 %	80 %	20 %	0 %	54020315
53	NC_006360	TAAAA	2	10	32414	32423	80 %	20 %	0 %	0 %	54020315
54	NC_006360	AATTA	2	10	32723	32732	60 %	40 %	0 %	0 %	54020315
55	NC_006360	ACAAA	2	10	35237	35246	80 %	0 %	0 %	20 %	54019988
56	NC_006360	CGATT	2	10	35322	35331	20 %	40 %	20 %	20 %	54019988
57	NC_006360	TTTAA	2	10	37379	37388	40 %	60 %	0 %	0 %	54019989
58	NC_006360	TCTTT	2	10	38482	38491	0 %	80 %	0 %	20 %	54020317
59	NC_006360	TTTTG	2	10	39026	39035	0 %	80 %	20 %	0 %	54020317
60	NC_006360	AATCA	2	10	40130	40139	60 %	20 %	0 %	20 %	54020318
61	NC_006360	AAATT	2	10	43146	43155	60 %	40 %	0 %	0 %	54020319
62	NC_006360	ATCGC	2	10	43879	43888	20 %	20 %	20 %	40 %	54020319
63	NC_006360	CTTTT	2	10	44961	44970	0 %	80 %	0 %	20 %	54020320
64	NC_006360	TAAAT	2	10	46202	46211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006360	CCTTG	2	10	46629	46638	0 %	40 %	20 %	40 %	54019991
66	NC_006360	AAATC	2	10	47126	47135	60 %	20 %	0 %	20 %	54019991
67	NC_006360	ATGAT	2	10	47311	47320	40 %	40 %	20 %	0 %	54019991
68	NC_006360	AGTTC	2	10	47575	47584	20 %	40 %	20 %	20 %	54019992
69	NC_006360	AATTC	2	10	47611	47620	40 %	40 %	0 %	20 %	54019992
70	NC_006360	TAAAT	2	10	48507	48516	60 %	40 %	0 %	0 %	54019992
71	NC_006360	TTCAG	2	10	48586	48595	20 %	40 %	20 %	20 %	54019992
72	NC_006360	CCAAA	2	10	50068	50077	60 %	0 %	0 %	40 %	54020321
73	NC_006360	TGGAT	2	10	51414	51423	20 %	40 %	40 %	0 %	54020321
74	NC_006360	TTAGA	2	10	52520	52529	40 %	40 %	20 %	0 %	54020323
75	NC_006360	ATTCA	2	10	53380	53389	40 %	40 %	0 %	20 %	54020323
76	NC_006360	TTTTA	2	10	54725	54734	20 %	80 %	0 %	0 %	54019993
77	NC_006360	TTATT	2	10	55268	55277	20 %	80 %	0 %	0 %	54019993
78	NC_006360	AAACA	2	10	55408	55417	80 %	0 %	0 %	20 %	54019993
79	NC_006360	TTTCA	2	10	55861	55870	20 %	60 %	0 %	20 %	54019994
80	NC_006360	CAAAA	2	10	56414	56423	80 %	0 %	0 %	20 %	54019994
81	NC_006360	GTTTG	2	10	56451	56460	0 %	60 %	40 %	0 %	54019994
82	NC_006360	TACCC	2	10	58264	58273	20 %	20 %	0 %	60 %	54019996
83	NC_006360	AATTT	2	10	60940	60949	40 %	60 %	0 %	0 %	54020000
84	NC_006360	TAATT	2	10	64666	64675	40 %	60 %	0 %	0 %	54020005
85	NC_006360	TGAAA	2	10	65730	65739	60 %	20 %	20 %	0 %	54020006
86	NC_006360	TAATT	2	10	67494	67503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006360	CAAAA	2	10	67724	67733	80 %	0 %	0 %	20 %	54020008
88	NC_006360	CAAAA	2	10	68117	68126	80 %	0 %	0 %	20 %	54020008
89	NC_006360	AAAAT	2	10	71212	71221	80 %	20 %	0 %	0 %	54020011
90	NC_006360	GAAAT	2	10	71539	71548	60 %	20 %	20 %	0 %	54020011
91	NC_006360	GGGTG	2	10	71781	71790	0 %	20 %	80 %	0 %	54020011
92	NC_006360	TGATA	2	10	75341	75350	40 %	40 %	20 %	0 %	161936260
93	NC_006360	TTATA	2	10	77185	77194	40 %	60 %	0 %	0 %	54020015
94	NC_006360	CATTT	2	10	78553	78562	20 %	60 %	0 %	20 %	54020016
95	NC_006360	ATTTT	2	10	80134	80143	20 %	80 %	0 %	0 %	54020017
96	NC_006360	GAAAA	2	10	81483	81492	80 %	0 %	20 %	0 %	54020017
97	NC_006360	AATTA	2	10	83354	83363	60 %	40 %	0 %	0 %	54020017
98	NC_006360	ACAAA	2	10	83738	83747	80 %	0 %	0 %	20 %	54020017
