MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus licheniformis ATCC 14580 chromosome

Total Repeats: 1237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006270	CTTCAT	2	12	15607	15618	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	163119171
2	NC_006270	CGGTGT	2	12	17021	17032	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	52078500
3	NC_006270	ACAGTC	2	12	18673	18684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078501
4	NC_006270	AAGGTG	2	12	31995	32006	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	163119173
5	NC_006270	TTTGTT	2	12	34169	34180	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	52078518
6	NC_006270	ACATCA	2	12	39947	39958	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	163119175
7	NC_006270	TATTGA	2	12	41860	41871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	52078521
8	NC_006270	CGGAAT	2	12	43338	43349	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078522
9	NC_006270	CAAGAC	2	12	44361	44372	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	52078524
10	NC_006270	TTTTTC	2	12	48812	48823	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	163119177
11	NC_006270	GAACAG	2	12	49046	49057	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	163119177
12	NC_006270	AGGAAA	2	12	53507	53518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163119178
13	NC_006270	TAAAGA	2	12	53676	53687	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	163119178
14	NC_006270	GAGCGG	2	12	58892	58903	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	163119180
15	NC_006270	GCCGGA	2	12	69909	69920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	52078552
16	NC_006270	CGATGA	2	12	70702	70713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078552
17	NC_006270	GATTGT	2	12	74086	74097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	52078557
18	NC_006270	AAGTTA	2	12	74566	74577	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	52078558
19	NC_006270	TCGATG	2	12	77493	77504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078559
20	NC_006270	AAAGAT	2	12	86097	86108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	163119182
21	NC_006270	TTGAGC	2	12	89877	89888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078571
22	NC_006270	GTTGCA	2	12	104094	104105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078581
23	NC_006270	GACAAA	2	12	106441	106452	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	52078583
24	NC_006270	CAGATG	2	12	109545	109556	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078586
25	NC_006270	CTTGAT	2	12	110990	111001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	52078587
26	NC_006270	AGGAAC	2	12	113634	113645	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52078589
27	NC_006270	CGCTTG	2	12	114796	114807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078591
28	NC_006270	CATTTA	2	12	117745	117756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	52078596
29	NC_006270	AGAAGC	2	12	118333	118344	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52078597
30	NC_006270	TTTGAT	2	12	118403	118414	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	52078597
31	NC_006270	TCTTGC	2	12	119485	119496	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161760692
32	NC_006270	CTGTAG	2	12	119696	119707	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161760691
33	NC_006270	ATCACA	2	12	129946	129957	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	52078606
34	NC_006270	TGCCGT	2	12	130068	130079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078606
35	NC_006270	ACAAAG	2	12	130373	130384	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	52078606
36	NC_006270	AAAGGT	2	12	134165	134176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	52078609
37	NC_006270	GTCGGT	2	12	140783	140794	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161760690
38	NC_006270	CAAAGG	2	12	140986	140997	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	161760690
39	NC_006270	CGGCTG	2	12	141295	141306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163119190
40	NC_006270	GAAATC	2	12	144660	144671	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	52078631
41	NC_006270	GAAAAG	2	12	146007	146018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52078634
42	NC_006270	AAACAA	2	12	146048	146059	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	52078634
43	NC_006270	AAAAAG	2	12	147774	147785	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	52078637
44	NC_006270	TGCAGA	2	12	148275	148286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078638
45	NC_006270	ATGGAA	2	12	150979	150990	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	52078641
46	NC_006270	CGGCTT	2	12	169317	169328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078658
47	NC_006270	TGCTTC	2	12	170950	170961	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	52078658
48	NC_006270	GGGGCG	2	12	179951	179962	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	163119194
49	NC_006270	GCGATG	2	12	184192	184203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52078670
50	NC_006270	GAAATG	2	12	184957	184968	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	52078670
51	NC_006270	CAACCC	2	12	186569	186580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52078672
52	NC_006270	GGCGAT	2	12	190674	190685	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52078678
53	NC_006270	AGGATC	2	12	194577	194588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078682
54	NC_006270	TCCGTC	2	12	199825	199836	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	52078686
55	NC_006270	GAATCC	2	12	200041	200052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078686
56	NC_006270	TTGTTT	2	12	201157	201168	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	52078687
57	NC_006270	GCAGCG	2	12	221003	221014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	163119201
58	NC_006270	GGGATT	2	12	226432	226443	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	52078707
59	NC_006270	GGTTTT	2	12	226632	226643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52078708
60	NC_006270	AAAACT	2	12	237546	237557	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	52078718
61	NC_006270	CAATGC	2	12	237832	237843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078719
62	NC_006270	ATTCGG	2	12	238654	238665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078719
63	NC_006270	TTGGGC	2	12	241616	241627	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	52078722
64	NC_006270	GGAAGA	2	12	242863	242874	50 %	0 %	50 %	0 %	52078723
65	NC_006270	GGCTGC	2	12	246410	246421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52078727
