MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 chromosome

Total Repeats: 64475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006177	GCA	2	6	27	32	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891139
2	NC_006177	ACC	2	6	41	46	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51891139
3	NC_006177	GTG	2	6	109	114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891139
4	NC_006177	ATC	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891139
5	NC_006177	CGC	2	6	179	184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891139
6	NC_006177	TGC	2	6	185	190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891139
7	NC_006177	TCG	2	6	236	241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891139
8	NC_006177	CGG	2	6	266	271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891139
9	NC_006177	GCC	2	6	328	333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891139
10	NC_006177	GCC	2	6	424	429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891139
11	NC_006177	GGT	2	6	481	486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891139
12	NC_006177	GCA	2	6	537	542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891139
13	NC_006177	TCA	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891139
14	NC_006177	CGA	2	6	669	674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891139
15	NC_006177	AGG	2	6	707	712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891139
16	NC_006177	CAA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51891139
17	NC_006177	TCC	2	6	766	771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891139
18	NC_006177	GCC	2	6	777	782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891139
19	NC_006177	GGA	2	6	801	806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891139
20	NC_006177	GCC	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891139
21	NC_006177	GAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891139
22	NC_006177	GCC	2	6	1068	1073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891139
23	NC_006177	CGA	2	6	1100	1105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891139
24	NC_006177	ACA	2	6	1130	1135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51891139
25	NC_006177	GAG	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891139
26	NC_006177	CGG	2	6	1257	1262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891139
27	NC_006177	ACG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891139
28	NC_006177	AGC	2	6	1346	1351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891139
29	NC_006177	TCA	2	6	1781	1786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891140
30	NC_006177	CCG	2	6	1833	1838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891140
31	NC_006177	CGC	2	6	1932	1937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891140
32	NC_006177	CCT	2	6	2010	2015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891140
33	NC_006177	CGC	2	6	2031	2036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891140
34	NC_006177	ACG	2	6	2042	2047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891140
35	NC_006177	CCT	2	6	2094	2099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891140
36	NC_006177	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891140
37	NC_006177	CGA	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891140
38	NC_006177	TCT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51891140
39	NC_006177	CCT	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891140
40	NC_006177	GAG	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891140
41	NC_006177	CTG	2	6	2572	2577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891140
42	NC_006177	GGA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891140
43	NC_006177	CAG	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891140
44	NC_006177	CGT	2	6	2679	2684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891140
45	NC_006177	TCA	2	6	2693	2698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891140
46	NC_006177	CGG	2	6	2798	2803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891141
47	NC_006177	GCC	2	6	2823	2828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891141
48	NC_006177	GCG	2	6	2861	2866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891141
49	NC_006177	GGC	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891141
50	NC_006177	CCG	2	6	2927	2932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891141
51	NC_006177	CTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891142
52	NC_006177	AGG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891142
53	NC_006177	TGG	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891142
54	NC_006177	CGA	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891142
55	NC_006177	TCC	2	6	3328	3333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891142
56	NC_006177	CGC	2	6	3344	3349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891142
57	NC_006177	CCA	2	6	3391	3396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51891142
58	NC_006177	TGG	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891142
59	NC_006177	TTG	2	6	3437	3442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51891142
60	NC_006177	AGC	2	6	3444	3449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891142
61	NC_006177	ACG	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891142
62	NC_006177	AGC	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891142
63	NC_006177	TGG	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891142
64	NC_006177	TGG	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891142
65	NC_006177	GCG	2	6	3520	3525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891142
66	NC_006177	ACC	2	6	3567	3572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51891142
67	NC_006177	GGA	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891142
68	NC_006177	CGA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891142
69	NC_006177	CCG	2	6	3661	3666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891142
70	NC_006177	CGG	3	9	3707	3715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891142
71	NC_006177	TGG	2	6	3726	3731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891142
72	NC_006177	GAC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891142
73	NC_006177	GCA	2	6	3799	3804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891142
74	NC_006177	GCC	2	6	3868	3873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891142
75	NC_006177	CGC	2	6	3917	3922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891142
76	NC_006177	CTG	2	6	3929	3934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891142
77	NC_006177	CGG	2	6	3936	3941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891142
78	NC_006177	TCA	2	6	3963	3968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891142
79	NC_006177	CGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891142
80	NC_006177	GTG	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891143
81	NC_006177	GGC	2	6	4156	4161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891143
82	NC_006177	GCG	2	6	4220	4225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891143
83	NC_006177	CGG	2	6	4254	4259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891143
84	NC_006177	GCG	2	6	4293	4298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891143
85	NC_006177	CCG	2	6	4307	4312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891143
86	NC_006177	CTC	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891143
87	NC_006177	CCG	3	9	4529	4537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891144
88	NC_006177	CGG	2	6	4553	4558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891144
89	NC_006177	CCA	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51891144
90	NC_006177	ATC	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891144
