MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	C	6	6	748	753	0 %	0 %	0 %	100 %	51593847
2	NC_006153	C	8	8	806	813	0 %	0 %	0 %	100 %	51593847
3	NC_006153	A	7	7	2447	2453	100 %	0 %	0 %	0 %	51593848
4	NC_006153	T	6	6	3639	3644	0 %	100 %	0 %	0 %	51593850
5	NC_006153	T	7	7	4336	4342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006153	A	6	6	4594	4599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006153	T	7	7	5602	5608	0 %	100 %	0 %	0 %	229310098
8	NC_006153	T	6	6	6145	6150	0 %	100 %	0 %	0 %	51593853
9	NC_006153	C	6	6	6470	6475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_006153	A	6	6	9014	9019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006153	T	6	6	9517	9522	0 %	100 %	0 %	0 %	51593859
12	NC_006153	T	6	6	9577	9582	0 %	100 %	0 %	0 %	51593859
13	NC_006153	T	9	9	10161	10169	0 %	100 %	0 %	0 %	51593859
14	NC_006153	A	6	6	10541	10546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006153	A	9	9	10683	10691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006153	A	9	9	10760	10768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006153	T	7	7	10821	10827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006153	A	6	6	10849	10854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006153	A	8	8	10858	10865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006153	A	7	7	10980	10986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006153	G	6	6	12042	12047	0 %	0 %	100 %	0 %	51593860
22	NC_006153	T	6	6	13105	13110	0 %	100 %	0 %	0 %	51593860
23	NC_006153	T	6	6	13811	13816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006153	A	7	7	14360	14366	100 %	0 %	0 %	0 %	51593861
25	NC_006153	T	6	6	15047	15052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006153	A	6	6	15721	15726	100 %	0 %	0 %	0 %	51593862
27	NC_006153	T	7	7	17174	17180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006153	A	10	10	17359	17368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006153	T	6	6	17826	17831	0 %	100 %	0 %	0 %	51593865
30	NC_006153	C	6	6	20035	20040	0 %	0 %	0 %	100 %	51593868
31	NC_006153	T	6	6	20412	20417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006153	T	6	6	21230	21235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006153	A	6	6	21603	21608	100 %	0 %	0 %	0 %	51593871
34	NC_006153	A	7	7	22250	22256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006153	A	7	7	22291	22297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006153	A	7	7	22644	22650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006153	T	7	7	23254	23260	0 %	100 %	0 %	0 %	51593875
38	NC_006153	A	6	6	25295	25300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006153	A	6	6	25587	25592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006153	T	6	6	27813	27818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006153	T	7	7	27899	27905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006153	T	6	6	28420	28425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006153	T	7	7	28602	28608	0 %	100 %	0 %	0 %	51593882
44	NC_006153	T	6	6	28674	28679	0 %	100 %	0 %	0 %	51593882
45	NC_006153	A	6	6	29340	29345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006153	A	7	7	30251	30257	100 %	0 %	0 %	0 %	51593883
47	NC_006153	A	6	6	31252	31257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006153	A	6	6	31362	31367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006153	C	7	7	31565	31571	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_006153	A	6	6	31861	31866	100 %	0 %	0 %	0 %	51593886
51	NC_006153	A	7	7	32021	32027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006153	A	6	6	32029	32034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006153	A	6	6	32096	32101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006153	T	6	6	32104	32109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006153	G	7	7	32512	32518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006153	T	6	6	32716	32721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006153	A	6	6	32911	32916	100 %	0 %	0 %	0 %	51593888
