MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia succiniciproducens MBEL55E chromosome

Total Repeats: 1433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006300	TTTAT	2	10	8043	8052	20 %	80 %	0 %	0 %	161511015
2	NC_006300	ACGTA	2	10	9456	9465	40 %	20 %	20 %	20 %	52424064
3	NC_006300	TTTGC	2	10	10099	10108	0 %	60 %	20 %	20 %	52424066
4	NC_006300	TTTCA	2	10	13304	13313	20 %	60 %	0 %	20 %	52424069
5	NC_006300	AATGT	2	10	14097	14106	40 %	40 %	20 %	0 %	52424070
6	NC_006300	TCATA	2	10	15218	15227	40 %	40 %	0 %	20 %	52424071
7	NC_006300	CAAAT	2	10	15764	15773	60 %	20 %	0 %	20 %	52424072
8	NC_006300	CCAAT	2	10	15788	15797	40 %	20 %	0 %	40 %	52424072
9	NC_006300	CAATA	2	10	17568	17577	60 %	20 %	0 %	20 %	52424073
10	NC_006300	CCCGC	2	10	22114	22123	0 %	0 %	20 %	80 %	161511014
11	NC_006300	GATGT	2	10	24956	24965	20 %	40 %	40 %	0 %	52424079
12	NC_006300	GCTGA	2	10	25259	25268	20 %	20 %	40 %	20 %	52424080
13	NC_006300	TTTTG	2	10	27110	27119	0 %	80 %	20 %	0 %	52424082
14	NC_006300	CGGAG	2	10	28029	28038	20 %	0 %	60 %	20 %	52424083
15	NC_006300	TATTT	2	10	28469	28478	20 %	80 %	0 %	0 %	52424084
16	NC_006300	TTTAC	2	10	29059	29068	20 %	60 %	0 %	20 %	52424085
17	NC_006300	CCCCG	2	10	30062	30071	0 %	0 %	20 %	80 %	52424086
18	NC_006300	CCAAT	2	10	31401	31410	40 %	20 %	0 %	40 %	52424088
19	NC_006300	AAAAG	2	10	33151	33160	80 %	0 %	20 %	0 %	52424089
20	NC_006300	TCCTA	2	10	34088	34097	20 %	40 %	0 %	40 %	52424091
21	NC_006300	GTACC	2	10	36626	36635	20 %	20 %	20 %	40 %	52424094
22	NC_006300	GCAAC	2	10	38047	38056	40 %	0 %	20 %	40 %	52424094
23	NC_006300	TTGGG	2	10	38478	38487	0 %	40 %	60 %	0 %	52424095
24	NC_006300	ATCCC	2	10	38600	38609	20 %	20 %	0 %	60 %	52424095
25	NC_006300	CAAAT	2	10	38852	38861	60 %	20 %	0 %	20 %	52424096
26	NC_006300	GTTCT	2	10	39187	39196	0 %	60 %	20 %	20 %	52424096
27	NC_006300	TTAAT	2	10	40570	40579	40 %	60 %	0 %	0 %	161511012
28	NC_006300	AAGCC	2	10	47507	47516	40 %	0 %	20 %	40 %	52424105
29	NC_006300	TTAAA	2	10	47915	47924	60 %	40 %	0 %	0 %	52424105
30	NC_006300	CGAAT	2	10	49166	49175	40 %	20 %	20 %	20 %	52424106
31	NC_006300	TTAAA	2	10	49428	49437	60 %	40 %	0 %	0 %	52424107
32	NC_006300	CGTAA	2	10	49659	49668	40 %	20 %	20 %	20 %	52424107
33	NC_006300	TTTTG	2	10	50507	50516	0 %	80 %	20 %	0 %	52424109
34	NC_006300	GGTTA	2	10	51071	51080	20 %	40 %	40 %	0 %	52424109
35	NC_006300	ATTGT	2	10	51919	51928	20 %	60 %	20 %	0 %	52424110
36	NC_006300	TTGCC	2	10	55654	55663	0 %	40 %	20 %	40 %	52424113
37	NC_006300	ATTTG	2	10	56221	56230	20 %	60 %	20 %	0 %	52424113
38	NC_006300	CAAAC	2	10	56788	56797	60 %	0 %	0 %	40 %	52424113
39	NC_006300	AATGA	2	10	58304	58313	60 %	20 %	20 %	0 %	52424114
