MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haemophilus somnus 129PT plasmid pHS129

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006298	GTT	2	6	2	7	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006298	TAT	2	6	175	180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006298	TCC	2	6	237	242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_006298	TCC	2	6	332	337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_006298	TCA	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421263
6	NC_006298	CCG	2	6	346	351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52421263
7	NC_006298	CTC	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	52421263
8	NC_006298	AAC	2	6	536	541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52421263
9	NC_006298	TGA	2	6	614	619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52421264
10	NC_006298	AAC	2	6	777	782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52421264
11	NC_006298	ATC	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421264
12	NC_006298	TCA	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421264
13	NC_006298	GTT	2	6	1270	1275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52421264
14	NC_006298	AAT	2	6	1293	1298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421264
15	NC_006298	TAT	2	6	1421	1426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52421264
16	NC_006298	TAA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421264
17	NC_006298	TTC	2	6	1876	1881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006298	TAC	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006298	AAT	2	6	2016	2021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006298	CTT	2	6	2211	2216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006298	GCT	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006298	CAG	3	9	2309	2317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006298	GGA	2	6	2384	2389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006298	CAA	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006298	TCA	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006298	GTA	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006298	TAT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006298	TAT	2	6	2811	2816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006298	GGT	2	6	3147	3152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006298	GGT	2	6	3169	3174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006298	GGT	2	6	3191	3196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006298	GGT	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006298	GGT	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006298	AAC	2	6	3376	3381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52421265
35	NC_006298	TGA	3	9	3554	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52421265
36	NC_006298	ATT	2	6	3698	3703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52421265
37	NC_006298	ATT	2	6	3761	3766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52421265
38	NC_006298	GTT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52421265
39	NC_006298	ATC	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52421265
40	NC_006298	GGA	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52421266
41	NC_006298	TAA	2	6	4485	4490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421266
42	NC_006298	CTC	2	6	4651	4656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_006298	TGA	3	9	4669	4677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006298	AAT	2	6	4723	4728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006298	ATG	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52421267
46	NC_006298	GCT	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52421267
47	NC_006298	TAA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52421267

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.