MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 13822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006142	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473216
2	NC_006142	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473216
3	NC_006142	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473216
4	NC_006142	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473216
5	NC_006142	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473216
6	NC_006142	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473216
7	NC_006142	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473216
8	NC_006142	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473216
9	NC_006142	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473216
10	NC_006142	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473216
11	NC_006142	GTG	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473217
12	NC_006142	ATA	2	6	1098	1103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473217
13	NC_006142	TGA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473217
14	NC_006142	TGT	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473217
15	NC_006142	CAA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473217
16	NC_006142	TAA	2	6	1286	1291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473217
17	NC_006142	CAA	2	6	1436	1441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473218
18	NC_006142	TGC	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473218
19	NC_006142	ATA	3	9	1670	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473218
20	NC_006142	TGA	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473218
21	NC_006142	GCA	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473218
22	NC_006142	GAA	2	6	1893	1898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473218
23	NC_006142	AAT	2	6	1923	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473218
24	NC_006142	AAG	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473218
25	NC_006142	TTA	2	6	1978	1983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473218
26	NC_006142	ACA	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473218
27	NC_006142	ATT	2	6	2111	2116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473219
28	NC_006142	TAG	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473219
29	NC_006142	ATA	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473219
30	NC_006142	ATA	2	6	2481	2486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473219
31	NC_006142	ATG	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473219
32	NC_006142	TAA	2	6	2749	2754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473219
33	NC_006142	TTA	2	6	2776	2781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473219
34	NC_006142	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
35	NC_006142	ATT	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
36	NC_006142	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
37	NC_006142	GAA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
38	NC_006142	AGC	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473220
39	NC_006142	GTT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473220
40	NC_006142	TCA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473220
41	NC_006142	CAA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473220
42	NC_006142	GAT	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
43	NC_006142	ATT	2	6	3540	3545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
44	NC_006142	AGC	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473220
45	NC_006142	TAT	2	6	3751	3756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
46	NC_006142	GCA	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473220
47	NC_006142	AGA	2	6	3880	3885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
48	NC_006142	CTT	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473220
49	NC_006142	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
50	NC_006142	AAT	3	9	4250	4258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
51	NC_006142	ATG	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
52	NC_006142	TGA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
53	NC_006142	ATA	2	6	4496	4501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
54	NC_006142	GGT	3	9	4502	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473220
55	NC_006142	CTT	2	6	4515	4520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473220
56	NC_006142	GCA	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473220
57	NC_006142	AGA	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
58	NC_006142	AGA	3	9	4603	4611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
59	NC_006142	GAA	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
60	NC_006142	GTT	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473220
61	NC_006142	AAG	2	6	4656	4661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
62	NC_006142	GAA	2	6	4673	4678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
63	NC_006142	TAA	2	6	4693	4698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
64	NC_006142	TAT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
65	NC_006142	ATA	2	6	5001	5006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
66	NC_006142	GAT	3	9	5015	5023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
67	NC_006142	AAG	2	6	5094	5099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
68	NC_006142	AAT	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
69	NC_006142	ATT	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
70	NC_006142	TAA	2	6	5203	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
71	NC_006142	TGC	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473220
72	NC_006142	ATT	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
73	NC_006142	CTA	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473220
74	NC_006142	AGT	2	6	5449	5454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
75	NC_006142	CAC	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473220
76	NC_006142	ATT	3	9	5507	5515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
77	NC_006142	TTA	2	6	5540	5545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
78	NC_006142	TAA	2	6	5631	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
79	NC_006142	TCA	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473220
80	NC_006142	ATG	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
81	NC_006142	AAT	2	6	5827	5832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
82	NC_006142	CTA	3	9	6032	6040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473221
83	NC_006142	AAT	2	6	6058	6063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473221
84	NC_006142	ATT	2	6	6079	6084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473221
85	NC_006142	TTC	2	6	6145	6150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473221
86	NC_006142	TAC	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473221
87	NC_006142	CCA	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473221
88	NC_006142	ATT	2	6	6350	6355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473221
89	NC_006142	TTA	2	6	6464	6469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473221
90	NC_006142	TAT	2	6	6537	6542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473221
91	NC_006142	ATT	2	6	6551	6556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473221
92	NC_006142	TAC	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473221
93	NC_006142	GTA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473221
94	NC_006142	CTT	2	6	6996	7001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473222
95	NC_006142	TAG	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473222
96	NC_006142	AGC	2	6	7039	7044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473222
97	NC_006142	CTA	2	6	7185	7190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473222
98	NC_006142	TAT	2	6	7240	7245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473222
99	NC_006142	ACT	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473223
100	NC_006142	TTA	2	6	7445	7450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473223
101	NC_006142	ATA	2	6	7475	7480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473223
102	NC_006142	CTT	2	6	7536	7541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473223
103	NC_006142	CCT	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473223
104	NC_006142	TGC	2	6	7567	7572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473223
105	NC_006142	TCC	2	6	7621	7626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473223
106	NC_006142	AAT	2	6	7681	7686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473223
107	NC_006142	TCT	2	6	7748	7753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473223
108	NC_006142	ATA	2	6	7754	7759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473223
