MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 chromosome

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006177	TGAGGC	2	12	19126	19137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006177	AAGCGA	2	12	23604	23615	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_006177	ATTCTC	2	12	132581	132592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006177	GTGATC	2	12	137508	137519	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006177	GTGCTG	2	12	221215	221226	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_006177	TGCAGG	2	12	227486	227497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006177	GCGCAG	2	12	228872	228883	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006177	CCCCAC	2	12	281107	281118	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
9	NC_006177	AAGCGA	2	12	290693	290704	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006177	AAGCGA	2	12	297154	297165	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006177	CTTCGG	2	12	307200	307211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006177	TGATGT	2	12	325916	325927	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006177	GGGTAG	2	12	355474	355485	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006177	GTTGCG	2	12	383752	383763	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_006177	GGGCGG	2	12	384445	384456	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006177	TGCCGG	2	12	387436	387447	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006177	CCGGCG	2	12	469538	469549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006177	CGAAGA	2	12	527096	527107	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006177	AGCCTA	2	12	527389	527400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006177	CGTTGT	2	12	528002	528013	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_006177	TGCGGC	2	12	565301	565312	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006177	GGTGTT	2	12	596674	596685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006177	GCCGTC	2	12	636800	636811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006177	CCGGGC	2	12	691108	691119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006177	CTGGTG	2	12	705537	705548	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_006177	GCAGGT	2	12	725530	725541	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_006177	AGCGTG	2	12	741061	741072	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_006177	CACGGG	2	12	787508	787519	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006177	AAGCGA	2	12	845343	845354	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_006177	GCAGCG	2	12	860904	860915	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006177	CATCCG	2	12	871454	871465	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006177	GGGGAG	2	12	899756	899767	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006177	CCTGGC	2	12	924430	924441	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006177	GAAGCT	2	12	978145	978156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_006177	CCGGGT	2	12	1023511	1023522	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006177	GTTCCC	2	12	1059773	1059784	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006177	GTTCCC	2	12	1059889	1059900	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006177	GTTCCC	2	12	1060005	1060016	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006177	GGCTGG	2	12	1060278	1060289	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_006177	GACGGG	2	12	1099280	1099291	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_006177	AAATCT	2	12	1133072	1133083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_006177	CGGCAG	2	12	1162884	1162895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006177	CGAGCC	2	12	1188056	1188067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_006177	GCCCGG	2	12	1270827	1270838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006177	GGGTGG	2	12	1273095	1273106	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006177	AGGCTG	2	12	1275071	1275082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_006177	CCGGGC	2	12	1289811	1289822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006177	GCGCGT	2	12	1308881	1308892	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006177	GGAGGG	2	12	1313473	1313484	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006177	TTGCCG	2	12	1338949	1338960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006177	GTTCTT	2	12	1339250	1339261	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_006177	CAGGAG	2	12	1365297	1365308	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006177	CCCGGC	2	12	1389369	1389380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_006177	CGGCCT	2	12	1401283	1401294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006177	TTCCGG	2	12	1406492	1406503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006177	TTCTCA	2	12	1453414	1453425	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006177	GATCAG	2	12	1464496	1464507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006177	AGGCCC	2	12	1473707	1473718	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006177	GTGCAC	2	12	1542566	1542577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006177	CTTTCC	2	12	1546586	1546597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_006177	GCCCGC	2	12	1613618	1613629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_006177	ACGGTG	2	12	1691098	1691109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_006177	GGGCGA	2	12	1693672	1693683	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_006177	CGGGCG	2	12	1693979	1693990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006177	TGATAA	2	12	1740777	1740788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006177	GGGCCA	2	12	1754838	1754849	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006177	TCTGTG	2	12	1805554	1805565	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_006177	GCGCTC	2	12	1877564	1877575	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006177	CAGCGG	2	12	1897476	1897487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006177	GAGCGG	2	12	1909345	1909356	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_006177	GTACCA	2	12	1956827	1956838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006177	TCGCTG	2	12	1961030	1961041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006177	TCTCTG	2	12	1980784	1980795	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006177	CCTGTC	2	12	2010737	2010748	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006177	CGCCGG	2	12	2136402	2136413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006177	