40	NC_006300	ATTTC	2	10	59495	59504	20 %	60 %	0 %	20 %	52424115
41	NC_006300	TTTTC	2	10	60867	60876	0 %	80 %	0 %	20 %	52424117
42	NC_006300	TGAAT	2	10	69103	69112	40 %	40 %	20 %	0 %	52424123
43	NC_006300	GTAAA	2	10	70050	70059	60 %	20 %	20 %	0 %	52424124
44	NC_006300	TATTG	2	10	71217	71226	20 %	60 %	20 %	0 %	52424126
45	NC_006300	TTGGT	2	10	71312	71321	0 %	60 %	40 %	0 %	52424126
46	NC_006300	TCCAT	2	10	71368	71377	20 %	40 %	0 %	40 %	52424126
47	NC_006300	TTTTA	2	10	71519	71528	20 %	80 %	0 %	0 %	52424126
48	NC_006300	TTATT	2	10	71717	71726	20 %	80 %	0 %	0 %	52424127
49	NC_006300	TTTTC	2	10	72738	72747	0 %	80 %	0 %	20 %	52424127
50	NC_006300	GGATT	2	10	74580	74589	20 %	40 %	40 %	0 %	52424129
51	NC_006300	AAATT	2	10	76665	76674	60 %	40 %	0 %	0 %	52424133
52	NC_006300	CCAAA	2	10	86195	86204	60 %	0 %	0 %	40 %	52424144
53	NC_006300	GCGAC	2	10	97678	97687	20 %	0 %	40 %	40 %	52424158
54	NC_006300	TGGCG	2	10	98560	98569	0 %	20 %	60 %	20 %	52424160
55	NC_006300	TCATT	2	10	101249	101258	20 %	60 %	0 %	20 %	52424165
56	NC_006300	CACAA	2	10	103049	103058	60 %	0 %	0 %	40 %	52424170
57	NC_006300	ATGAG	2	10	106146	106155	40 %	20 %	40 %	0 %	52424175
58	NC_006300	TGATG	2	10	106402	106411	20 %	40 %	40 %	0 %	52424175
59	NC_006300	TGATT	2	10	107188	107197	20 %	60 %	20 %	0 %	52424176
60	NC_006300	TTTTC	2	10	111520	111529	0 %	80 %	0 %	20 %	52424185
61	NC_006300	GAGGT	2	10	111543	111552	20 %	20 %	60 %	0 %	52424185
62	NC_006300	GGCAA	2	10	112754	112763	40 %	0 %	40 %	20 %	52424186
63	NC_006300	TTACC	2	10	112946	112955	20 %	40 %	0 %	40 %	52424186
64	NC_006300	TCAAA	2	10	114035	114044	60 %	20 %	0 %	20 %	52424188
65	NC_006300	TTACG	2	10	115669	115678	20 %	40 %	20 %	20 %	52424189
66	NC_006300	GCTTT	2	10	115930	115939	0 %	60 %	20 %	20 %	52424190
67	NC_006300	TTCGT	2	10	116371	116380	0 %	60 %	20 %	20 %	52424190
68	NC_006300	GTATT	2	10	116626	116635	20 %	60 %	20 %	0 %	52424190
69	NC_006300	GTTCG	2	10	117724	117733	0 %	40 %	40 %	20 %	52424191
70	NC_006300	TTTTG	2	10	120542	120551	0 %	80 %	20 %	0 %	52424192
71	NC_006300	GGTTG	2	10	120783	120792	0 %	40 %	60 %	0 %	52424193
72	NC_006300	TCGCC	2	10	121049	121058	0 %	20 %	20 %	60 %	52424193
73	NC_006300	CCGTT	2	10	121457	121466	0 %	40 %	20 %	40 %	52424194
74	NC_006300	CTTTG	2	10	121921	121930	0 %	60 %	20 %	20 %	52424194
75	NC_006300	GAAAA	2	10	122128	122137	80 %	0 %	20 %	0 %	52424195
76	NC_006300	ACAAA	2	10	123189	123198	80 %	0 %	0 %	20 %	52424195
77	NC_006300	TTTGG	2	10	124246	124255	0 %	60 %	40 %	0 %	52424196
78	NC_006300	TTTGC	2	10	125190	125199	0 %	60 %	20 %	20 %	52424197
79	NC_006300	TTCGG	2	10	129571	129580	0 %	40 %	40 %	20 %	52424204
80	NC_006300	ACGGC	2	10	130326	130335	20 %	0 %	40 %	40 %	52424206
