MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	CCGGTT	2	12	4007	4018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006153	CCAATC	2	12	4031	4042	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006153	TTTCCA	2	12	7551	7562	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	51593855
4	NC_006153	TGGAAA	2	12	8701	8712	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	51593857
5	NC_006153	CGATTA	2	12	9047	9058	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_006153	CAATTG	2	12	9783	9794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51593859
7	NC_006153	ATCTAT	2	12	21309	21320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51593870
8	NC_006153	GATGTC	2	12	24881	24892	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229310099
9	NC_006153	TTTCCA	2	12	26904	26915	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	51593880
10	NC_006153	ATTTTT	2	12	35714	35725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51593893
11	NC_006153	TTAAAC	2	12	37484	37495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51593897
12	NC_006153	TTATTT	2	12	40485	40496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006153	CAAGAT	2	12	41839	41850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	51593902
14	NC_006153	AATTAC	2	12	45273	45284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_006153	TGAGCG	2	12	47055	47066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	51593910
16	NC_006153	GAAGAT	2	12	47140	47151	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	51593910
17	NC_006153	CAAGAA	2	12	47182	47193	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	51593910
18	NC_006153	TAGAAC	2	12	48304	48315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113911686
19	NC_006153	TTGGTT	2	12	53259	53270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006153	TAACGT	2	12	54760	54771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51593920
21	NC_006153	GTTACT	2	12	55053	55064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	51593921
22	NC_006153	TTATGT	2	12	55110	55121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	51593921
23	NC_006153	TTTTGC	2	12	60420	60431	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	51593928
24	NC_006153	GGTTAT	2	12	62513	62524	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006153	AATTGA	2	12	63546	63557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	51593933
26	NC_006153	TGAATG	2	12	65362	65373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593936
27	NC_006153	AGGCAC	2	12	66162	66173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593937
28	NC_006153	AAGATT	2	12	67917	67928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	51593940

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.