MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	TGGAT	2	10	1102	1111	20 %	40 %	40 %	0 %	51593847
2	NC_006153	GCCAT	2	10	1612	1621	20 %	20 %	20 %	40 %	51593847
3	NC_006153	TGGCT	2	10	1875	1884	0 %	40 %	40 %	20 %	51593847
4	NC_006153	AGCGC	2	10	5314	5323	20 %	0 %	40 %	40 %	229310098
5	NC_006153	TCGCC	2	10	5822	5831	0 %	20 %	20 %	60 %	51593852
6	NC_006153	GCTAA	2	10	14261	14270	40 %	20 %	20 %	20 %	51593861
7	NC_006153	ACCTT	2	10	18402	18411	20 %	40 %	0 %	40 %	51593866
8	NC_006153	CAGCC	2	10	23471	23480	20 %	0 %	20 %	60 %	51593875
9	NC_006153	TTTGG	2	10	24947	24956	0 %	60 %	40 %	0 %	229310099
10	NC_006153	GCTTG	2	10	30525	30534	0 %	40 %	40 %	20 %	51593884
11	NC_006153	GCCGC	2	10	38448	38457	0 %	0 %	40 %	60 %	51593897
12	NC_006153	CCATC	2	10	42328	42337	20 %	20 %	0 %	60 %	51593902
13	NC_006153	GCATC	2	10	42601	42610	20 %	20 %	20 %	40 %	51593902
14	NC_006153	TTCAC	2	10	50181	50190	20 %	40 %	0 %	40 %	51593914
15	NC_006153	TTGTT	2	10	50490	50499	0 %	80 %	20 %	0 %	51593915
16	NC_006153	GCAGA	2	10	51390	51399	40 %	0 %	40 %	20 %	51593916
17	NC_006153	TTTCT	2	10	52875	52884	0 %	80 %	0 %	20 %	51593917
18	NC_006153	CCAAG	2	10	54143	54152	40 %	0 %	20 %	40 %	51593918
19	NC_006153	TTTGG	2	10	55278	55287	0 %	60 %	40 %	0 %	51593921
20	NC_006153	CGTCT	2	10	55334	55343	0 %	40 %	20 %	40 %	51593921
21	NC_006153	CTGAA	2	10	56177	56186	40 %	20 %	20 %	20 %	51593921
22	NC_006153	GTACG	2	10	56495	56504	20 %	20 %	40 %	20 %	51593921
23	NC_006153	CATTC	2	10	57446	57455	20 %	40 %	0 %	40 %	51593922
24	NC_006153	AAAGT	2	10	57655	57664	60 %	20 %	20 %	0 %	51593922
25	NC_006153	ATTGC	2	10	58624	58633	20 %	40 %	20 %	20 %	51593925
26	NC_006153	GAATG	2	10	58865	58874	40 %	20 %	40 %	0 %	51593925

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.