MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haemophilus somnus 129PT plasmid pHS129

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006298	CACT	2	8	372	379	25 %	25 %	0 %	50 %	52421263
2	NC_006298	TTGC	2	8	492	499	0 %	50 %	25 %	25 %	52421263
3	NC_006298	CGAT	2	8	606	613	25 %	25 %	25 %	25 %	52421264
4	NC_006298	AAAT	2	8	1176	1183	75 %	25 %	0 %	0 %	52421264
5	NC_006298	GAAA	2	8	1209	1216	75 %	0 %	25 %	0 %	52421264
6	NC_006298	AGAA	8	32	1720	1751	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006298	TTGC	2	8	2339	2346	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006298	ATTT	2	8	2680	2687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006298	ATTT	2	8	3016	3023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006298	TTTC	8	32	3072	3103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006298	GCAA	2	8	3513	3520	50 %	0 %	25 %	25 %	52421265
12	NC_006298	AAAT	2	8	3824	3831	75 %	25 %	0 %	0 %	52421265
13	NC_006298	ATCG	2	8	4225	4232	25 %	25 %	25 %	25 %	52421265
14	NC_006298	ATGA	2	8	4366	4373	50 %	25 %	25 %	0 %	52421266
15	NC_006298	AATT	2	8	4536	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	52421266
16	NC_006298	TTAT	2	8	4630	4637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006298	ATGA	2	8	4664	4671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006298	GATA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	25 %	0 %	52421267
19	NC_006298	AACG	2	8	4949	4956	50 %	0 %	25 %	25 %	52421267

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.