MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus E33L chromosome

Total Repeats: 366

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006274	CTATTA	2	12	1855	1866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006274	TTTCGT	2	12	10907	10918	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_006274	TTTCGT	2	12	30705	30716	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_006274	TTTAAA	2	12	41443	41454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006274	CTTTTT	2	12	74472	74483	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_006274	TTATAT	2	12	82135	82146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006274	TATATT	2	12	82230	82241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006274	AGTCAA	2	12	87392	87403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_006274	TAAACA	2	12	133300	133311	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006274	AAATAC	2	12	163591	163602	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006274	GTATGT	2	12	177104	177115	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006274	GTATGT	2	12	182944	182955	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006274	AAATTG	2	12	191582	191593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006274	AAAATA	2	12	212011	212022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006274	AAGGGG	2	12	212095	212106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006274	AGAGGT	2	12	217065	217076	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006274	TTTCAT	2	12	231359	231370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_006274	ATAAAA	2	12	244260	244271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006274	TTATAT	2	12	285159	285170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006274	AGTAAT	2	12	308708	308719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006274	TATATT	2	12	333126	333137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006274	AAACAA	2	12	333309	333320	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_006274	TATAAA	2	12	339926	339937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006274	AATAGA	2	12	357518	357529	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006274	ATTTGA	2	12	359044	359055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006274	AATGAT	2	12	379660	379671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006274	TTTATA	2	12	422527	422538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006274	AAAAAT	2	12	430440	430451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006274	ATTTTT	2	12	455213	455224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006274	CCAATT	2	12	461049	461060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006274	GGAAGA	2	12	473652	473663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006274	TTTTCT	2	12	477104	477115	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_006274	GAAAAT	2	12	493048	493059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006274	GAAGTT	2	12	495460	495471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006274	TAAAAA	2	12	528167	528178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006274	ATCATT	2	12	534310	534321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_006274	TTTTTG	2	12	559365	559376	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006274	TGTATA	2	12	591500	591511	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006274	TAGAAA	2	12	682788	682799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006274	TATTAA	2	12	684247	684258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006274	ACTTAA	2	12	704186	704197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_006274	TTTTTA	2	12	714283	714294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006274	AGTTTA	2	12	723679	723690	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006274	TTAAAA	2	12	724053	724064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006274	ATCAAT	2	12	771031	771042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_006274	GTATAT	2	12	776877	776888	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006274	ACATTT	2	12	782848	782859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_006274	ATAAGT	2	12	782922	782933	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006274	ATGTAA	2	12	799239	799250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006274	TTAAAG	2	12	816346	816357	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006274	TTGTAA	2	12	824696	824707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006274	ACAAAT	2	12	828112	828123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006274	AAATGT	2	12	854141	854152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006274	GTTTTT	2	12	859745	859756	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006274	TCATAT	2	12	877903	877914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_006274	GTATAT	2	12	881315	881326	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006274	AAGTAG	2	12	897699	897710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006274	TGTACA	2	12	907177	907188	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_006274	AATTAA	2	12	945682	945693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006274	TAATTA	2	12	973960	973971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006274	CTTTTT	2	12	1000662	1000673	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_006274	ATCTAT	2	12	1003780	1003791	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_006274	TACTTT	2	12	1019282	1019293	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_006274	GAAATA	2	12	1040688	1040699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006274	CTTTTT	2	12	1043695	1043706	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_006274	TCTTTT	2	12	1047291	1047302	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_006274	TCAAAC	2	12	1052015	1052026	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006274	TGATTC	2	12	1076826	1076837	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_006274	TATGAT	2	12	1080448	1080459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006274	AAAATA	2	12	1083412	1083423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006274	CCTTTT	2	12	1103246	1103257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006274	TAATAT	2	12	1109839	1109850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006274	TCCATT	2	12	1111133	1111144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006274	AATAAA	2	12	1119536	