MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	TC	3	6	76	81	0 %	50 %	0 %	50 %	51593847
2	NC_006153	GC	3	6	517	522	0 %	0 %	50 %	50 %	51593847
3	NC_006153	GT	3	6	549	554	0 %	50 %	50 %	0 %	51593847
4	NC_006153	GT	3	6	1535	1540	0 %	50 %	50 %	0 %	51593847
5	NC_006153	GT	3	6	1958	1963	0 %	50 %	50 %	0 %	51593847
6	NC_006153	AG	3	6	2033	2038	50 %	0 %	50 %	0 %	51593847
7	NC_006153	GC	3	6	2470	2475	0 %	0 %	50 %	50 %	51593848
8	NC_006153	CA	3	6	2577	2582	50 %	0 %	0 %	50 %	51593848
9	NC_006153	CA	3	6	2665	2670	50 %	0 %	0 %	50 %	51593848
10	NC_006153	AT	3	6	2727	2732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006153	GT	3	6	2994	2999	0 %	50 %	50 %	0 %	51593849
12	NC_006153	GC	3	6	4302	4307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006153	TG	3	6	4320	4325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006153	GC	3	6	5012	5017	0 %	0 %	50 %	50 %	229310098
15	NC_006153	CG	3	6	5517	5522	0 %	0 %	50 %	50 %	229310098
16	NC_006153	TG	3	6	5661	5666	0 %	50 %	50 %	0 %	229310098
17	NC_006153	TC	3	6	6026	6031	0 %	50 %	0 %	50 %	51593853
18	NC_006153	GT	3	6	6733	6738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006153	GT	3	6	6890	6895	0 %	50 %	50 %	0 %	51593854
20	NC_006153	AT	3	6	7128	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	51593854
21	NC_006153	CA	3	6	7140	7145	50 %	0 %	0 %	50 %	51593854
22	NC_006153	CG	3	6	8374	8379	0 %	0 %	50 %	50 %	51593856
23	NC_006153	GA	3	6	8931	8936	50 %	0 %	50 %	0 %	51593858
24	NC_006153	GT	3	6	9459	9464	0 %	50 %	50 %	0 %	51593859
25	NC_006153	TC	3	6	9756	9761	0 %	50 %	0 %	50 %	51593859
26	NC_006153	AT	3	6	10466	10471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006153	AT	3	6	10588	10593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006153	TA	3	6	10879	10884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006153	TG	3	6	11237	11242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006153	TC	3	6	11715	11720	0 %	50 %	0 %	50 %	51593860
31	NC_006153	AC	3	6	13771	13776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006153	TG	3	6	13792	13797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006153	CG	3	6	13882	13887	0 %	0 %	50 %	50 %	51593861
34	NC_006153	GT	3	6	14124	14129	0 %	50 %	50 %	0 %	51593861
35	NC_006153	GA	3	6	14251	14256	50 %	0 %	50 %	0 %	51593861
36	NC_006153	TA	3	6	14655	14660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006153	AC	3	6	15024	15029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006153	GA	3	6	15939	15944	50 %	0 %	50 %	0 %	51593863
39	NC_006153	TC	3	6	17184	17189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006153	GT	3	6	18600	18605	0 %	50 %	50 %	0 %	51593866
41	NC_006153	CT	3	6	19073	19078	0 %	50 %	0 %	50 %	51593866
42	NC_006153	CG	3	6	19541	19546	0 %	0 %	50 %	50 %	51593867
43	NC_006153	TA	3	6	19977	19982	50 %	50 %	0 %	0 %	51593868
44	NC_006153	AT	3	6	20070	20075	50 %	50 %	0 %	0 %	51593868
45	NC_006153	AT	3	6	20085	20090	50 %	50 %	0 %	0 %	51593868
46	NC_006153	TC	3	6	21266	21271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006153	TA	3	6	21366	21371	50 %	50 %	0 %	0 %	51593870
48	NC_006153	TA	3	6	21373	21378	50 %	50 %	0 %	0 %	51593870
49	NC_006153	AT	3	6	21729	21734	50 %	50 %	0 %	0 %	51593871
50	NC_006153	AT	3	6	21893	21898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006153	AC	3	6	22210	22215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006153	TC	3	6	23282	23287	0 %	50 %	0 %	50 %	51593875
53	NC_006153	GA	4	8	23509	23516	50 %	0 %	50 %	0 %	51593875
54	NC_006153	AT	3	6	25329	25334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006153	AT	3	6	25527	25532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006153	AC	3	6	25714	25719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006153	GT	3	6	26086	26091	0 %	50 %	50 %	0 %	51593878
58	NC_006153	AC	3	6	26366	26371	50 %	0 %	0 %	50 %	51593879
59	NC_006153	AT	3	6	26481	26486	50 %	50 %	0 %	0 %	51593879
60	NC_006153	CA	3	6	26493	26498	50 %	0 %	0 %	50 %	51593879
61	NC_006153	TG	3	6	27396	27401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006153	AG	3	6	28630	28635	50 %	0 %	50 %	0 %	51593882
