MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei K96243 chromosome 1

Total Repeats: 70947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006350	CTG	2	6	22	27	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717640
2	NC_006350	CGT	2	6	84	89	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717640
3	NC_006350	TCG	2	6	119	124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717640
4	NC_006350	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717640
5	NC_006350	GCG	2	6	156	161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717640
6	NC_006350	GTC	2	6	289	294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717640
7	NC_006350	CAG	2	6	322	327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717640
8	NC_006350	GCG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717640
9	NC_006350	GAC	2	6	466	471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717640
10	NC_006350	CGA	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717640
11	NC_006350	AAC	2	6	671	676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53717640
12	NC_006350	GCC	3	9	823	831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717640
13	NC_006350	TGA	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53717640
14	NC_006350	GAC	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
15	NC_006350	GCA	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
16	NC_006350	CGA	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
17	NC_006350	GAC	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
18	NC_006350	GTC	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
19	NC_006350	CGA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
20	NC_006350	GCG	2	6	1462	1467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717641
21	NC_006350	ACG	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
22	NC_006350	GAT	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53717641
23	NC_006350	AGC	3	9	1597	1605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
24	NC_006350	TCG	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
25	NC_006350	CGA	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
26	NC_006350	TCG	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
27	NC_006350	TCG	2	6	1697	1702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
28	NC_006350	CGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
29	NC_006350	TCG	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
30	NC_006350	TGA	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53717641
31	NC_006350	ATC	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53717641
32	NC_006350	AGC	3	9	2011	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
33	NC_006350	GCG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717641
34	NC_006350	CAG	3	9	2130	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
35	NC_006350	GAG	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53717641
36	NC_006350	GTC	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
37	NC_006350	CGA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
38	NC_006350	CGC	2	6	2279	2284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717641
39	NC_006350	CGG	2	6	2291	2296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717641
40	NC_006350	GCG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
41	NC_006350	GCC	2	6	3241	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
42	NC_006350	GCC	3	9	3331	3339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
43	NC_006350	GCC	3	9	3349	3357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
44	NC_006350	TCG	2	6	3358	3363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
45	NC_006350	CGA	2	6	3374	3379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
46	NC_006350	GCA	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
47	NC_006350	ACG	2	6	3580	3585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
48	NC_006350	CGG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
49	NC_006350	CGG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
50	NC_006350	CAG	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
51	NC_006350	CGA	4	12	3716	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
52	NC_006350	TCG	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
53	NC_006350	CGC	3	9	3782	3790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
54	NC_006350	CGA	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
55	NC_006350	GCG	2	6	3868	3873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
56	NC_006350	GCC	2	6	3885	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
57	NC_006350	CGT	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
58	NC_006350	TCG	2	6	4153	4158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
59	NC_006350	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161723216
60	NC_006350	CGG	2	6	4184	4189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
61	NC_006350	CGC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
62	NC_006350	CGA	2	6	4268	4273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
63	NC_006350	GGC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
64	NC_006350	GGC	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
65	NC_006350	CGA	2	6	4382	4387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
66	NC_006350	TCG	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
67	NC_006350	TCG	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
68	NC_006350	TTC	2	6	4552	4557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161723216
69	NC_006350	GCA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
70	NC_006350	CGT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
71	NC_006350	TCG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
72	NC_006350	GCG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
73	NC_006350	GCC	2	6	4940	4945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
74	NC_006350	GCG	2	6	5033	5038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
75	NC_006350	GAC	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
76	NC_006350	CGC	2	6	5517	5522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717643
77	NC_006350	CTC	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	53717643
78	NC_006350	AAG	2	6	5584	5589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53717643
79	NC_006350	GTC	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
80	NC_006350	TGG	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	53717644
81	NC_006350	CGC	3	9	6052	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717644
82	NC_006350	CGA	2	6	6141	6146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717644
83	NC_006350	TCG	2	6	6149	6154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
84	NC_006350	TCG	2	6	6161	6166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
85	NC_006350	GCC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717644