99	NC_006360	TTGTT	2	10	83841	83850	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006360	ATTTT	2	10	84872	84881	20 %	80 %	0 %	0 %	54020019
101	NC_006360	AATTT	2	10	84936	84945	40 %	60 %	0 %	0 %	54020019
102	NC_006360	GAAAA	2	10	85137	85146	80 %	0 %	20 %	0 %	54020019
103	NC_006360	TTTAT	2	10	85559	85568	20 %	80 %	0 %	0 %	54020019
104	NC_006360	AATAT	2	10	86656	86665	60 %	40 %	0 %	0 %	54020019
105	NC_006360	AAATT	2	10	86780	86789	60 %	40 %	0 %	0 %	54020019
106	NC_006360	AATTA	2	10	87063	87072	60 %	40 %	0 %	0 %	54020325
107	NC_006360	AAATC	2	10	87098	87107	60 %	20 %	0 %	20 %	54020325
108	NC_006360	TAAAA	2	10	88547	88556	80 %	20 %	0 %	0 %	54020020
109	NC_006360	ACTTG	2	10	88686	88695	20 %	40 %	20 %	20 %	54020020
110	NC_006360	TCAAA	2	10	89744	89753	60 %	20 %	0 %	20 %	54020021
111	NC_006360	CAAAA	2	10	90600	90609	80 %	0 %	0 %	20 %	54020021
112	NC_006360	GATTT	2	10	91297	91306	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006360	CAAAA	2	10	91593	91602	80 %	0 %	0 %	20 %	54020022
114	NC_006360	AAAAC	2	10	92676	92685	80 %	0 %	0 %	20 %	54020023
115	NC_006360	GCTTT	2	10	95054	95063	0 %	60 %	20 %	20 %	54020027
116	NC_006360	TATTT	2	10	97091	97100	20 %	80 %	0 %	0 %	54020028
117	NC_006360	AATTA	2	10	97703	97712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006360	ATATT	2	10	98789	98798	40 %	60 %	0 %	0 %	54020327
119	NC_006360	AAAAT	2	10	99004	99013	80 %	20 %	0 %	0 %	54020327
120	NC_006360	AAGTA	2	10	99349	99358	60 %	20 %	20 %	0 %	54020327
121	NC_006360	TTGAT	2	10	100329	100338	20 %	60 %	20 %	0 %	54020328
122	NC_006360	TAACT	2	10	102064	102073	40 %	40 %	0 %	20 %	54020329
123	NC_006360	TTTAT	2	10	102903	102912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006360	CTTTT	2	10	103097	103106	0 %	80 %	0 %	20 %	54020331
125	NC_006360	TAATT	2	10	103224	103233	40 %	60 %	0 %	0 %	54020331
126	NC_006360	TTAAT	2	10	103355	103364	40 %	60 %	0 %	0 %	54020331
127	NC_006360	AAATA	2	10	103539	103548	80 %	20 %	0 %	0 %	54020332
128	NC_006360	CAAAA	2	10	103656	103665	80 %	0 %	0 %	20 %	54020332
129	NC_006360	CAAAA	2	10	103819	103828	80 %	0 %	0 %	20 %	54020332
130	NC_006360	TATAT	2	10	104027	104036	40 %	60 %	0 %	0 %	54020333
131	NC_006360	TTTAA	2	10	104421	104430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006360	ATGAA	2	10	104864	104873	60 %	20 %	20 %	0 %	54020030
133	NC_006360	CAGTT	2	10	105208	105217	20 %	40 %	20 %	20 %	54020030
134	NC_006360	ATTTT	2	10	109247	109256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006360	TAATA	2	10	109375	109384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006360	ATTAT	2	10	110723	110732	40 %	60 %	0 %	0 %	54020037
137	NC_006360	AAAAT	2	10	111269	111278	80 %	20 %	0 %	0 %	54020038
138	NC_006360	AGCAA	2	10	111553	111562	60 %	0 %	20 %	20 %	54020038
139	NC_006360	TAATT	2	10	112757	112766	40 %	60 %	0 %	0 %	54020039
140	NC_006360	ATTCG	2	10	115093	115102	20 %	40 %	20 %	20 %	54020334
141	NC_006360	TTAAA	2	10	115599	115608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_006360	ATTTT	2	10	119595	119604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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