91	NC_006177	TGC	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891144
92	NC_006177	CGG	2	6	4769	4774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891144
93	NC_006177	CGG	3	9	4781	4789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891144
94	NC_006177	CGG	2	6	4805	4810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891144
95	NC_006177	CGG	2	6	4880	4885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891144
96	NC_006177	CGG	2	6	4910	4915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891144
97	NC_006177	CGA	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891144
98	NC_006177	CAA	2	6	5279	5284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51891144
99	NC_006177	TCA	2	6	5344	5349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891144
100	NC_006177	CTC	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891144
101	NC_006177	TCG	2	6	5512	5517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891144
102	NC_006177	GGA	2	6	5552	5557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891144
103	NC_006177	GCC	2	6	5601	5606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891144
104	NC_006177	GGC	2	6	5618	5623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891144
105	NC_006177	CGA	2	6	5906	5911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891144
106	NC_006177	ATC	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891144
107	NC_006177	CTC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891144
108	NC_006177	TTC	2	6	6006	6011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51891144
109	NC_006177	CGC	2	6	6061	6066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891144
110	NC_006177	TAC	2	6	6096	6101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891144
111	NC_006177	CGG	2	6	6143	6148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891144
112	NC_006177	AGC	2	6	6199	6204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891144
113	NC_006177	GGA	2	6	6257	6262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891144
114	NC_006177	CGC	2	6	6263	6268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891144
115	NC_006177	CCG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891144
116	NC_006177	CGT	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891145
117	NC_006177	TCG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891145
118	NC_006177	ACC	2	6	6643	6648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51891145
119	NC_006177	CGG	2	6	6661	6666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891145
120	NC_006177	TGC	2	6	6703	6708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891145
121	NC_006177	GAA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891145
122	NC_006177	ACA	2	6	6862	6867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51891145
123	NC_006177	TGC	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891145
124	NC_006177	CCT	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891145
125	NC_006177	CCA	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51891145
126	NC_006177	CAT	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891145
127	NC_006177	CAT	2	6	7043	7048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891145
128	NC_006177	CCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891145
129	NC_006177	TCG	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891145
130	NC_006177	CAA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51891145
131	NC_006177	CGG	2	6	7332	7337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891145
132	NC_006177	GCA	2	6	7388	7393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891145
133	NC_006177	CAT	3	9	7403	7411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891145
134	NC_006177	TGG	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891145
135	NC_006177	CCT	2	6	7439	7444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891145
136	NC_006177	TGC	2	6	7459	7464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891145
137	NC_006177	ACT	2	6	7465	7470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891145
138	NC_006177	GCA	2	6	7475	7480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891145
139	NC_006177	CAT	2	6	7574	7579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891145
140	NC_006177	CGA	2	6	7580	7585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891145
141	NC_006177	TCA	2	6	7588	7593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891145
142	NC_006177	CTC	2	6	7604	7609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891145
143	NC_006177	GCA	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891145
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153	NC_006177	GCA	2	6	7982	7987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891145
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156	NC_006177	CAC	2	6	8067	8072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51891145
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159	NC_006177	CCT	2	6	8180	8185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891145
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163	NC_006177	GAA	2	6	8276	8281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891145
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165	NC_006177	ATC	2	6	8391	8396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891145
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261	NC_006177	ACC	2	6	14061	14066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51891149
262	NC_006177	ACG	2	6	14068	14073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891149
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265	NC_006177	GTG	2	6	14217	14222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891149
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274	NC_006177	CGG	2	6	14768	14773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891150
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290	NC_006177	GGA	2	6	15717	15722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891150
291	NC_006177	GGA	2	6	15759	15764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891150
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294	NC_006177	GCT	2	6	15891	15896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891150
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370	NC_006177	GGT	2	6	19823	19828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891154
371	NC_006177	GAC	2	6	19833	19838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891154
372	NC_006177	TGC	2	6	19861	19866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891154
373	NC_006177	GCG	2	6	19867	19872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891154
374	NC_006177	GGC	2	6	20003	20008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891154
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377	NC_006177	AGG	2	6	20119	20124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891154
378	NC_006177	CGT	2	6	20164	20169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891154
379	NC_006177	CAA	2	6	20183	20188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51891154
380	NC_006177	GAA	2	6	20219	20224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891154
381	NC_006177	GGA	2	6	20231	20236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891154
382	NC_006177	GTG	2	6	20262	20267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891154
383	NC_006177	GGA	2	6	20285	20290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891154
384	NC_006177	AGG	2	6	20320	20325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891154
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386	NC_006177	GGC	2	6	20420	20425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891154
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