MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii PBi chromosome linear

Total Repeats: 278

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006156	AATG	2	8	153	160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006156	TTAT	2	8	8206	8213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006156	TAAT	2	8	19840	19847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006156	TAAA	2	8	22647	22654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006156	ATTT	2	8	25556	25563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006156	ATTT	2	8	37989	37996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006156	ATTT	2	8	40591	40598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006156	AATT	2	8	46274	46281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006156	AATA	2	8	46511	46518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006156	AAAT	2	8	46527	46534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006156	AAGC	2	8	46695	46702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006156	TAAT	2	8	47720	47727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006156	ATTT	2	8	56657	56664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006156	ATTT	2	8	58896	58903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006156	GAAA	2	8	69974	69981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006156	AAAT	2	8	69982	69989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006156	AACA	2	8	72468	72475	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006156	TTTA	2	8	80743	80750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006156	CAAA	2	8	93916	93923	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006156	ATAA	2	8	94037	94044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006156	ATAA	2	8	98627	98634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006156	TTCC	2	8	101166	101173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006156	TAAA	2	8	108064	108071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006156	TTAG	2	8	112652	112659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006156	TTTA	2	8	112697	112704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006156	TATT	2	8	114472	114479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006156	ATAA	2	8	114609	114616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006156	TAAT	2	8	120511	120518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006156	TATT	2	8	131044	131051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006156	TTAT	2	8	137646	137653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006156	AATA	2	8	137863	137870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006156	TAAA	2	8	147177	147184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006156	AAAT	2	8	150526	150533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006156	AAGA	2	8	165504	165511	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006156	TTTA	2	8	167407	167414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006156	ATTA	2	8	169005	169012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006156	AAAC	2	8	170760	170767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006156	ATTT	2	8	171117	171124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006156	TAAT	2	8	182462	182469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006156	AAAT	2	8	188102	188109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006156	TTTA	2	8	188141	188148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006156	ATCT	2	8	188649	188656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_006156	AATT	4	16	189477	189492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006156	GATT	2	8	189619	189626	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006156	TTTA	2	8	189796	189803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006156	ATTT	2	8	189812	189819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006156	TAAA	2	8	191099	191106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006156	TAAA	2	8	193286	193293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006156	TACA	2	8	202166	202173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_006156	TAAA	2	8	205692	205699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006156	TTTA	2	8	205715	205722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006156	ATTA	2	8	205787	205794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006156	TTAA	2	8	206005	206012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006156	ATTT	2	8	206095	206102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006156	AATA	2	8	230539	230546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006156	TCAA	2	8	237235	237242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006156	AAAT	2	8	238080	238087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006156	CATA	2	8	244354	244361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006156	GAAA	2	8	244462	244469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006156	TTAA	2	8	244514	244521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006156	ATTA	2	8	244567	244574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006156	GGAA	2	8	244580	244587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006156	ATTT	2	8	247101	247108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006156	GAAA	2	8	247159	247166	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006156	AATT	2	8	247198	247205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006156	CAAA	2	8	251061	251068	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_006156	TTTC	2	8	251915	251922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_006156	ATTA	2	8	262708	262715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006156	TAAA	2	8	272557	272564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006156	AATA	2	8	288728	288735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006156	ATTT	2	8	289819	289826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006156	ATTA	2	8	325126	325133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006156	TAAA	2	8	325296	325303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006156	ATAA	2	8	329575	329582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006156	AAAT	2	8	329591	329598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006156	TTAT	2	8	333479	333486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006156	TAAA	2	8	336991	336998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006156	TAAA	2	8	338854	338861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006156	CAAT	2	8	338878	338885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_006156	ATTA	2	8	338950	338957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006156	ACAT	2	8	343763	343770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006156	TAAA	2	8	343776	343783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006156	TTAT	2	8	346084	346091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006156	ATAG	2	8	364369	364376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006156	ATTT	2	8	372932	372939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006156	AATA	2	8	372968	372975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006156	ATTT	2	8	372976	372983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006156	ATAG	2	8	382985	382992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006156	TATT	2	8	390611	390618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006156	AATA	2	8	390626	390633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006156	TTTA	2	8	391796	391803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006156	TAAA	2	8	392879	392886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006156	TTTC	2	8	392935	392942	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_006156	CATT	2	8	393331	393338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_006156	TTTA	2	8	393674	393681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006156	TAAA	2	8	394719	394726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006156	ATTT	2	8	395826	395833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006156	TTTA	2	8	395896	395903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006156	AATA	2	8	397177	397184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006156	TCCT	2	8	410054	410061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_006156	TAAA	2	8	411256	411263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006156	TATT	2	8	413697	413704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006156	TTAT	2	8	417197	417204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006156	AATT	2	8	417205	417212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006156	CTTA	2	8	417217	417224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_006156	TATT	2	8	417268	417275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006156	TTAT	2	8	417416	417423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006156	CTTA	2	8	418999	419006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_006156	CATT	2	8	425123	425130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_006156	AAAT	2	8	425152	425159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006156	TAAA	2	8	425183	425190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006156	TTAT	2	8	425280	425287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006156	AATA	2	8	428584	428591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006156	TACG	2	8	437141	437148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_006156	ACCT	2	8	437205	437212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_006156	CTAC	2	8	437275	437282	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_006156	GTTT	2	8	438036	438043	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006156	CTAA	2	8	438171	438178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_006156	TCGC	2	8	438661	438668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_006156	TAGC	2	8	438760	438767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_006156	TACG	2	8	440385	440392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_006156	ACCT	2	8	440449	440456	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006156	CTAC	2	8	440519	440526	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_006156	GTTT	2	8	441280	441287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006156	CTAA	2	8	441415	441422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_006156	TCGC	2	8	441905	441912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_006156	TAGC	2	8	442004	442011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_006156	TAAA	2	8	442299	442306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006156	TTTA	2	8	443314	443321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006156	TTTA	2	8	443995	444002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006156	AATA	2	8	444006	444013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006156	ATTG	2	8	444503	444510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006156	TATT	3	12	444593	444604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006156	AATA	2	8	444625	444632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006156	TAAA	2	8	444882	444889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006156	ATTT	2	8	445240	445247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006156	CAAT	2	8	446598	446605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_006156	TTCT	2	8	447597	447604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_006156	AACT	2	8	448061	448068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_006156	GTAG	2	8	448183	448190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006156	TTTG	2	8	448352	448359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006156	CTTA	2	8	448369	448376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_006156	AATC	2	8	449106	449113	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006156	ATAA	2	8	449128	449135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006156	CTTC	2	8	449889	449896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_006156	TTTA	2	8	449917	449924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006156	AAAG	2	8	450031	450038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006156	AAAC	2	8	450829	450836	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_006156	AATA	2	8	450859	450866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006156	TAAA	2	8	453108	453115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006156	CATT	2	8	458611	458618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_006156	TAGA	2	8	458716	458723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.