MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 chromosome

Total Repeats: 489

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006177	GCGCG	2	10	9185	9194	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_006177	GTCCC	2	10	9235	9244	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_006177	GGGGC	2	10	9283	9292	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_006177	CTCTG	2	10	21279	21288	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_006177	TCGTG	2	10	22236	22245	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006177	AGAGG	2	10	24727	24736	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006177	GCGGT	2	10	31176	31185	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006177	GCCCC	2	10	54206	54215	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_006177	AGTCA	2	10	69495	69504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006177	GTATG	2	10	77985	77994	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006177	CGCTG	2	10	80113	80122	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_006177	CCGGG	2	10	86809	86818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_006177	CCCTG	2	10	89639	89648	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_006177	GGTGA	2	10	95945	95954	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006177	GTCTG	2	10	116445	116454	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_006177	AACGA	2	10	131450	131459	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_006177	CCCGG	2	10	143840	143849	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_006177	AGCGC	2	10	158514	158523	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_006177	GGAAG	2	10	160972	160981	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006177	TAAGA	2	10	166181	166190	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006177	TTCCC	2	10	178739	178748	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_006177	ACCCG	2	10	182407	182416	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_006177	CCGGT	2	10	185306	185315	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_006177	CGGCG	2	10	197697	197706	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_006177	ATCGA	2	10	258190	258199	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_006177	TACCA	2	10	268808	268817	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_006177	CCCGC	2	10	269005	269014	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
28	NC_006177	GAGGC	2	10	276140	276149	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_006177	CTCTG	2	10	288300	288309	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_006177	TCGTG	2	10	289257	289266	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006177	AGAGG	2	10	291816	291825	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006177	CTCTG	2	10	294759	294768	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_006177	TCGTG	2	10	295716	295725	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_006177	AGAGG	2	10	298277	298286	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006177	GGTCG	2	10	301706	301715	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_006177	TGACT	2	10	301823	301832	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_006177	GGCCA	2	10	303139	303148	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_006177	CGGCC	2	10	305660	305669	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_006177	AGGGG	2	10	306051	306060	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006177	GTCCA	2	10	306352	306361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_006177	AGGGA	2	10	325444	325453	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006177	GAGCA	2	10	342218	342227	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_006177	CCGGG	2	10	355693	355702	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_006177	AGCCC	2	10	361678	361687	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_006177	GGCGG	2	10	361758	361767	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_006177	CAACG	2	10	379227	379236	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_006177	GTTAG	2	10	380233	380242	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006177	CGGAT	2	10	388532	388541	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006177	CGGGG	2	10	400088	400097	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
50	NC_006177	CCCCG	2	10	400109	400118	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
51	NC_006177	CCAGG	2	10	406943	406952	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_006177	CGGGC	2	10	434143	434152	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_006177	CCTGT	2	10	446348	446357	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_006177	GAAGG	2	10	460979	460988	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006177	GCGCC	2	10	465060	465069	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_006177	TCCAC	2	10	478759	478768	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_006177	GCCGT	2	10	492102	492111	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_006177	ATTCG	2	10	494101	494110	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006177	CCGGG	2	10	496966	496975	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_006177	CCCGG	2	10	497447	497456	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_006177	ACCGG	2	10	497814	497823	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_006177	GCGCC	2	10	503721	503730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_006177	TCAAG	2	10	509831	509840	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_006177	GAGAT	2	10	514478	514487	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006177	GAAAG	2	10	520041	520050	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006177	AAACG	2	10	526418	526427	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_006177	AGGAG	2	10	528535	528544	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006177	AGGAG	2	10	540658	540667	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006177	CGGGC	2	10	551249	551258	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_006177	GGAGG	2	10	554189	554198	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006177	AGAGG	2	10	576352	576361	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006177	GAGGC	2	10	581908	581917	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_006177	GGCGG	2	10	589929	589938	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_006177	GCCCC	2	10	599117	599126	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
75	NC_006177	ACTGA	2	10	605391	605400	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_006177	CTTCC	2	10	611854	611863	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_006177	AGGGC	2	10	616529	616538	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_006177	GGGTG	2	10	620944	620953	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006177	GCCGG	2	10	629813	629822	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_006177	GTTTG	2	10	636936	636945	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006177	CAGAG	2	10	644953	644962	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_006177	AACAA	2	10	668366	668375	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_006177	GGGAG	2	10	677512	677521	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006177	GGTCG	2	10	692470	692479	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_006177	CATCG	2	10	700808	700817	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_006177	GGGCG	2	10	716552	716561	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
