MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 chromosome

Total Repeats: 2845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006177	CTGCG	2	10	3200	3209	0 %	20 %	40 %	40 %	51891142
2	NC_006177	GCGCG	2	10	9185	9194	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_006177	GTCCC	2	10	9235	9244	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_006177	GGGGC	2	10	9283	9292	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006177	GCCGG	2	10	9658	9667	0 %	0 %	60 %	40 %	51891146
6	NC_006177	GCCGG	2	10	10155	10164	0 %	0 %	60 %	40 %	51891146
7	NC_006177	GGCCG	2	10	10816	10825	0 %	0 %	60 %	40 %	51891147
8	NC_006177	CGGTC	2	10	11885	11894	0 %	20 %	40 %	40 %	51891147
9	NC_006177	GCAGG	2	10	16347	16356	20 %	0 %	60 %	20 %	51891151
10	NC_006177	GCCCT	2	10	20250	20259	0 %	20 %	20 %	60 %	51891154
11	NC_006177	GTGGA	2	10	20490	20499	20 %	20 %	60 %	0 %	51891154
12	NC_006177	CTCTG	2	10	21279	21288	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_006177	TCGTG	2	10	22236	22245	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_006177	AGAGG	2	10	24727	24736	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006177	GCCAG	2	10	30586	30595	20 %	0 %	40 %	40 %	51891157
16	NC_006177	GCGGT	2	10	31176	31185	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_006177	GTGGA	2	10	31638	31647	20 %	20 %	60 %	0 %	51891158
18	NC_006177	TGGGT	2	10	32475	32484	0 %	40 %	60 %	0 %	51891158
19	NC_006177	GACCG	2	10	34168	34177	20 %	0 %	40 %	40 %	51891159
20	NC_006177	ACCGC	2	10	37923	37932	20 %	0 %	20 %	60 %	51891166
21	NC_006177	CGGGG	2	10	38018	38027	0 %	0 %	80 %	20 %	51891166
22	NC_006177	CCCGG	2	10	39779	39788	0 %	0 %	40 %	60 %	51891168
23	NC_006177	CCGGG	2	10	40085	40094	0 %	0 %	60 %	40 %	51891168
24	NC_006177	GGCCG	2	10	42958	42967	0 %	0 %	60 %	40 %	51891171
25	NC_006177	CTGCT	2	10	43747	43756	0 %	40 %	20 %	40 %	51891172
26	NC_006177	GCCGG	2	10	45567	45576	0 %	0 %	60 %	40 %	51891174
27	NC_006177	GGTCC	2	10	45953	45962	0 %	20 %	40 %	40 %	51891174
28	NC_006177	GATGG	2	10	49299	49308	20 %	20 %	60 %	0 %	51891177
29	NC_006177	GACGA	2	10	51744	51753	40 %	0 %	40 %	20 %	51891179
30	NC_006177	GCCCC	2	10	54206	54215	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_006177	GTGCT	2	10	56954	56963	0 %	40 %	40 %	20 %	51891181
32	NC_006177	AAGGC	2	10	57005	57014	40 %	0 %	40 %	20 %	51891181
33	NC_006177	TTCCG	2	10	60629	60638	0 %	40 %	20 %	40 %	51891182
34	NC_006177	CAGTG	2	10	61470	61479	20 %	20 %	40 %	20 %	51891182
35	NC_006177	AGTCA	2	10	69495	69504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_006177	GTTGC	2	10	71283	71292	0 %	40 %	40 %	20 %	51891195
37	NC_006177	AGCCG	2	10	71657	71666	20 %	0 %	40 %	40 %	51891195
38	NC_006177	CACCG	2	10	75592	75601	20 %	0 %	20 %	60 %	51891196
39	NC_006177	CGGCT	2	10	77755	77764	0 %	20 %	40 %	40 %	51891196
40	NC_006177	GTATG	2	10	77985	77994	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006177	GAATG	2	10	78539	78548	40 %	20 %	40 %	0 %	51891197
42	NC_006177	AGATC	2	10	80063	80072	40 %	20 %	20 %	20 %	51891198
