MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	ATAG	2	8	340	347	50 %	25 %	25 %	0 %	51593847
2	NC_006153	CATC	2	8	1565	1572	25 %	25 %	0 %	50 %	51593847
3	NC_006153	CCCT	2	8	3204	3211	0 %	25 %	0 %	75 %	51593849
4	NC_006153	CATC	2	8	5107	5114	25 %	25 %	0 %	50 %	229310098
5	NC_006153	GGTA	2	8	5284	5291	25 %	25 %	50 %	0 %	229310098
6	NC_006153	GCCA	2	8	5920	5927	25 %	0 %	25 %	50 %	51593852
7	NC_006153	TCTG	2	8	6053	6060	0 %	50 %	25 %	25 %	51593853
8	NC_006153	TGAA	2	8	6113	6120	50 %	25 %	25 %	0 %	51593853
9	NC_006153	CTGC	2	8	7530	7537	0 %	25 %	25 %	50 %	51593855
10	NC_006153	TGAC	2	8	8261	8268	25 %	25 %	25 %	25 %	51593856
11	NC_006153	GCAG	2	8	8726	8733	25 %	0 %	50 %	25 %	51593857
12	NC_006153	TTTC	2	8	9651	9658	0 %	75 %	0 %	25 %	51593859
13	NC_006153	CTTA	2	8	9979	9986	25 %	50 %	0 %	25 %	51593859
14	NC_006153	ACGT	2	8	11379	11386	25 %	25 %	25 %	25 %	51593860
15	NC_006153	AGCC	2	8	11824	11831	25 %	0 %	25 %	50 %	51593860
16	NC_006153	TGTC	2	8	12105	12112	0 %	50 %	25 %	25 %	51593860
17	NC_006153	AATG	2	8	13134	13141	50 %	25 %	25 %	0 %	51593860
18	NC_006153	AGGG	2	8	13997	14004	25 %	0 %	75 %	0 %	51593861
19	NC_006153	GGCT	2	8	15946	15953	0 %	25 %	50 %	25 %	51593863
20	NC_006153	GCAC	2	8	16047	16054	25 %	0 %	25 %	50 %	51593863
21	NC_006153	GGTC	2	8	16182	16189	0 %	25 %	50 %	25 %	51593863
22	NC_006153	CAGA	2	8	16267	16274	50 %	0 %	25 %	25 %	51593863
23	NC_006153	TCTT	2	8	16757	16764	0 %	75 %	0 %	25 %	51593864
24	NC_006153	AAGA	2	8	16779	16786	75 %	0 %	25 %	0 %	51593864
25	NC_006153	CGAT	2	8	17671	17678	25 %	25 %	25 %	25 %	51593865
26	NC_006153	GCCA	2	8	18004	18011	25 %	0 %	25 %	50 %	51593866
27	NC_006153	GCGG	2	8	18427	18434	0 %	0 %	75 %	25 %	51593866
28	NC_006153	CGCC	2	8	18822	18829	0 %	0 %	25 %	75 %	51593866
29	NC_006153	CTGG	2	8	18951	18958	0 %	25 %	50 %	25 %	51593866
30	NC_006153	GTTC	2	8	18990	18997	0 %	50 %	25 %	25 %	51593866
31	NC_006153	GTCA	2	8	19682	19689	25 %	25 %	25 %	25 %	51593867
32	NC_006153	TAAG	2	8	20097	20104	50 %	25 %	25 %	0 %	51593868
33	NC_006153	ATTT	2	8	20497	20504	25 %	75 %	0 %	0 %	51593869
34	NC_006153	AGCC	2	8	20647	20654	25 %	0 %	25 %	50 %	51593869
35	NC_006153	GCAG	2	8	21079	21086	25 %	0 %	50 %	25 %	51593869
36	NC_006153	GGAT	2	8	22385	22392	25 %	25 %	50 %	0 %	51593873
37	NC_006153	AGAT	2	8	22447	22454	50 %	25 %	25 %	0 %	51593873
38	NC_006153	AGAA	2	8	23203	23210	75 %	0 %	25 %	0 %	51593875
39	NC_006153	ACCA	2	8	23663	23670	50 %	0 %	0 %	50 %	51593875
40	NC_006153	TTCC	2	8	23916	23923	0 %	50 %	0 %	50 %	51593875
41	NC_006153	AAGC	2	8	23971	23978	50 %	0 %	25 %	25 %	51593875
42	NC_006153	AATT	2	8	24043	24050	50 %	50 %	0 %	0 %	51593875
43	NC_006153	GTCA	2	8	24244	24251	25 %	25 %	25 %	25 %	229310099
44	NC_006153	TCCA	2	8	24305	24312	25 %	25 %	0 %	50 %	229310099
45	NC_006153	GACT	2	8	24317	24324	25 %	25 %	25 %	25 %	229310099
46	NC_006153	GACT	2	8	24559	24566	25 %	25 %	25 %	25 %	229310099