63	NC_006153	AT	3	6	29228	29233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006153	CT	3	6	29277	29282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006153	AT	3	6	29457	29462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006153	GA	3	6	29818	29823	50 %	0 %	50 %	0 %	51593883
67	NC_006153	TC	3	6	30262	30267	0 %	50 %	0 %	50 %	51593883
68	NC_006153	TA	3	6	30961	30966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006153	TA	4	8	31177	31184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006153	AT	3	6	32364	32369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006153	AT	3	6	32462	32467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006153	CT	3	6	33349	33354	0 %	50 %	0 %	50 %	51593889
73	NC_006153	CT	3	6	34538	34543	0 %	50 %	0 %	50 %	51593889
74	NC_006153	TA	3	6	34893	34898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006153	TA	3	6	34901	34906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006153	TA	3	6	36471	36476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006153	CT	3	6	36893	36898	0 %	50 %	0 %	50 %	51593896
78	NC_006153	CA	3	6	38988	38993	50 %	0 %	0 %	50 %	51593898
79	NC_006153	AG	3	6	39055	39060	50 %	0 %	50 %	0 %	51593898
80	NC_006153	CA	3	6	40359	40364	50 %	0 %	0 %	50 %	51593900
81	NC_006153	GA	3	6	40641	40646	50 %	0 %	50 %	0 %	51593901
82	NC_006153	AT	3	6	41242	41247	50 %	50 %	0 %	0 %	51593902
83	NC_006153	AT	3	6	41298	41303	50 %	50 %	0 %	0 %	51593902
84	NC_006153	GA	3	6	41578	41583	50 %	0 %	50 %	0 %	51593902
85	NC_006153	AT	3	6	42421	42426	50 %	50 %	0 %	0 %	51593902
86	NC_006153	CG	3	6	42524	42529	0 %	0 %	50 %	50 %	51593902
87	NC_006153	AG	3	6	42612	42617	50 %	0 %	50 %	0 %	51593902
88	NC_006153	GC	3	6	43300	43305	0 %	0 %	50 %	50 %	51593903
89	NC_006153	CT	3	6	46368	46373	0 %	50 %	0 %	50 %	51593909
90	NC_006153	AG	3	6	47597	47602	50 %	0 %	50 %	0 %	113911686
91	NC_006153	CG	3	6	48157	48162	0 %	0 %	50 %	50 %	113911686
92	NC_006153	GC	3	6	48242	48247	0 %	0 %	50 %	50 %	113911686
93	NC_006153	CA	3	6	49340	49345	50 %	0 %	0 %	50 %	51593912
94	NC_006153	CT	3	6	50851	50856	0 %	50 %	0 %	50 %	51593915
95	NC_006153	GC	3	6	51258	51263	0 %	0 %	50 %	50 %	51593916
96	NC_006153	AT	3	6	51836	51841	50 %	50 %	0 %	0 %	51593916
97	NC_006153	AT	3	6	52454	52459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006153	AT	3	6	52476	52481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006153	TG	3	6	52824	52829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006153	CA	3	6	52968	52973	50 %	0 %	0 %	50 %	51593917
101	NC_006153	CT	3	6	53120	53125	0 %	50 %	0 %	50 %	51593917
102	NC_006153	AT	3	6	53329	53334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006153	TA	3	6	53445	53450	50 %	50 %	0 %	0 %	51593918
104	NC_006153	TC	3	6	53830	53835	0 %	50 %	0 %	50 %	51593918
105	NC_006153	TA	4	8	54564	54571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006153	GT	3	6	56796	56801	0 %	50 %	50 %	0 %	51593921
107	NC_006153	CG	3	6	57060	57065	0 %	0 %	50 %	50 %	51593922
108	NC_006153	AG	3	6	58215	58220	50 %	0 %	50 %	0 %	51593923
109	NC_006153	AC	3	6	59587	59592	50 %	0 %	0 %	50 %	51593927
110	NC_006153	AG	3	6	60891	60896	50 %	0 %	50 %	0 %	51593929
111	NC_006153	TC	3	6	61118	61123	0 %	50 %	0 %	50 %	51593930
112	NC_006153	GC	3	6	61148	61153	0 %	0 %	50 %	50 %	51593930
113	NC_006153	AT	3	6	61731	61736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006153	TA	3	6	62296	62301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006153	GA	3	6	62473	62478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006153	AT	3	6	62815	62820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006153	CT	3	6	63050	63055	0 %	50 %	0 %	50 %	51593932
118	NC_006153	GC	4	8	65189	65196	0 %	0 %	50 %	50 %	51593936
119	NC_006153	GT	3	6	65267	65272	0 %	50 %	50 %	0 %	51593936
120	NC_006153	CT	3	6	65623	65628	0 %	50 %	0 %	50 %	51593936
121	NC_006153	CT	3	6	65714	65719	0 %	50 %	0 %	50 %	51593936
122	NC_006153	AT	3	6	65934	65939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006153	TC	4	8	67579	67586	0 %	50 %	0 %	50 %	51593940
124	NC_006153	AT	3	6	68024	68029	50 %	50 %	0 %	0 %	51593940
125	NC_006153	TA	4	8	68420	68427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006153	AT	3	6	68506	68511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.