1119547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006274	AAATTG	2	12	1134212	1134223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006274	TTTATT	2	12	1140191	1140202	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006274	TGAAGT	2	12	1141199	1141210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006274	AATATG	2	12	1141338	1141349	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006274	ATTTTT	2	12	1141592	1141603	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006274	TTTTCT	2	12	1173270	1173281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_006274	TCCAGC	2	12	1182735	1182746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006274	AATATA	2	12	1192469	1192480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006274	CTTTTC	2	12	1203934	1203945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006274	AAGTAT	2	12	1221547	1221558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006274	TACGGA	2	12	1262325	1262336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_006274	GTCTAC	2	12	1263320	1263331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006274	GGAGAG	2	12	1271659	1271670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006274	AAATAA	2	12	1274064	1274075	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006274	AAAATT	2	12	1279933	1279944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006274	CAAAAA	2	12	1308156	1308167	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_006274	AATGAT	2	12	1322427	1322438	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006274	GGATAA	2	12	1327919	1327930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006274	AAGAAA	2	12	1332698	1332709	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006274	AATGAA	2	12	1338865	1338876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006274	AAAAGT	2	12	1339848	1339859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006274	TTTACT	2	12	1347781	1347792	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_006274	TCAATT	2	12	1359340	1359351	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_006274	GAAAGG	2	12	1383171	1383182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006274	CCGGAA	2	12	1392057	1392068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006274	ATACAA	2	12	1397370	1397381	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_006274	GTTTTT	2	12	1418932	1418943	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006274	ATTTCT	2	12	1423958	1423969	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_006274	TTATCA	2	12	1434226	1434237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_006274	GAAGGA	2	12	1445625	1445636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006274	TTTTAT	2	12	1479026	1479037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006274	TTTTTA	2	12	1545030	1545041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006274	CTTTTT	2	12	1547805	1547816	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_006274	ATTTTT	2	12	1577460	1577471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006274	TTTCTA	2	12	1620353	1620364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_006274	TATAAC	2	12	1634219	1634230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_006274	CAGTGA	2	12	1637020	1637031	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_006274	TTTATT	2	12	1656476	1656487	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006274	AATCAT	2	12	1667081	1667092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_006274	TGTTTT	2	12	1716297	1716308	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006274	GGTGTT	2	12	1779041	1779052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006274	AAAAAG	2	12	1787641	1787652	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006274	TATTCT	2	12	1789035	1789046	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_006274	AGATAT	2	12	1811440	1811451	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006274	AAGGAA	2	12	1842029	1842040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006274	CTTAAA	2	12	1843908	1843919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_006274	AAGTTA	2	12	1854470	1854481	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006274	ATATTT	2	12	1860385	1860396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006274	ATAAAT	2	12	1867610	1867621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006274	TAACAA	2	12	1870004	1870015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_006274	TTTTTA	2	12	1892436	1892447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006274	GAAAGA	2	12	1913355	1913366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006274	ATGTAA	2	12	1934021	1934032	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006274	TATGAA	2	12	1937874	1937885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006274	TAAAAA	2	12	1944183	1944194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006274	TTTGTA	2	12	1946984	1946995	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006274	TATAAT	2	12	1949299	1949310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006274	TTTTTG	2	12	1961591	1961602	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_006274	CTTTTT	2	12	2022047	2022058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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253	NC_006274	TTTACA	2	12	3327923	3327934	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_006274	TTACTT	2	12	3341496	3341507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_006274	TCAAGT	2	12	3359567	3359578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_006274	AAAATT	2	12	3369614	3369625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_006274	ATTCTC	2	12	3373159	3373170	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_006274	TCAATT	2	12	3373190	3373201	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_006274	GTTAAA	2	12	3409027	3409038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
260	NC_006274	ACCATC	2	12	3419453	3419464	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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262	NC_006274	TAAAAA	2	12	3483539	3483550	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_006274	TAAATT	2	12	3862210	3862221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_006274	TCATTC	2	12	3871133	3871144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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366	NC_006274	TACCTC	2	12	5290838	5290849	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.