MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	C	6	6	748	753	0 %	0 %	0 %	100 %	51593847
2	NC_006153	C	8	8	806	813	0 %	0 %	0 %	100 %	51593847
3	NC_006153	A	7	7	2447	2453	100 %	0 %	0 %	0 %	51593848
4	NC_006153	T	6	6	3639	3644	0 %	100 %	0 %	0 %	51593850
5	NC_006153	T	7	7	5602	5608	0 %	100 %	0 %	0 %	229310098
6	NC_006153	T	6	6	6145	6150	0 %	100 %	0 %	0 %	51593853
7	NC_006153	T	6	6	9517	9522	0 %	100 %	0 %	0 %	51593859
8	NC_006153	T	6	6	9577	9582	0 %	100 %	0 %	0 %	51593859
9	NC_006153	T	9	9	10161	10169	0 %	100 %	0 %	0 %	51593859
10	NC_006153	G	6	6	12042	12047	0 %	0 %	100 %	0 %	51593860
11	NC_006153	T	6	6	13105	13110	0 %	100 %	0 %	0 %	51593860
12	NC_006153	A	7	7	14360	14366	100 %	0 %	0 %	0 %	51593861
13	NC_006153	A	6	6	15721	15726	100 %	0 %	0 %	0 %	51593862
14	NC_006153	T	6	6	17826	17831	0 %	100 %	0 %	0 %	51593865
15	NC_006153	C	6	6	20035	20040	0 %	0 %	0 %	100 %	51593868
16	NC_006153	A	6	6	21603	21608	100 %	0 %	0 %	0 %	51593871
17	NC_006153	T	7	7	23254	23260	0 %	100 %	0 %	0 %	51593875
18	NC_006153	T	7	7	28602	28608	0 %	100 %	0 %	0 %	51593882
19	NC_006153	T	6	6	28674	28679	0 %	100 %	0 %	0 %	51593882
20	NC_006153	A	7	7	30251	30257	100 %	0 %	0 %	0 %	51593883
21	NC_006153	A	6	6	31861	31866	100 %	0 %	0 %	0 %	51593886
22	NC_006153	A	6	6	32911	32916	100 %	0 %	0 %	0 %	51593888
23	NC_006153	T	6	6	33679	33684	0 %	100 %	0 %	0 %	51593889
24	NC_006153	T	6	6	34171	34176	0 %	100 %	0 %	0 %	51593889
25	NC_006153	T	6	6	34417	34422	0 %	100 %	0 %	0 %	51593889
26	NC_006153	A	6	6	34784	34789	100 %	0 %	0 %	0 %	51593889
27	NC_006153	A	6	6	35388	35393	100 %	0 %	0 %	0 %	51593891
28	NC_006153	T	6	6	36204	36209	0 %	100 %	0 %	0 %	51593895
29	NC_006153	T	7	7	37369	37375	0 %	100 %	0 %	0 %	51593896
30	NC_006153	G	6	6	38611	38616	0 %	0 %	100 %	0 %	51593897
31	NC_006153	T	6	6	39311	39316	0 %	100 %	0 %	0 %	51593899
32	NC_006153	T	7	7	39437	39443	0 %	100 %	0 %	0 %	51593899
33	NC_006153	T	9	9	39476	39484	0 %	100 %	0 %	0 %	51593899
34	NC_006153	T	6	6	41203	41208	0 %	100 %	0 %	0 %	51593902
35	NC_006153	G	8	8	42943	42950	0 %	0 %	100 %	0 %	51593902
36	NC_006153	G	6	6	43726	43731	0 %	0 %	100 %	0 %	51593904
37	NC_006153	A	7	7	44399	44405	100 %	0 %	0 %	0 %	51593907
38	NC_006153	T	6	6	45386	45391	0 %	100 %	0 %	0 %	51593908
39	NC_006153	G	6	6	45791	45796	0 %	0 %	100 %	0 %	51593909
40	NC_006153	G	9	9	45956	45964	0 %	0 %	100 %	0 %	51593909
41	NC_006153	A	6	6	46935	46940	100 %	0 %	0 %	0 %	51593910
42	NC_006153	A	6	6	47397	47402	100 %	0 %	0 %	0 %	113911686
43	NC_006153	A	6	6	47849	47854	100 %	0 %	0 %	0 %	113911686
44	NC_006153	C	7	7	49653	49659	0 %	0 %	0 %	100 %	51593913
45	NC_006153	T	7	7	49854	49860	0 %	100 %	0 %	0 %	51593913
46	NC_006153	T	7	7	51456	51462	0 %	100 %	0 %	0 %	51593916
47	NC_006153	A	7	7	51567	51573	100 %	0 %	0 %	0 %	51593916
48	NC_006153	C	7	7	52902	52908	0 %	0 %	0 %	100 %	51593917
49	NC_006153	T	6	6	53602	53607	0 %	100 %	0 %	0 %	51593918
50	NC_006153	T	6	6	53614	53619	0 %	100 %	0 %	0 %	51593918
51	NC_006153	A	6	6	54601	54606	100 %	0 %	0 %	0 %	51593920
52	NC_006153	T	6	6	55026	55031	0 %	100 %	0 %	0 %	51593921
53	NC_006153	A	6	6	55535	55540	100 %	0 %	0 %	0 %	51593921
54	NC_006153	T	6	6	57086	57091	0 %	100 %	0 %	0 %	51593922
55	NC_006153	T	6	6	57233	57238	0 %	100 %	0 %	0 %	51593922
56	NC_006153	A	6	6	57357	57362	100 %	0 %	0 %	0 %	51593922
57	NC_006153	A	6	6	57604	57609	100 %	0 %	0 %	0 %	51593922
58	NC_006153	G	6	6	57870	57875	0 %	0 %	100 %	0 %	51593922
59	NC_006153	A	6	6	58166	58171	100 %	0 %	0 %	0 %	51593923
60	NC_006153	G	7	7	59728	59734	0 %	0 %	100 %	0 %	51593927
61	NC_006153	G	6	6	62000	62005	0 %	0 %	100 %	0 %	51593931
62	NC_006153	A	7	7	63092	63098	100 %	0 %	0 %	0 %	51593932
63	NC_006153	A	6	6	64056	64061	100 %	0 %	0 %	0 %	51593935
64	NC_006153	T	6	6	64746	64751	0 %	100 %	0 %	0 %	51593936
65	NC_006153	T	6	6	66768	66773	0 %	100 %	0 %	0 %	51593938
66	NC_006153	T	8	8	67390	67397	0 %	100 %	0 %	0 %	51593940
67	NC_006153	T	6	6	67452	67457	0 %	100 %	0 %	0 %	51593940
68	NC_006153	T	7	7	67596	67602	0 %	100 %	0 %	0 %	51593940
69	NC_006153	T	6	6	67879	67884	0 %	100 %	0 %	0 %	51593940

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.