58	NC_006153	T	6	6	33679	33684	0 %	100 %	0 %	0 %	51593889
59	NC_006153	T	6	6	34171	34176	0 %	100 %	0 %	0 %	51593889
60	NC_006153	T	6	6	34417	34422	0 %	100 %	0 %	0 %	51593889
61	NC_006153	A	6	6	34784	34789	100 %	0 %	0 %	0 %	51593889
62	NC_006153	A	6	6	35388	35393	100 %	0 %	0 %	0 %	51593891
63	NC_006153	A	6	6	35945	35950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006153	C	7	7	36149	36155	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_006153	T	6	6	36204	36209	0 %	100 %	0 %	0 %	51593895
66	NC_006153	T	7	7	37369	37375	0 %	100 %	0 %	0 %	51593896
67	NC_006153	G	6	6	38611	38616	0 %	0 %	100 %	0 %	51593897
68	NC_006153	T	6	6	39311	39316	0 %	100 %	0 %	0 %	51593899
69	NC_006153	T	7	7	39437	39443	0 %	100 %	0 %	0 %	51593899
70	NC_006153	T	9	9	39476	39484	0 %	100 %	0 %	0 %	51593899
71	NC_006153	T	6	6	41203	41208	0 %	100 %	0 %	0 %	51593902
72	NC_006153	G	8	8	42943	42950	0 %	0 %	100 %	0 %	51593902
73	NC_006153	G	6	6	43726	43731	0 %	0 %	100 %	0 %	51593904
74	NC_006153	A	7	7	44399	44405	100 %	0 %	0 %	0 %	51593907
75	NC_006153	T	6	6	45386	45391	0 %	100 %	0 %	0 %	51593908
76	NC_006153	G	6	6	45791	45796	0 %	0 %	100 %	0 %	51593909
77	NC_006153	G	9	9	45956	45964	0 %	0 %	100 %	0 %	51593909
78	NC_006153	A	6	6	46935	46940	100 %	0 %	0 %	0 %	51593910
79	NC_006153	A	6	6	47397	47402	100 %	0 %	0 %	0 %	113911686
80	NC_006153	A	6	6	47849	47854	100 %	0 %	0 %	0 %	113911686
81	NC_006153	C	7	7	49653	49659	0 %	0 %	0 %	100 %	51593913
82	NC_006153	T	7	7	49854	49860	0 %	100 %	0 %	0 %	51593913
83	NC_006153	T	7	7	51456	51462	0 %	100 %	0 %	0 %	51593916
84	NC_006153	A	7	7	51567	51573	100 %	0 %	0 %	0 %	51593916
85	NC_006153	T	8	8	52559	52566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006153	C	7	7	52902	52908	0 %	0 %	0 %	100 %	51593917
87	NC_006153	T	6	6	53602	53607	0 %	100 %	0 %	0 %	51593918
88	NC_006153	T	6	6	53614	53619	0 %	100 %	0 %	0 %	51593918
89	NC_006153	T	8	8	54196	54203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006153	T	7	7	54469	54475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006153	A	6	6	54601	54606	100 %	0 %	0 %	0 %	51593920
92	NC_006153	T	6	6	55026	55031	0 %	100 %	0 %	0 %	51593921
93	NC_006153	A	6	6	55535	55540	100 %	0 %	0 %	0 %	51593921
94	NC_006153	T	6	6	57086	57091	0 %	100 %	0 %	0 %	51593922
95	NC_006153	T	6	6	57233	57238	0 %	100 %	0 %	0 %	51593922
96	NC_006153	A	6	6	57357	57362	100 %	0 %	0 %	0 %	51593922
97	NC_006153	A	6	6	57604	57609	100 %	0 %	0 %	0 %	51593922
98	NC_006153	G	6	6	57870	57875	0 %	0 %	100 %	0 %	51593922
99	NC_006153	A	6	6	58166	58171	100 %	0 %	0 %	0 %	51593923
100	NC_006153	G	7	7	59728	59734	0 %	0 %	100 %	0 %	51593927
101	NC_006153	T	6	6	61823	61828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006153	A	7	7	61857	61863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006153	G	6	6	62000	62005	0 %	0 %	100 %	0 %	51593931
104	NC_006153	G	6	6	62617	62622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006153	C	6	6	62771	62776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_006153	A	7	7	63092	63098	100 %	0 %	0 %	0 %	51593932
107	NC_006153	A	6	6	64056	64061	100 %	0 %	0 %	0 %	51593935
108	NC_006153	T	6	6	64746	64751	0 %	100 %	0 %	0 %	51593936
109	NC_006153	A	6	6	65814	65819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006153	T	6	6	65822	65827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006153	T	6	6	65913	65918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006153	T	6	6	65958	65963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006153	A	6	6	65964	65969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006153	T	6	6	66768	66773	0 %	100 %	0 %	0 %	51593938
115	NC_006153	T	6	6	67030	67035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006153	T	8	8	67390	67397	0 %	100 %	0 %	0 %	51593940
117	NC_006153	T	6	6	67452	67457	0 %	100 %	0 %	0 %	51593940
118	NC_006153	T	7	7	67596	67602	0 %	100 %	0 %	0 %	51593940
119	NC_006153	T	6	6	67879	67884	0 %	100 %	0 %	0 %	51593940
120	NC_006153	T	6	6	68433	68438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.