MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii PBi chromosome linear

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006156	AATTT	2	10	8181	8190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006156	TAAAT	2	10	19848	19857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006156	AATTA	2	10	22601	22610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006156	AGCTA	2	10	25524	25533	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006156	AAAAT	3	15	80795	80809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006156	TACAA	2	10	83777	83786	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006156	ATTAA	2	10	86700	86709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006156	GATTA	2	10	102817	102826	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006156	TACAA	2	10	108028	108037	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006156	TTAAT	2	10	114555	114564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006156	TAAAA	2	10	131059	131068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006156	TTATA	2	10	131071	131080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006156	ATTAT	2	10	143866	143875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006156	AAAAT	2	10	150421	150430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006156	TAAAG	2	10	152645	152654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006156	TTTAA	2	10	188879	188888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006156	CAAAA	2	10	189731	189740	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006156	AATTA	2	10	189835	189844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006156	AGTCA	2	10	202346	202355	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006156	AAATT	2	10	208262	208271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006156	TAAAA	2	10	243679	243688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006156	ATAAA	2	10	244431	244440	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006156	AGAAA	2	10	247276	247285	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006156	TTTAA	2	10	248928	248937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006156	TAAAA	2	10	251874	251883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006156	AACAA	2	10	262536	262545	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_006156	TTTAT	2	10	272445	272454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006156	TATAA	3	15	272502	272516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006156	TTTTA	2	10	272545	272554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006156	TAATT	2	10	326709	326718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006156	CTATC	2	10	338974	338983	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_006156	ATAAA	2	10	354178	354187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006156	AGCAA	2	10	355669	355678	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_006156	TAAAA	2	10	359920	359929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006156	TTTAA	2	10	372287	372296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006156	AAAAC	2	10	391772	391781	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_006156	AAAAC	2	10	393182	393191	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_006156	TTAAT	2	10	411343	411352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006156	TAAAA	2	10	417392	417401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006156	TAAAA	2	10	435835	435844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006156	CTCCC	2	10	438340	438349	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
42	NC_006156	ATAAA	2	10	439078	439087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006156	CTCCC	2	10	441584	441593	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
44	NC_006156	ATTAA	2	10	444464	444473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006156	TATAA	2	10	445076	445085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006156	TACCA	2	10	446198	446207	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_006156	AAAAG	2	10	446716	446725	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006156	TCGCT	2	10	447056	447065	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_006156	AAAAC	2	10	451584	451593	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_006156	AATTC	2	10	466169	466178	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_006156	TAAAA	2	10	466232	466241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006156	ATGTT	2	10	467542	467551	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006156	AATTG	2	10	473446	473455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006156	TTGTT	2	10	477904	477913	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006156	TAATA	2	10	483381	483390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006156	AATGT	2	10	484733	484742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006156	GTATA	2	10	484895	484904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006156	TATTT	2	10	487697	487706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006156	ATGTT	2	10	487835	487844	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006156	TTTAT	2	10	491861	491870	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006156	TTTTA	2	10	496767	496776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006156	TAAGT	2	10	498904	498913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006156	TTTAA	2	10	529643	529652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006156	TAAAT	2	10	536542	536551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006156	GTTAT	2	10	536645	536654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006156	GTTTA	2	10	536673	536682	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006156	TTTTA	2	10	541469	541478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006156	TTAAT	2	10	544334	544343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006156	GATTT	2	10	566157	566166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006156	TATTT	2	10	577824	577833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006156	TGATT	2	10	577899	577908	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006156	AAATT	2	10	579229	579238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006156	TATTT	2	10	585864	585873	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006156	AAATT	2	10	585947	585956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006156	TTTTA	2	10	589879	589888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006156	GGATA	2	10	608955	608964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006156	TCTTT	2	10	609931	609940	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_006156	GTGAA	2	10	612185	612194	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006156	TAAAA	2	10	617767	617776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006156	GTTTT	2	10	620691	620700	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006156	ATGTT	2	10	620719	620728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006156	TATAT	2	10	630960	630969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006156	ATTTT	2	10	631098	631107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006156	ATTAT	2	10	632667	632676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006156	TATAT	2	10	636447	636456	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006156	TTATT	2	10	647582	647591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006156	GATTT	2	10	664479	664488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006156	ATTTT	2	10	664867	664876	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006156	TTAAA	2	10	688442	688451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006156	TATAT	2	10	690249	690258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006156	ATTTT	2	10	701913	701922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006156	TAATT	2	10	704891	704900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006156	TTTTA	2	10	716714	716723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006156	TATAA	2	10	726102	726111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006156	ATATT	2	10	735928	735937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006156	ATTAT	2	10	744528	744537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006156	ATTTT	2	10	746792	746801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006156	GGGTG	2	10	776385	776394	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006156	TTTAT	2	10	777390	777399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006156	AAGCA	2	10	779584	779593	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_006156	TCCTT	2	10	783959	783968	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_006156	ATTAA	2	10	785379	785388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006156	ATCTT	2	10	795624	795633	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_006156	CTTAA	2	10	800998	801007	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_006156	ATTAT	2	10	801010	801019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006156	AAATT	2	10	815204	815213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006156	CTTTT	2	10	820436	820445	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_006156	ATTTA	2	10	822460	822469	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006156	TATAT	2	10	862007	862016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006156	TTTTA	2	10	862242	862251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006156	CCCTT	2	10	904235	904244	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.