81	NC_006300	TTGCG	2	10	134944	134953	0 %	40 %	40 %	20 %	161511010
82	NC_006300	GTGTT	2	10	138194	138203	0 %	60 %	40 %	0 %	52424217
83	NC_006300	TCGTA	2	10	140101	140110	20 %	40 %	20 %	20 %	52424219
84	NC_006300	ATACG	2	10	141404	141413	40 %	20 %	20 %	20 %	52424220
85	NC_006300	CACAC	2	10	142094	142103	40 %	0 %	0 %	60 %	52424220
86	NC_006300	AGTGA	2	10	142873	142882	40 %	20 %	40 %	0 %	52424221
87	NC_006300	TTGTA	2	10	145200	145209	20 %	60 %	20 %	0 %	52424226
88	NC_006300	CAGGG	2	10	145287	145296	20 %	0 %	60 %	20 %	52424226
89	NC_006300	ATCTT	2	10	145651	145660	20 %	60 %	0 %	20 %	52424227
90	NC_006300	TTAAT	2	10	147884	147893	40 %	60 %	0 %	0 %	52424230
91	NC_006300	GTATT	2	10	148264	148273	20 %	60 %	20 %	0 %	52424230
92	NC_006300	TAATT	2	10	154954	154963	40 %	60 %	0 %	0 %	52424234
93	NC_006300	AATAG	2	10	158168	158177	60 %	20 %	20 %	0 %	52424237
94	NC_006300	ATTTT	2	10	158431	158440	20 %	80 %	0 %	0 %	52424238
95	NC_006300	TGGAC	2	10	159020	159029	20 %	20 %	40 %	20 %	52424238
96	NC_006300	AAATA	2	10	160429	160438	80 %	20 %	0 %	0 %	52424241
97	NC_006300	TCGAA	2	10	160469	160478	40 %	20 %	20 %	20 %	52424241
98	NC_006300	TACGG	2	10	161811	161820	20 %	20 %	40 %	20 %	52424244
99	NC_006300	TCATA	2	10	163098	163107	40 %	40 %	0 %	20 %	52424244
100	NC_006300	ATTTA	2	10	164404	164413	40 %	60 %	0 %	0 %	52424246
101	NC_006300	GGTGC	2	10	164796	164805	0 %	20 %	60 %	20 %	52424247
102	NC_006300	TTTAC	2	10	166860	166869	20 %	60 %	0 %	20 %	52424250
103	NC_006300	TTTGG	2	10	167348	167357	0 %	60 %	40 %	0 %	52424250
104	NC_006300	TTGAT	2	10	168847	168856	20 %	60 %	20 %	0 %	52424250
105	NC_006300	CAAAA	2	10	169201	169210	80 %	0 %	0 %	20 %	52424250
106	NC_006300	GTTCA	2	10	169919	169928	20 %	40 %	20 %	20 %	52424251
107	NC_006300	TACGG	2	10	170921	170930	20 %	20 %	40 %	20 %	52424251
108	NC_006300	ATTTA	2	10	173842	173851	40 %	60 %	0 %	0 %	52424254
109	NC_006300	ATTTT	2	10	173886	173895	20 %	80 %	0 %	0 %	52424255
110	NC_006300	TAAAT	2	10	177036	177045	60 %	40 %	0 %	0 %	52424257
111	NC_006300	ATTTT	2	10	177471	177480	20 %	80 %	0 %	0 %	52424257
112	NC_006300	TTTTG	2	10	178559	178568	0 %	80 %	20 %	0 %	52424258
113	NC_006300	TACCG	2	10	188589	188598	20 %	20 %	20 %	40 %	52424268
114	NC_006300	GTGCG	2	10	192344	192353	0 %	20 %	60 %	20 %	52424271
115	NC_006300	TTCCG	2	10	192725	192734	0 %	40 %	20 %	40 %	52424271
116	NC_006300	GCTTT	2	10	193940	193949	0 %	60 %	20 %	20 %	52424271
117	NC_006300	TTTGG	2	10	194872	194881	0 %	60 %	40 %	0 %	52424271
118	NC_006300	GCGGG	2	10	196649	196658	0 %	0 %	80 %	20 %	52424274
119	NC_006300	TACGG	2	10	199225	199234	20 %	20 %	40 %	20 %	52424277