43	NC_006177	CGCTG	2	10	80113	80122	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_006177	GTGAG	2	10	81489	81498	20 %	20 %	60 %	0 %	51891199
45	NC_006177	GCCGG	2	10	82726	82735	0 %	0 %	60 %	40 %	51891200
46	NC_006177	CCCTC	2	10	84029	84038	0 %	20 %	0 %	80 %	51891200
47	NC_006177	TGCGC	2	10	84651	84660	0 %	20 %	40 %	40 %	51891200
48	NC_006177	CCGGG	2	10	86809	86818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_006177	GATGC	2	10	87802	87811	20 %	20 %	40 %	20 %	51891205
50	NC_006177	CGGGG	3	15	89086	89100	0 %	0 %	80 %	20 %	51891206
51	NC_006177	GCCGG	2	10	89228	89237	0 %	0 %	60 %	40 %	51891206
52	NC_006177	CCCTG	2	10	89639	89648	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_006177	CCGGT	2	10	89781	89790	0 %	20 %	40 %	40 %	51891207
54	NC_006177	GTCGG	2	10	89910	89919	0 %	20 %	60 %	20 %	51891207
55	NC_006177	GCCCC	2	10	91376	91385	0 %	0 %	20 %	80 %	51891207
56	NC_006177	GCCGG	2	10	92421	92430	0 %	0 %	60 %	40 %	51891208
57	NC_006177	CGGCC	2	10	93434	93443	0 %	0 %	40 %	60 %	51891208
58	NC_006177	GCCCG	2	10	93609	93618	0 %	0 %	40 %	60 %	51891208
59	NC_006177	GGCCA	2	10	94479	94488	20 %	0 %	40 %	40 %	51891208
60	NC_006177	GAGGG	2	10	94995	95004	20 %	0 %	80 %	0 %	51891210
61	NC_006177	GGTGA	2	10	95945	95954	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006177	GACCT	2	10	96013	96022	20 %	20 %	20 %	40 %	51891211
63	NC_006177	CGGGC	2	10	100976	100985	0 %	0 %	60 %	40 %	51891217
64	NC_006177	CCGCA	2	10	104559	104568	20 %	0 %	20 %	60 %	51891221
65	NC_006177	CGCTG	2	10	104891	104900	0 %	20 %	40 %	40 %	51891222
66	NC_006177	CCCCG	2	10	108038	108047	0 %	0 %	20 %	80 %	51891227
67	NC_006177	CCGTG	2	10	110774	110783	0 %	20 %	40 %	40 %	51891229
68	NC_006177	CCGGG	2	10	112150	112159	0 %	0 %	60 %	40 %	51891231
69	NC_006177	GCGGG	2	10	112380	112389	0 %	0 %	80 %	20 %	51891231
70	NC_006177	GCGCC	2	10	113578	113587	0 %	0 %	40 %	60 %	51891232
71	NC_006177	AGGCC	2	10	115025	115034	20 %	0 %	40 %	40 %	51891234
72	NC_006177	GTCTG	2	10	116445	116454	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_006177	GGCGT	2	10	117784	117793	0 %	20 %	60 %	20 %	51891236
74	NC_006177	CGTCC	2	10	119809	119818	0 %	20 %	20 %	60 %	51891238
75	NC_006177	GCCGG	2	10	119819	119828	0 %	0 %	60 %	40 %	51891238
76	NC_006177	CTGGG	2	10	120118	120127	0 %	20 %	60 %	20 %	51891238
77	NC_006177	CGGGA	2	10	122029	122038	20 %	0 %	60 %	20 %	51891240
78	NC_006177	CGGAT	2	10	122408	122417	20 %	20 %	40 %	20 %	51891240
79	NC_006177	CTGCC	2	10	124287	124296	0 %	20 %	20 %	60 %	51891243
80	NC_006177	TCGGC	2	10	125004	125013	0 %	20 %	40 %	40 %	51891244
81	NC_006177	CTCAA	2	10	127640	127649	40 %	20 %	0 %	40 %	51891247
82	NC_006177	CTGGA	2	10	129505	129514	20 %	20 %	40 %	20 %	51891249
83	NC_006177	GGCCT	2	10	130199	130208	0 %	20 %	40 %	40 %	51891250
84	NC_006177	AACGA	2	10	131450	131459	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_006177	AGCGG	2	10	134124	134133	20 %	0 %	60 %	20 %	51891252
86	NC_006177	CCACG	2	10	136489	136498	20 %	0 %	20 %	60 %	51891253