47	NC_006153	ATCA	2	8	24826	24833	50 %	25 %	0 %	25 %	229310099
48	NC_006153	CCAT	2	8	24858	24865	25 %	25 %	0 %	50 %	229310099
49	NC_006153	TGGA	2	8	24998	25005	25 %	25 %	50 %	0 %	229310099
50	NC_006153	GCCA	3	12	26627	26638	25 %	0 %	25 %	50 %	51593879
51	NC_006153	CTGC	2	8	26883	26890	0 %	25 %	25 %	50 %	51593880
52	NC_006153	CGAC	2	8	28206	28213	25 %	0 %	25 %	50 %	51593881
53	NC_006153	AACA	2	8	28895	28902	75 %	0 %	0 %	25 %	51593882
54	NC_006153	TATT	2	8	28961	28968	25 %	75 %	0 %	0 %	51593882
55	NC_006153	GGCG	2	8	29999	30006	0 %	0 %	75 %	25 %	51593883
56	NC_006153	CCAA	2	8	30655	30662	50 %	0 %	0 %	50 %	51593884
57	NC_006153	TTTG	2	8	30669	30676	0 %	75 %	25 %	0 %	51593884
58	NC_006153	TAAA	2	8	31754	31761	75 %	25 %	0 %	0 %	51593886
59	NC_006153	AATG	2	8	33081	33088	50 %	25 %	25 %	0 %	51593888
60	NC_006153	ATTT	2	8	33148	33155	25 %	75 %	0 %	0 %	51593888
61	NC_006153	CAAA	2	8	34868	34875	75 %	0 %	0 %	25 %	51593889
62	NC_006153	CATA	2	8	34878	34885	50 %	25 %	0 %	25 %	51593889
63	NC_006153	CATT	2	8	35756	35763	25 %	50 %	0 %	25 %	51593893
64	NC_006153	TCAA	2	8	36606	36613	50 %	25 %	0 %	25 %	51593896
65	NC_006153	CTGT	2	8	37446	37453	0 %	50 %	25 %	25 %	51593896
66	NC_006153	GCTT	2	8	37689	37696	0 %	50 %	25 %	25 %	51593897
67	NC_006153	AGCC	2	8	38187	38194	25 %	0 %	25 %	50 %	51593897
68	NC_006153	CTTG	2	8	38227	38234	0 %	50 %	25 %	25 %	51593897
69	NC_006153	AAGC	2	8	38392	38399	50 %	0 %	25 %	25 %	51593897
70	NC_006153	TGGC	2	8	38511	38518	0 %	25 %	50 %	25 %	51593897
71	NC_006153	AGGA	2	8	39124	39131	50 %	0 %	50 %	0 %	51593898
72	NC_006153	TGAA	2	8	39244	39251	50 %	25 %	25 %	0 %	51593899
73	NC_006153	GTTG	2	8	39893	39900	0 %	50 %	50 %	0 %	51593899
74	NC_006153	GAGC	2	8	40622	40629	25 %	0 %	50 %	25 %	51593901
75	NC_006153	TAAT	2	8	41455	41462	50 %	50 %	0 %	0 %	51593902
76	NC_006153	CACG	2	8	41713	41720	25 %	0 %	25 %	50 %	51593902
77	NC_006153	ATCA	2	8	41927	41934	50 %	25 %	0 %	25 %	51593902
78	NC_006153	CTTT	2	8	42507	42514	0 %	75 %	0 %	25 %	51593902
79	NC_006153	AACC	2	8	43330	43337	50 %	0 %	0 %	50 %	51593903
80	NC_006153	GACT	2	8	43476	43483	25 %	25 %	25 %	25 %	51593904
81	NC_006153	GCTT	2	8	43588	43595	0 %	50 %	25 %	25 %	51593904
82	NC_006153	ACTC	2	8	44113	44120	25 %	25 %	0 %	50 %	51593905
83	NC_006153	ATCG	2	8	44150	44157	25 %	25 %	25 %	25 %	51593906
84	NC_006153	TCAC	2	8	44428	44435	25 %	25 %	0 %	50 %	51593907
85	NC_006153	GGTA	2	8	44639	44646	25 %	25 %	50 %	0 %	51593907
86	NC_006153	TCAC	2	8	44932	44939	25 %	25 %	0 %	50 %	51593907
87	NC_006153	GTAG	2	8	45488	45495	25 %	25 %	50 %	0 %	51593909
88	NC_006153	TTAC	2	8	45586	45593	25 %	50 %	0 %	25 %	51593909
89	NC_006153	GGGT	2	8	45735	45742	0 %	25 %	75 %	0 %	51593909
90	NC_006153	TGCT	2	8	45975	45982	0 %	50 %	25 %	25 %	51593909
91	NC_006153	GCTT	2	8	46831	46838	0 %	50 %	25 %	25 %	51593910
92	NC_006153	GCAG	2	8	46839	46846	25 %	0 %	50 %	25 %	51593910
