MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	TGGAT	2	10	1102	1111	20 %	40 %	40 %	0 %	51593847
2	NC_006153	GCCAT	2	10	1612	1621	20 %	20 %	20 %	40 %	51593847
3	NC_006153	TGGCT	2	10	1875	1884	0 %	40 %	40 %	20 %	51593847
4	NC_006153	CGGGG	2	10	4270	4279	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006153	AAAAG	2	10	4513	4522	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006153	AGCGC	2	10	5314	5323	20 %	0 %	40 %	40 %	229310098
7	NC_006153	TCGCC	2	10	5822	5831	0 %	20 %	20 %	60 %	51593852
8	NC_006153	ATTAA	2	10	7831	7840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006153	AATCG	2	10	10612	10621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006153	CCTCA	2	10	10694	10703	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_006153	CTGTA	2	10	10892	10901	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006153	GCTAA	2	10	14261	14270	40 %	20 %	20 %	20 %	51593861
13	NC_006153	ACCTT	2	10	18402	18411	20 %	40 %	0 %	40 %	51593866
14	NC_006153	TTTTG	2	10	20374	20383	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006153	CAGCC	2	10	23471	23480	20 %	0 %	20 %	60 %	51593875
16	NC_006153	TTTGG	2	10	24947	24956	0 %	60 %	40 %	0 %	229310099
17	NC_006153	GGACC	2	10	25946	25955	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_006153	TGTAG	2	10	25989	25998	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006153	ATTAA	2	10	27185	27194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006153	GCTTG	2	10	30525	30534	0 %	40 %	40 %	20 %	51593884
21	NC_006153	TTTTA	2	10	36367	36376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006153	TAAAA	2	10	36506	36515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006153	GCCGC	2	10	38448	38457	0 %	0 %	40 %	60 %	51593897
24	NC_006153	CCATC	2	10	42328	42337	20 %	20 %	0 %	60 %	51593902
25	NC_006153	GCATC	2	10	42601	42610	20 %	20 %	20 %	40 %	51593902
26	NC_006153	TTCAC	2	10	50181	50190	20 %	40 %	0 %	40 %	51593914
27	NC_006153	TTGTT	2	10	50490	50499	0 %	80 %	20 %	0 %	51593915
28	NC_006153	GCAGA	2	10	51390	51399	40 %	0 %	40 %	20 %	51593916
29	NC_006153	TAAAT	2	10	52704	52713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006153	TTTCT	2	10	52875	52884	0 %	80 %	0 %	20 %	51593917
31	NC_006153	CCAAG	2	10	54143	54152	40 %	0 %	20 %	40 %	51593918
32	NC_006153	TTTGG	2	10	55278	55287	0 %	60 %	40 %	0 %	51593921
33	NC_006153	CGTCT	2	10	55334	55343	0 %	40 %	20 %	40 %	51593921
34	NC_006153	CTGAA	2	10	56177	56186	40 %	20 %	20 %	20 %	51593921
35	NC_006153	GTACG	2	10	56495	56504	20 %	20 %	40 %	20 %	51593921
36	NC_006153	CATTC	2	10	57446	57455	20 %	40 %	0 %	40 %	51593922
37	NC_006153	AAAGT	2	10	57655	57664	60 %	20 %	20 %	0 %	51593922
38	NC_006153	ATTGC	2	10	58624	58633	20 %	40 %	20 %	20 %	51593925
39	NC_006153	GAATG	2	10	58865	58874	40 %	20 %	40 %	0 %	51593925
40	NC_006153	CTATA	2	10	65799	65808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.