120	NC_006300	CAAGC	2	10	202581	202590	40 %	0 %	20 %	40 %	52424280
121	NC_006300	GCTAT	2	10	205202	205211	20 %	40 %	20 %	20 %	52424282
122	NC_006300	GTACA	2	10	206804	206813	40 %	20 %	20 %	20 %	52424282
123	NC_006300	ATATT	2	10	207198	207207	40 %	60 %	0 %	0 %	52424283
124	NC_006300	GATTT	2	10	208454	208463	20 %	60 %	20 %	0 %	52424284
125	NC_006300	CATCA	2	10	209410	209419	40 %	20 %	0 %	40 %	52424285
126	NC_006300	CTTTT	2	10	209432	209441	0 %	80 %	0 %	20 %	52424285
127	NC_006300	GAAGT	2	10	211022	211031	40 %	20 %	40 %	0 %	52424288
128	NC_006300	CTCAA	2	10	211790	211799	40 %	20 %	0 %	40 %	52424290
129	NC_006300	GGAAT	2	10	212052	212061	40 %	20 %	40 %	0 %	52424290
130	NC_006300	GCTTT	2	10	214162	214171	0 %	60 %	20 %	20 %	52424292
131	NC_006300	CCGTT	2	10	215119	215128	0 %	40 %	20 %	40 %	52424293
132	NC_006300	CAAAA	2	10	217028	217037	80 %	0 %	0 %	20 %	52424295
133	NC_006300	GCTAT	2	10	218287	218296	20 %	40 %	20 %	20 %	52424296
134	NC_006300	GTTAT	2	10	219830	219839	20 %	60 %	20 %	0 %	52424296
135	NC_006300	TATTC	2	10	220386	220395	20 %	60 %	0 %	20 %	52424297
136	NC_006300	ATAAA	2	10	220720	220729	80 %	20 %	0 %	0 %	52424298
137	NC_006300	AGCCC	2	10	221802	221811	20 %	0 %	20 %	60 %	52424298
138	NC_006300	ACCTT	2	10	223223	223232	20 %	40 %	0 %	40 %	52424300
139	NC_006300	TTTTC	2	10	223992	224001	0 %	80 %	0 %	20 %	52424300
140	NC_006300	TTTCA	2	10	224705	224714	20 %	60 %	0 %	20 %	52424301
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151	NC_006300	ATTTT	2	10	243230	243239	20 %	80 %	0 %	0 %	52424320
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154	NC_006300	TTTTA	2	10	247744	247753	20 %	80 %	0 %	0 %	52424327
155	NC_006300	TTTTA	2	10	250473	250482	20 %	80 %	0 %	0 %	52424330
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157	NC_006300	TTTAA	2	10	253199	253208	40 %	60 %	0 %	0 %	52424332
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159	NC_006300	GTTTA	2	10	254062	254071	20 %	60 %	20 %	0 %	52424332
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172	NC_006300	TTTAT	2	10	272453	272462	20 %	80 %	0 %	0 %	52424345
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179	NC_006300	ATTAA	2	10	288990	288999	60 %	40 %	0 %	0 %	52424363
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181	NC_006300	AAGCA	2	10	291166	291175	60 %	0 %	20 %	20 %	52424364
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253	NC_006300	TTCCT	2	10	394643	394652	0 %	60 %	0 %	40 %	52424483
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265	NC_006300	TATAA	2	10	413585	413594	60 %	40 %	0 %	0 %	52424500
266	NC_006300	TGTTT	2	10	413897	413906	0 %	80 %	20 %	0 %	52424500
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