93	NC_006153	TGCG	2	8	47425	47432	0 %	25 %	50 %	25 %	113911686
94	NC_006153	GGAA	2	8	47463	47470	50 %	0 %	50 %	0 %	113911686
95	NC_006153	AAAT	2	8	49216	49223	75 %	25 %	0 %	0 %	51593912
96	NC_006153	GTGA	2	8	49948	49955	25 %	25 %	50 %	0 %	51593913
97	NC_006153	AACC	2	8	50596	50603	50 %	0 %	0 %	50 %	51593915
98	NC_006153	ATTG	2	8	50667	50674	25 %	50 %	25 %	0 %	51593915
99	NC_006153	ACCC	2	8	51233	51240	25 %	0 %	0 %	75 %	51593916
100	NC_006153	ACCT	2	8	53046	53053	25 %	25 %	0 %	50 %	51593917
101	NC_006153	TTGC	2	8	53798	53805	0 %	50 %	25 %	25 %	51593918
102	NC_006153	AGCG	2	8	54008	54015	25 %	0 %	50 %	25 %	51593918
103	NC_006153	AGTC	2	8	54095	54102	25 %	25 %	25 %	25 %	51593918
104	NC_006153	TGGC	2	8	55419	55426	0 %	25 %	50 %	25 %	51593921
105	NC_006153	AGCG	2	8	55584	55591	25 %	0 %	50 %	25 %	51593921
106	NC_006153	TGAT	2	8	56009	56016	25 %	50 %	25 %	0 %	51593921
107	NC_006153	TGAT	2	8	56126	56133	25 %	50 %	25 %	0 %	51593921
108	NC_006153	TCGC	2	8	56351	56358	0 %	25 %	25 %	50 %	51593921
109	NC_006153	TTCT	2	8	56932	56939	0 %	75 %	0 %	25 %	51593922
110	NC_006153	TTCT	2	8	57208	57215	0 %	75 %	0 %	25 %	51593922
111	NC_006153	ACTA	2	8	58153	58160	50 %	25 %	0 %	25 %	51593923
112	NC_006153	AAAT	2	8	58277	58284	75 %	25 %	0 %	0 %	51593923
113	NC_006153	CAAA	2	8	58371	58378	75 %	0 %	0 %	25 %	51593924
114	NC_006153	AAAT	2	8	58733	58740	75 %	25 %	0 %	0 %	51593925
115	NC_006153	TTAT	2	8	59284	59291	25 %	75 %	0 %	0 %	51593926
116	NC_006153	GCTG	2	8	59596	59603	0 %	25 %	50 %	25 %	51593927
117	NC_006153	GAAG	2	8	59830	59837	50 %	0 %	50 %	0 %	51593928
118	NC_006153	AGTG	2	8	60370	60377	25 %	25 %	50 %	0 %	51593928
119	NC_006153	CACT	2	8	60858	60865	25 %	25 %	0 %	50 %	51593929
120	NC_006153	GGCT	2	8	60917	60924	0 %	25 %	50 %	25 %	51593929
121	NC_006153	CAGG	2	8	61506	61513	25 %	0 %	50 %	25 %	51593930
122	NC_006153	AGGT	2	8	61624	61631	25 %	25 %	50 %	0 %	51593930
123	NC_006153	TGTC	2	8	62915	62922	0 %	50 %	25 %	25 %	51593932
124	NC_006153	CGAA	2	8	63760	63767	50 %	0 %	25 %	25 %	51593934
125	NC_006153	TGGA	2	8	63823	63830	25 %	25 %	50 %	0 %	51593934
126	NC_006153	TACA	2	8	63868	63875	50 %	25 %	0 %	25 %	51593934
127	NC_006153	TTAT	2	8	64027	64034	25 %	75 %	0 %	0 %	51593935
128	NC_006153	TCAT	2	8	64511	64518	25 %	50 %	0 %	25 %	51593936
129	NC_006153	CATA	2	8	64623	64630	50 %	25 %	0 %	25 %	51593936
130	NC_006153	GTAA	2	8	65118	65125	50 %	25 %	25 %	0 %	51593936
131	NC_006153	GGTC	2	8	66305	66312	0 %	25 %	50 %	25 %	51593937
132	NC_006153	CAGA	2	8	66390	66397	50 %	0 %	25 %	25 %	51593937
133	NC_006153	GGGA	2	8	66711	66718	25 %	0 %	75 %	0 %	51593938
134	NC_006153	ATCC	2	8	68015	68022	25 %	25 %	0 %	50 %	51593940
135	NC_006153	ATTT	2	8	68115	68122	25 %	75 %	0 %	0 %	51593940
136	NC_006153	ATTT	2	8	68140	68147	25 %	75 %	0 %	0 %	51593940

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.