87	NC_006177	CGCGT	2	10	138499	138508	0 %	20 %	40 %	40 %	51891256
88	NC_006177	CGGCG	2	10	140962	140971	0 %	0 %	60 %	40 %	51891259
89	NC_006177	TACCG	2	10	141263	141272	20 %	20 %	20 %	40 %	51891260
90	NC_006177	GAGCG	2	10	142855	142864	20 %	0 %	60 %	20 %	51891262
91	NC_006177	CCCGG	2	10	143840	143849	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_006177	GCGCC	2	10	146561	146570	0 %	0 %	40 %	60 %	51891263
93	NC_006177	GGGCT	2	10	149184	149193	0 %	20 %	60 %	20 %	51891265
94	NC_006177	CCGCC	2	10	154554	154563	0 %	0 %	20 %	80 %	51891269
95	NC_006177	CCCGG	2	10	158157	158166	0 %	0 %	40 %	60 %	51891273
96	NC_006177	AGCGC	2	10	158514	158523	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_006177	GCTCC	2	10	159358	159367	0 %	20 %	20 %	60 %	51891274
98	NC_006177	GCTGC	2	10	159728	159737	0 %	20 %	40 %	40 %	51891275
99	NC_006177	CGGGG	2	10	160426	160435	0 %	0 %	80 %	20 %	51891276
100	NC_006177	GGAAG	2	10	160972	160981	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006177	TAAGA	2	10	166181	166190	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006177	GGTCG	2	10	173413	173422	0 %	20 %	60 %	20 %	51891287
103	NC_006177	GGGCC	2	10	174205	174214	0 %	0 %	60 %	40 %	51891288
104	NC_006177	GGGCC	2	10	174532	174541	0 %	0 %	60 %	40 %	51891288
105	NC_006177	CGGCG	2	10	174955	174964	0 %	0 %	60 %	40 %	51891289
106	NC_006177	GCGCT	2	10	175645	175654	0 %	20 %	40 %	40 %	51891289
107	NC_006177	CCTTC	2	10	177166	177175	0 %	40 %	0 %	60 %	51891290
108	NC_006177	TTCCC	2	10	178739	178748	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_006177	CCTGG	2	10	180297	180306	0 %	20 %	40 %	40 %	51891294
110	NC_006177	GGTGA	2	10	182089	182098	20 %	20 %	60 %	0 %	51891296
111	NC_006177	ACCCG	2	10	182407	182416	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_006177	CCGCC	2	10	183353	183362	0 %	0 %	20 %	80 %	51891297
113	NC_006177	GGGTC	2	10	183939	183948	0 %	20 %	60 %	20 %	51891297
114	NC_006177	GCTGC	2	10	184487	184496	0 %	20 %	40 %	40 %	51891298
115	NC_006177	CCGGT	2	10	185306	185315	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_006177	ACGGC	2	10	186955	186964	20 %	0 %	40 %	40 %	51891300
117	NC_006177	GGCCT	2	10	186999	187008	0 %	20 %	40 %	40 %	51891300
118	NC_006177	GATCG	2	10	189216	189225	20 %	20 %	40 %	20 %	51891301
119	NC_006177	TGGAC	2	10	189902	189911	20 %	20 %	40 %	20 %	51891301
120	NC_006177	CTGAC	2	10	190031	190040	20 %	20 %	20 %	40 %	51891301
121	NC_006177	ACGCC	2	10	196628	196637	20 %	0 %	20 %	60 %	51891306
122	NC_006177	GTCCG	2	10	197047	197056	0 %	20 %	40 %	40 %	51891306
123	NC_006177	CGGCG	2	10	197697	197706	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_006177	CCGCA	2	10	200080	200089	20 %	0 %	20 %	60 %	51891309
125	NC_006177	GGCGG	2	10	200329	200338	0 %	0 %	80 %	20 %	51891309
126	NC_006177	CGGCG	2	10	201300	201309	0 %	0 %	60 %	40 %	51891310
127	NC_006177	CACGA	2	10	201661	201670	40 %	0 %	20 %	40 %	51891310
128	NC_006177	CCGGC	2	10	201900	201909	0 %	0 %	40 %	60 %	51891311
129	NC_006177	GGAAG	2	10	204402	204411	40 %	0 %	60 %	0 %	51891314