86	NC_006350	CGC	2	6	6234	6239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717644
87	NC_006350	TGC	2	6	6297	6302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
88	NC_006350	GCA	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717644
89	NC_006350	CTG	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
90	NC_006350	TTG	2	6	6659	6664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53717644
91	NC_006350	CAG	2	6	6700	6705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717644
92	NC_006350	CGA	2	6	6708	6713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717644
93	NC_006350	GTC	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
94	NC_006350	TCG	2	6	6728	6733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
95	NC_006350	CGC	2	6	6736	6741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717644
96	NC_006350	CGT	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
97	NC_006350	CGT	3	9	6852	6860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
98	NC_006350	CGA	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717644
99	NC_006350	GGC	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717644
100	NC_006350	CGA	2	6	6963	6968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717644
101	NC_006350	TCG	2	6	6974	6979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
102	NC_006350	GCA	2	6	6988	6993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717644
103	NC_006350	CGA	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717644
104	NC_006350	AGC	2	6	7145	7150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717644
105	NC_006350	GCA	2	6	7578	7583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717645
106	NC_006350	GCG	2	6	7699	7704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717645
107	NC_006350	GGC	2	6	7714	7719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717645
108	NC_006350	TTG	2	6	7841	7846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53717645
109	NC_006350	TCG	2	6	7928	7933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717645
110	NC_006350	CGG	2	6	7974	7979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717645
111	NC_006350	GCG	2	6	8418	8423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717646
112	NC_006350	TCG	3	9	8438	8446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
113	NC_006350	CGC	2	6	8457	8462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717646
114	NC_006350	ATC	2	6	8554	8559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53717646
115	NC_006350	TCG	2	6	8591	8596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
116	NC_006350	CGC	2	6	8750	8755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717646
117	NC_006350	GGT	2	6	8772	8777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	53717646
118	NC_006350	AAC	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53717646
119	NC_006350	TGC	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
120	NC_006350	AAC	2	6	8851	8856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53717646
121	NC_006350	CAA	2	6	8877	8882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53717646
122	NC_006350	TCG	2	6	8888	8893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
123	NC_006350	ATC	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53717646
124	NC_006350	GCG	2	6	8953	8958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717646
125	NC_006350	CGT	2	6	8973	8978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
126	NC_006350	CGC	2	6	9009	9014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717646
127	NC_006350	GCT	2	6	9027	9032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
128	NC_006350	GCT	3	9	9105	9113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
129	NC_006350	GAA	2	6	9147	9152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53717646
130	NC_006350	GCA	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717646
131	NC_006350	CGT	2	6	9201	9206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
132	NC_006350	GCG	3	9	9269	9277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717646
133	NC_006350	TCG	2	6	9286	9291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
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139	NC_006350	ACG	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717646
140	NC_006350	GGC	3	9	9430	9438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717646
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145	NC_006350	GTC	2	6	9631	9636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717646
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160	NC_006350	ATC	2	6	10387	10392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53717646
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164	NC_006350	GGC	2	6	10537	10542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717646
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246	NC_006350	CGA	2	6	15053	15058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717651
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250	NC_006350	ATC	2	6	15177	15182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53717652
251	NC_006350	GGT	2	6	15470	15475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	53717652
252	NC_006350	CGG	2	6	15532	15537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717653
253	NC_006350	ATG	2	6	15598	15603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53717653
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255	NC_006350	GGC	2	6	15684	15689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717653
256	NC_006350	GGA	2	6	15696	15701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53717653
257	NC_006350	GCG	2	6	15841	15846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717653
258	NC_006350	CGT	2	6	15888	15893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717653
259	NC_006350	CGC	2	6	15905	15910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717653
260	NC_006350	GCG	3	9	15947	15955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717653
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381	NC_006350	TCG	2	6	21921	21926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717658
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495	NC_006350	CGC	2	6	28419	28424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723215
496	NC_006350	TTC	2	6	28439	28444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161723215
497	NC_006350	CTG	2	6	28469	28474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723215
498	NC_006350	GAC	2	6	28478	28483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723215
499	NC_006350	GCA	2	6	28555	28560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723215
500	NC_006350	AGC	2	6	28614	28619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723215

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