66	NC_006270	GATGCC	2	12	247376	247387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52078728
67	NC_006270	CGGATA	2	12	256908	256919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078735
68	NC_006270	AGAAAG	2	12	262256	262267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52078740
69	NC_006270	TCGGCG	2	12	262512	262523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52078741
70	NC_006270	AAGCTG	2	12	268980	268991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078747
71	NC_006270	TTTGTC	2	12	270859	270870	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	52078749
72	NC_006270	TTCGGC	2	12	277940	277951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078755
73	NC_006270	TATACA	2	12	293547	293558	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	52078773
74	NC_006270	ACGATG	2	12	295907	295918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078775
75	NC_006270	CTGCGG	2	12	299437	299448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163119209
76	NC_006270	CGTAAT	2	12	317202	317213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	52078792
77	NC_006270	AAAGAA	2	12	324304	324315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	52078799
78	NC_006270	CTTTTT	2	12	328000	328011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	52078803
79	NC_006270	TGAATT	2	12	329002	329013	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	52078803
80	NC_006270	AACAAA	2	12	331940	331951	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	52078807
81	NC_006270	AACGAA	2	12	332597	332608	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	52078808
82	NC_006270	GTTTTT	2	12	339535	339546	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	52078814
83	NC_006270	AAATCA	2	12	341892	341903	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	52078816
84	NC_006270	GCGCTG	2	12	344247	344258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52078818
85	NC_006270	CGATTG	2	12	344959	344970	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078818
86	NC_006270	CTTTTG	2	12	347651	347662	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	52078821
87	NC_006270	TATCGA	2	12	348389	348400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	52078822
88	NC_006270	TTGACC	2	12	350546	350557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	52078824
89	NC_006270	GCGGAT	2	12	351561	351572	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52078825
90	NC_006270	TGTTTG	2	12	354215	354226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163119213
91	NC_006270	CCGCAT	2	12	356383	356394	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	52078828
92	NC_006270	CATCGA	2	12	361147	361158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078835
93	NC_006270	CAGATC	2	12	361346	361357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078835
94	NC_006270	ATTGGG	2	12	364683	364694	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	52078838
95	NC_006270	AGCCGG	2	12	373593	373604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	52078844
96	NC_006270	CGGCTT	2	12	387078	387089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078849
97	NC_006270	CGGAAA	2	12	389366	389377	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52078849
98	NC_006270	GCGCCG	2	12	392771	392782	0 %	0 %	50 %	50 %	52078850
99	NC_006270	GAACAG	2	12	393317	393328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52078850
100	NC_006270	TATTCA	2	12	396166	396177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	52078850
101	NC_006270	CAGCGG	2	12	396702	396713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	52078850
102	NC_006270	CGGCTT	2	12	397846	397857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078850
103	NC_006270	AAAAGC	2	12	411837	411848	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	163119221
104	NC_006270	GAAAAA	2	12	415923	415934	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	52078865
105	NC_006270	CCGGAA	2	12	418036	418047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52078866
106	NC_006270	TCCGGT	2	12	420678	420689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078869
107	NC_006270	ATAAAA	2	12	425085	425096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	52078872
108	NC_006270	ACGAAA	2	12	427132	427143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	52078875
109	NC_006270	GATGAA	2	12	435427	435438	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	52078886
110	NC_006270	TGTCGG	2	12	438266	438277	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	163119227
111	NC_006270	CCGATC	2	12	450366	450377	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	52078896
112	NC_006270	CCGATT	2	12	453321	453332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	52078898
113	NC_006270	TGAAAA	2	12	457412	457423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	52078901
114	NC_006270	CCGGAA	2	12	458816	458827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52078903
115	NC_006270	CTTTGA	2	12	459777	459788	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	52078904
116	NC_006270	AGCACG	2	12	460304	460315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52078904
117	NC_006270	TTCAAA	2	12	461070	461081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	52078905
118	NC_006270	GGGCTG	2	12	462591	462602	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	52078906
119	NC_006270	ATTCGG	2	12	476991	477002	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078920
120	NC_006270	GGCTGG	2	12	477925	477936	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	52078921
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224	NC_006270	GTCGGC	2	12	807905	807916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52079230
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227	NC_006270	GGGAAA	2	12	811152	811163	50 %	0 %	50 %	0 %	52079233
228	NC_006270	GAAGGG	2	12	815600	815611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163119294
229	NC_006270	TGTAGG	2	12	817945	817956	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	163119294
230	NC_006270	GACGGT	2	12	820723	820734	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52079238
231	NC_006270	TGAAAA	2	12	821691	821702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	52079239
232	NC_006270	GCGGTC	2	12	826664	826675	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52079242
233	NC_006270	TCGGCA	2	12	826716	826727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52079242
234	NC_006270	GACCTC	2	12	829847	829858	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	52079244
