MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii PBi chromosome linear

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006156	AATTAA	2	12	45224	45235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006156	ATTGAT	2	12	120602	120613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006156	TATTTT	2	12	143926	143937	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006156	TTTATT	2	12	189665	189676	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006156	ATATTT	2	12	189918	189929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006156	AAAATC	2	12	205663	205674	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006156	TAAATA	2	12	244533	244544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006156	TAAAAA	2	12	328046	328057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006156	ACTATT	2	12	354096	354107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006156	TAATAG	2	12	354158	354169	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006156	AAATTT	2	12	389113	389124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006156	TAAAAA	2	12	395930	395941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006156	ATAATT	2	12	413647	413658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006156	TTCAAA	2	12	417244	417255	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_006156	ATTAGT	2	12	435999	436010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006156	TCGCTT	2	12	438195	438206	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006156	ATTAGT	2	12	439243	439254	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006156	TCGCTT	2	12	441439	441450	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006156	TTTATC	2	12	445339	445350	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_006156	TTCGCC	2	12	446159	446170	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006156	TTCGCC	2	12	447578	447589	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006156	TTATTT	2	12	448312	448323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006156	TAAAAA	2	12	460421	460432	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006156	TTAAAA	2	12	494829	494840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006156	AATAAG	2	12	549970	549981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006156	TAGCTT	2	12	586978	586989	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_006156	TAATTA	2	12	592179	592190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006156	ATTAAT	2	12	612106	612117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006156	TTAAAT	2	12	697527	697538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006156	CTATTA	2	12	700259	700270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006156	AGAATA	2	12	716874	716885	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006156	TATTTT	2	12	776500	776511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006156	CTTTAT	2	12	784965	784976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_006156	TTAATT	2	12	800931	800942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006156	TAATGT	2	12	831017	831028	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006156	TTGAAT	2	12	831054	831065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006156	TTTTTA	2	12	862285	862296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006156	TTTTAT	2	12	890131	890142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.