109	NC_006142	TAG	2	6	7785	7790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473223
110	NC_006142	ATT	2	6	7810	7815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473223
111	NC_006142	TAT	2	6	7848	7853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473223
112	NC_006142	ACG	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473223
113	NC_006142	TCG	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473223
114	NC_006142	TGT	2	6	7955	7960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473223
115	NC_006142	TAT	2	6	8025	8030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473223
116	NC_006142	TAA	2	6	8037	8042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473223
117	NC_006142	AAT	2	6	8107	8112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473223
118	NC_006142	ATT	2	6	8123	8128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473223
119	NC_006142	TAG	2	6	8130	8135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473223
120	NC_006142	AGC	2	6	8260	8265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473223
121	NC_006142	CTT	2	6	8334	8339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473223
122	NC_006142	TAG	2	6	8382	8387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473223
123	NC_006142	TAC	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473223
124	NC_006142	TTC	2	6	9321	9326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473224
125	NC_006142	GAT	2	6	9435	9440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473224
126	NC_006142	CAA	2	6	9491	9496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473224
127	NC_006142	GCT	2	6	9544	9549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473224
128	NC_006142	GTA	2	6	9613	9618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473224
129	NC_006142	GAT	2	6	9733	9738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473224
130	NC_006142	TGC	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473224
131	NC_006142	AGT	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473224
132	NC_006142	AAG	2	6	9869	9874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473224
133	NC_006142	TAT	2	6	9960	9965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473224
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258	NC_006142	TAA	2	6	17962	17967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473229
259	NC_006142	ATT	2	6	17991	17996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473229
260	NC_006142	TCA	2	6	18019	18024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473229
261	NC_006142	TCA	2	6	19685	19690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473230
262	NC_006142	CTC	2	6	19848	19853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473230
263	NC_006142	ATG	2	6	19872	19877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473230
264	NC_006142	TAA	2	6	19893	19898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473230
265	NC_006142	TCT	2	6	19904	19909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473230
266	NC_006142	TGC	2	6	19912	19917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473230
267	NC_006142	TAT	2	6	19977	19982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473230
268	NC_006142	AAC	2	6	20253	20258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473231
269	NC_006142	TAT	2	6	20321	20326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473231
270	NC_006142	TGC	2	6	20436	20441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473231
271	NC_006142	CTG	2	6	20473	20478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473231
272	NC_006142	ATC	2	6	20744	20749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473231
273	NC_006142	AAT	2	6	20768	20773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473231
274	NC_006142	ATA	2	6	20901	20906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473231
275	NC_006142	TAA	2	6	20911	20916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473231
276	NC_006142	TAG	2	6	20923	20928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473231
277	NC_006142	ATT	2	6	20967	20972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473231
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280	NC_006142	TAT	2	6	21011	21016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473231
281	NC_006142	TAA	2	6	21066	21071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473232
282	NC_006142	TGC	2	6	21078	21083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473232
283	NC_006142	CTT	2	6	21095	21100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473232
284	NC_006142	TGA	2	6	21162	21167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473232
285	NC_006142	CTA	2	6	21217	21222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473232
286	NC_006142	TAT	2	6	21380	21385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473232
287	NC_006142	CCT	2	6	21400	21405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473232
288	NC_006142	CAA	2	6	21461	21466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473232
289	NC_006142	ATT	2	6	21727	21732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473232
290	NC_006142	TAA	2	6	21811	21816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473233
291	NC_006142	CCA	2	6	21833	21838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473233
292	NC_006142	TTG	2	6	21847	21852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473233
293	NC_006142	CTA	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473233
294	NC_006142	TAT	2	6	21937	21942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473233
295	NC_006142	ATA	2	6	22011	22016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473233
296	NC_006142	CAT	2	6	22159	22164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473233
297	NC_006142	CAC	2	6	22255	22260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473233
298	NC_006142	ATA	2	6	22422	22427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473233
299	NC_006142	TAA	2	6	22435	22440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473233
300	NC_006142	AAG	2	6	22468	22473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473233
301	NC_006142	TTA	2	6	22494	22499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473233
302	NC_006142	TAT	2	6	22507	22512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473233
303	NC_006142	GCA	2	6	22790	22795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473234
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310	NC_006142	CCA	2	6	23150	23155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473234
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336	NC_006142	GCA	2	6	24477	24482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473235
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348	NC_006142	AAG	2	6	25230	25235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473236
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372	NC_006142	ATC	2	6	27237	27242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473239
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382	NC_006142	ATA	2	6	27743	27748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473239
383	NC_006142	AGG	2	6	27779	27784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473239
384	NC_006142	TAA	2	6	27919	27924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473239
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386	NC_006142	CCA	2	6	27963	27968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473239
387	NC_006142	CCA	2	6	28019	28024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473239
388	NC_006142	TTC	2	6	28025	28030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473239
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392	NC_006142	TAT	2	6	28138	28143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473239
393	NC_006142	ATT	2	6	28238	28243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473240
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400	NC_006142	ATA	2	6	28643	28648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473240
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453	NC_006142	ATT	2	6	31539	31544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473241
454	NC_006142	ACC	2	6	31548	31553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473241
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497	NC_006142	TAA	2	6	34029	34034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473242
498	NC_006142	TAA	2	6	34084	34089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473242
499	NC_006142	CTA	2	6	34185	34190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473242
500	NC_006142	AAG	2	6	34232	34237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473242

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