130	NC_006177	CCACT	2	10	207128	207137	20 %	20 %	0 %	60 %	51891318
131	NC_006177	GCCGT	2	10	207330	207339	0 %	20 %	40 %	40 %	51891318
132	NC_006177	CGGGC	2	10	210492	210501	0 %	0 %	60 %	40 %	51891323
133	NC_006177	GCCGC	2	10	210528	210537	0 %	0 %	40 %	60 %	51891323
134	NC_006177	GGCGC	2	10	210926	210935	0 %	0 %	60 %	40 %	51891323
135	NC_006177	CGGTG	2	10	211676	211685	0 %	20 %	60 %	20 %	51891324
136	NC_006177	CGGGG	2	10	214839	214848	0 %	0 %	80 %	20 %	51891327
137	NC_006177	GGCGG	2	10	215050	215059	0 %	0 %	80 %	20 %	51891327
138	NC_006177	TCGTC	2	10	216923	216932	0 %	40 %	20 %	40 %	51891329
139	NC_006177	TTGCC	2	10	217866	217875	0 %	40 %	20 %	40 %	51891330
140	NC_006177	CGGGC	2	10	218759	218768	0 %	0 %	60 %	40 %	51891331
141	NC_006177	GCGTG	2	10	219785	219794	0 %	20 %	60 %	20 %	51891332
142	NC_006177	AGGCC	2	10	220156	220165	20 %	0 %	40 %	40 %	51891332
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152	NC_006177	TTCCG	2	10	233088	233097	0 %	40 %	20 %	40 %	51891346
153	NC_006177	GGATC	2	10	234179	234188	20 %	20 %	40 %	20 %	51891346
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156	NC_006177	CCCGG	2	10	239187	239196	0 %	0 %	40 %	60 %	51891352
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186	NC_006177	TCGCG	2	10	270463	270472	0 %	20 %	40 %	40 %	51891381
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202	NC_006177	AGAGG	2	10	298277	298286	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_006177	CAGCG	2	10	354860	354869	20 %	0 %	40 %	40 %	51891453
241	NC_006177	CCGGG	2	10	355693	355702	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
242	NC_006177	TCCGC	2	10	359234	359243	0 %	20 %	20 %	60 %	51891459
243	NC_006177	CATGG	2	10	361197	361206	20 %	20 %	40 %	20 %	51891460
244	NC_006177	GGTCA	2	10	361479	361488	20 %	20 %	40 %	20 %	51891460
245	NC_006177	AGCCC	2	10	361678	361687	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
246	NC_006177	GGCGG	2	10	361758	361767	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
247	NC_006177	GGACT	2	10	363548	363557	20 %	20 %	40 %	20 %	51891463
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251	NC_006177	ACCCA	2	10	364759	364768	40 %	0 %	0 %	60 %	51891463
252	NC_006177	CGCCC	2	10	365096	365105	0 %	0 %	20 %	80 %	51891463
253	NC_006177	TGGCC	2	10	365889	365898	0 %	20 %	40 %	40 %	51891464
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261	NC_006177	TTCTC	2	10	371562	371571	0 %	60 %	0 %	40 %	51891472
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265	NC_006177	ACCCA	2	10	373095	373104	40 %	0 %	0 %	60 %	51891474
266	NC_006177	GCTGC	2	10	375085	375094	0 %	20 %	40 %	40 %	51891475
267	NC_006177	CGGCG	2	10	376433	376442	0 %	0 %	60 %	40 %	51891477
268	NC_006177	CAACG	2	10	379227	379236	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_006177	GTTAG	2	10	380233	380242	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
270	NC_006177	CCGTG	2	10	380362	380371	0 %	20 %	40 %	40 %	51891480
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