GCCTCC	2	12	2151332	2151343	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_006177	CGGTGC	2	12	2162404	2162415	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006177	GGCGCG	2	12	2180940	2180951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006177	GGGCGC	2	12	2203701	2203712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006177	GCCTGC	2	12	2241504	2241515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006177	CCGCAC	2	12	2249548	2249559	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_006177	CCCGTC	2	12	2252890	2252901	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_006177	CGGCAC	2	12	2257428	2257439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_006177	GTACTC	2	12	2263048	2263059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006177	CGCGGC	2	12	2268155	2268166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006177	CCGGGG	2	12	2294205	2294216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006177	GGTCCG	2	12	2299275	2299286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006177	GACGAA	2	12	2362782	2362793	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_006177	CTGGGC	2	12	2362799	2362810	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006177	TCCAAC	2	12	2404380	2404391	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_006177	TCCCGC	2	12	2422600	2422611	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_006177	GAGATG	2	12	2445584	2445595	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006177	CCACTG	2	12	2467269	2467280	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_006177	CGTCAC	2	12	2468281	2468292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_006177	CGGGCG	2	12	2511926	2511937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006177	CCCGGG	2	12	2512254	2512265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006177	CCGACC	2	12	2512350	2512361	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_006177	TTCCAT	2	12	2533332	2533343	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006177	CGGTCC	2	12	2541266	2541277	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_006177	TTGCCC	2	12	2541312	2541323	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_006177	CGGTCC	2	12	2541564	2541575	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006177	TTGCCC	2	12	2541610	2541621	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_006177	CGGTCC	2	12	2541713	2541724	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_006177	TTGCCC	2	12	2541759	2541770	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006177	GTTCGG	2	12	2552852	2552863	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_006177	CCGCCC	2	12	2558731	2558742	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
107	NC_006177	CCCCGC	2	12	2572418	2572429	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
108	NC_006177	CCCCGC	2	12	2572503	2572514	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
109	NC_006177	CCCCGC	2	12	2572674	2572685	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
110	NC_006177	CCGGGG	2	12	2584391	2584402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006177	TACTTT	2	12	2590108	2590119	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_006177	ATGTAA	2	12	2600553	2600564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006177	ACGGCG	2	12	2602593	2602604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006177	CGCCGG	2	12	2604317	2604328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006177	TGCCGC	2	12	2674597	2674608	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_006177	GCCAGC	2	12	2694821	2694832	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_006177	GCATTC	2	12	2732411	2732422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006177	TTCCGG	2	12	2759371	2759382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006177	AACGGC	2	12	2762752	2762763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006177	TCCAGG	2	12	2774624	2774635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006177	ACCGGC	2	12	2815309	2815320	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_006177	ACGCGG	2	12	2857014	2857025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006177	ACTTCA	2	12	2896819	2896830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006177	ATCGTG	2	12	2924744	2924755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_006177	CTGAAC	2	12	2928207	2928218	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006177	TCGCTT	2	12	2953664	2953675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006177	CACGAC	2	12	2956957	2956968	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_006177	GCGCCT	2	12	2978090	2978101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_006177	ACCGCC	2	12	3047582	3047593	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_006177	GACCGG	2	12	3132576	3132587	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006177	GGCGTG	2	12	3132859	3132870	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_006177	GCGCCG	2	12	3173900	3173911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006177	CCGGGC	2	12	3174091	3174102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_006177	CGCGGC	2	12	3174241	3174252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_006177	ACCTGG	2	12	3192528	3192539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006177	GCCTGC	2	12	3263980	3263991	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_006177	GAAAAA	2	12	3288991	3289002	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006177	ACTTGA	2	12	3289728	3289739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_006177	CTCCGG	2	12	3306132	3306143	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_006177	GGTGCG	2	12	3307554	3307565	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_006177	CCCCTC	2	12	3315542	3315553	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
142	NC_006177	CAGGCG	2	12	3317748	3317759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_006177	GCAAGC	2	12	3365386	3365397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_006177	CGGGAA	2	12	3366361	3366372	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_006177	AGCCTG	2	12	3389584	3389595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_006177	GCCATG	2	12	3416707	3416718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_006177	CCGGGC	2	12	3456783	3456794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_006177	TCGCTT	2	12	3467220	3467231	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_006177	GCCTCG	2	12	3556840	3556851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_006177	CCGGCG	2	12	3565775	3565786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.