87	NC_006177	GCCCC	2	10	716657	716666	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
88	NC_006177	CCGCG	2	10	728450	728459	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_006177	CCGCC	2	10	730776	730785	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
90	NC_006177	CGCCT	2	10	748906	748915	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_006177	GCCGA	2	10	760961	760970	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_006177	GGCAC	2	10	768119	768128	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_006177	GGCCG	2	10	772842	772851	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_006177	GGCAC	2	10	772965	772974	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_006177	GCACA	2	10	779234	779243	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_006177	TTCGG	2	10	782658	782667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_006177	GCTAC	2	10	801656	801665	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_006177	CCCGG	2	10	801699	801708	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_006177	AGGGG	2	10	807256	807265	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006177	GGACC	2	10	808932	808941	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_006177	GGCAG	2	10	813160	813169	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_006177	GCGGT	2	10	829219	829228	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_006177	ACCGT	2	10	841575	841584	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_006177	CTCTG	2	10	842950	842959	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_006177	TCGTG	2	10	843907	843916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_006177	AGAGG	2	10	846466	846475	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006177	GGATC	2	10	854453	854462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_006177	GGCCG	2	10	861084	861093	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_006177	TCCTT	2	10	861607	861616	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_006177	ATTTG	2	10	888573	888582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006177	TCGGA	2	10	905523	905532	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_006177	GACCC	2	10	911662	911671	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_006177	CTGGT	2	10	911701	911710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_006177	GGTCT	2	10	911962	911971	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_006177	CCGGT	2	10	916966	916975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_006177	ACCGC	2	10	940587	940596	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_006177	TCGGC	2	10	949146	949155	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_006177	TCACT	2	10	952139	952148	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_006177	TCGCA	2	10	952493	952502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_006177	ACGCG	2	10	956218	956227	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_006177	GCGGT	2	10	958449	958458	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_006177	GAGGC	2	10	973522	973531	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_006177	CCCGC	2	10	975870	975879	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
124	NC_006177	ATCGG	2	10	980446	980455	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_006177	GTTCC	2	10	987855	987864	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_006177	CGGGG	2	10	988787	988796	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
127	NC_006177	CTGTC	2	10	989323	989332	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_006177	GCGGT	2	10	990387	990396	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_006177	AGGAG	2	10	992129	992138	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006177	AGGGG	2	10	994208	994217	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006177	CCCCT	2	10	994222	994231	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
132	NC_006177	GCGGT	2	10	1011004	1011013	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_006177	GCCCG	2	10	1019024	1019033	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_006177	TGGGG	2	10	1023027	1023036	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006177	TCGTT	2	10	1026225	1026234	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_006177	GGCTC	2	10	1026271	1026280	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_006177	GCGAG	2	10	1026418	1026427	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_006177	CGGGC	2	10	1036089	1036098	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_006177	CGGGC	2	10	1041897	1041906	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_006177	GAGGG	2	10	1045920	1045929	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006177	GTGAA	2	10	1060100	1060109	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006177	CGCGT	2	10	1089559	1089568	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_006177	AGATG	2	10	1089669	1089678	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006177	GCGGT	2	10	1101366	1101375	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_006177	GCGCC	2	10	1114461	1114470	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
146	NC_006177	GGTAT	2	10	1114527	1114536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006177	GGGGA	2	10	1132102	1132111	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_006177	GTTGG	2	10	1249639	1249648	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_006177	TGGCA	2	10	2128042	2128051	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_006177	CCCCG	2	10	2224612	2224621	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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290	NC_006177	GCCCG	2	10	2233287	2233296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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293	NC_006177	CGCCC	2	10	2240301	2240310	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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295	NC_006177	GCGCC	2	10	2241879	2241888	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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480	NC_006177	CACGA	2	10	3468591	3468600	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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485	NC_006177	GTCCA	2	10	3531455	3531464	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_006177	TTGCG	2	10	3548098	3548107	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
488	NC_006177	AGGGA	2	10	3550848	3550857	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.