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329	NC_006270	GATGGC	2	12	1192471	1192482	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52079591
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332	NC_006270	GAGCTG	2	12	1214940	1214951	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52079612
333	NC_006270	TGACTT	2	12	1216211	1216222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	163119347
334	NC_006270	AAGGCG	2	12	1220322	1220333	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	52079618
335	NC_006270	AAAACG	2	12	1221469	1221480	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	52079619
336	NC_006270	CCGTAT	2	12	1228385	1228396	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	52079625
337	NC_006270	TCCGTC	2	12	1230652	1230663	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	52079629
338	NC_006270	TTTAAA	2	12	1236910	1236921	50 %	50 %	0 %	0 %	52079635
339	NC_006270	AGATGG	2	12	1237254	1237265	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	52079635
340	NC_006270	TCACAT	2	12	1238396	1238407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52079636
341	NC_006270	TTTATC	2	12	1242094	1242105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	163119349
342	NC_006270	CTGATC	2	12	1247190	1247201	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	52079643
343	NC_006270	CCTCGG	2	12	1247774	1247785	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	52079643
344	NC_006270	GAAAAA	2	12	1250424	1250435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	52079646
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346	NC_006270	TTTGCC	2	12	1252113	1252124	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	52079648
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446	NC_006270	TCTGAT	2	12	1564712	1564723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	52079988
447	NC_006270	CGATCC	2	12	1566144	1566155	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	52079988
448	NC_006270	CGCTTC	2	12	1567331	1567342	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	163119402
449	NC_006270	GATTGC	2	12	1572013	1572024	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52079994
450	NC_006270	TTTTGC	2	12	1572803	1572814	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	52079995
451	NC_006270	ATCGAT	2	12	1573809	1573820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	52079996
452	NC_006270	GATTTC	2	12	1578713	1578724	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	52079998
453	NC_006270	ATTGGA	2	12	1579275	1579286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52080000
454	NC_006270	TGAGTC	2	12	1581748	1581759	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52080002
455	NC_006270	GCCGGT	2	12	1586347	1586358	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52080007
456	NC_006270	GCAAAG	2	12	1589800	1589811	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52080011
457	NC_006270	ATTGAA	2	12	1595082	1595093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	52080019
458	NC_006270	TCTTTG	2	12	1599072	1599083	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	52080024
459	NC_006270	GATTGC	2	12	1606490	1606501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52080032
460	NC_006270	ACGATC	2	12	1607712	1607723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52080033
461	NC_006270	GCCGTA	2	12	1631424	1631435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52080057
462	NC_006270	GGCTTA	2	12	1634131	1634142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52080060
463	NC_006270	TTGACA	2	12	1634651	1634662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	52080060
464	NC_006270	TATCTT	2	12	1639222	1639233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	163119413
465	NC_006270	ATCGGA	2	12	1648823	1648834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52080078
466	NC_006270	GAAAAA	2	12	1649965	1649976	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	52080078
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469	NC_006270	CGGACT	2	12	1664319	1664330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52080091
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472	NC_006270	AAGCTG	2	12	1686277	1686288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52080118
473	NC_006270	ACAAAA	2	12	1687202	1687213	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	52080118
474	NC_006270	CGCGAT	2	12	1691176	1691187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52080120
475	NC_006270	TTTGAT	2	12	1691660	1691671	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	52080120
476	NC_006270	CAAAAT	2	12	1692837	1692848	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	52080122
477	NC_006270	TCGGCC	3	18	1694951	1694968	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	52080123
478	NC_006270	AAATCA	2	12	1699788	1699799	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	163119419
479	NC_006270	TCGATC	2	12	1707894	1707905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	52080133
480	NC_006270	GCAAAA	2	12	1709144	1709155	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	52080133
481	NC_006270	TGTTTA	2	12	1709576	1709587	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	52080134
482	NC_006270	CATCAG	2	12	1710178	1710189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52080134
483	NC_006270	CGATAT	2	12	1714298	1714309	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163119421
484	NC_006270	GAATAC	2	12	1716268	1716279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	52080141
485	NC_006270	GAACCG	2	12	1722973	1722984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52080148
486	NC_006270	TCGGAA	2	12	1725327	1725338	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52080150
487	NC_006270	CGGCGT	2	12	1727422	1727433	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52080152
488	NC_006270	TAAACA	2	12	1729200	1729211	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	52080153
489	NC_006270	GATAAA	2	12	1732161	1732172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	52080154
490	NC_006270	TTCTTT	2	12	1742687	1742698	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	52080167
491	NC_006270	ACGGCG	2	12	1745442	1745453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	52080168
492	NC_006270	CTGCCG	2	12	1745889	1745900	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	52080168
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499	NC_006270	ACGGAA	2	12	1765797	1765808	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52080190
500	NC_006270	GATAAA	2	12	1768379	1768390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	52080191

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