MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006154	TA	5	10	30	39	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006154	TA	3	6	341	346	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
3	NC_006154	TC	3	6	560	565	0 %	50 %	0 %	50 %	51593943
4	NC_006154	TA	3	6	665	670	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
5	NC_006154	AG	3	6	806	811	50 %	0 %	50 %	0 %	51593943
6	NC_006154	AT	3	6	812	817	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
7	NC_006154	TG	3	6	1690	1695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006154	AT	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006154	TG	3	6	2149	2154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006154	AT	3	6	2500	2505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006154	CG	3	6	3004	3009	0 %	0 %	50 %	50 %	51593946
12	NC_006154	GT	3	6	3930	3935	0 %	50 %	50 %	0 %	51593948
13	NC_006154	GC	3	6	5043	5048	0 %	0 %	50 %	50 %	51593948
14	NC_006154	TG	3	6	5698	5703	0 %	50 %	50 %	0 %	51593948
15	NC_006154	GT	3	6	6332	6337	0 %	50 %	50 %	0 %	51593949
16	NC_006154	AG	3	6	6764	6769	50 %	0 %	50 %	0 %	51593949
17	NC_006154	GT	3	6	7204	7209	0 %	50 %	50 %	0 %	51593950
18	NC_006154	AT	3	6	7708	7713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006154	CT	3	6	8701	8706	0 %	50 %	0 %	50 %	51593953
20	NC_006154	GC	3	6	8915	8920	0 %	0 %	50 %	50 %	51593953
21	NC_006154	TA	3	6	9364	9369	50 %	50 %	0 %	0 %	51593954
22	NC_006154	AT	3	6	9894	9899	50 %	50 %	0 %	0 %	51593955
23	NC_006154	GT	3	6	10158	10163	0 %	50 %	50 %	0 %	51593955
24	NC_006154	CA	3	6	10447	10452	50 %	0 %	0 %	50 %	51593955
25	NC_006154	TA	3	6	10605	10610	50 %	50 %	0 %	0 %	51593955
26	NC_006154	GT	3	6	11618	11623	0 %	50 %	50 %	0 %	51593956
27	NC_006154	AT	4	8	12014	12021	50 %	50 %	0 %	0 %	51593956
28	NC_006154	TC	3	6	12277	12282	0 %	50 %	0 %	50 %	51593957
29	NC_006154	GT	3	6	12720	12725	0 %	50 %	50 %	0 %	51593957
30	NC_006154	CT	3	6	14083	14088	0 %	50 %	0 %	50 %	51593959
31	NC_006154	AT	3	6	14515	14520	50 %	50 %	0 %	0 %	51593960
32	NC_006154	TC	3	6	15912	15917	0 %	50 %	0 %	50 %	51593961
33	NC_006154	AG	5	10	16699	16708	50 %	0 %	50 %	0 %	51593963
34	NC_006154	AG	3	6	17135	17140	50 %	0 %	50 %	0 %	51593965
35	NC_006154	AT	3	6	17272	17277	50 %	50 %	0 %	0 %	51593966
36	NC_006154	AG	3	6	17300	17305	50 %	0 %	50 %	0 %	51593966
37	NC_006154	CT	3	6	17740	17745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006154	TA	3	6	17952	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006154	GA	3	6	17968	17973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006154	CT	3	6	18509	18514	0 %	50 %	0 %	50 %	51593970
41	NC_006154	TA	3	6	18721	18726	50 %	50 %	0 %	0 %	51593970
42	NC_006154	GA	3	6	18737	18742	50 %	0 %	50 %	0 %	51593970
43	NC_006154	TA	3	6	19872	19877	50 %	50 %	0 %	0 %	51593970
44	NC_006154	TA	3	6	20069	20074	50 %	50 %	0 %	0 %	51593970
45	NC_006154	AT	3	6	20491	20496	50 %	50 %	0 %	0 %	51593971
46	NC_006154	GT	3	6	21183	21188	0 %	50 %	50 %	0 %	51593972
47	NC_006154	GT	3	6	21623	21628	0 %	50 %	50 %	0 %	51593972
48	NC_006154	AT	3	6	22343	22348	50 %	50 %	0 %	0 %	51593972
49	NC_006154	GT	3	6	22492	22497	0 %	50 %	50 %	0 %	51593972
50	NC_006154	TA	3	6	22541	22546	50 %	50 %	0 %	0 %	51593972
51	NC_006154	TC	3	6	25021	25026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006154	TG	3	6	25032	25037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006154	GT	3	6	25433	25438	0 %	50 %	50 %	0 %	51593977
54	NC_006154	AG	3	6	26135	26140	50 %	0 %	50 %	0 %	51593978
55	NC_006154	AT	3	6	27064	27069	50 %	50 %	0 %	0 %	51593981
56	NC_006154	AT	5	10	27337	27346	50 %	50 %	0 %	0 %	51593983

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.