MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 2786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006142	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	51473216
2	NC_006142	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	51473216
3	NC_006142	AT	3	6	1549	1554	50 %	50 %	0 %	0 %	51473218
4	NC_006142	TA	3	6	1667	1672	50 %	50 %	0 %	0 %	51473218
5	NC_006142	TA	3	6	2404	2409	50 %	50 %	0 %	0 %	51473219
6	NC_006142	TC	3	6	3294	3299	0 %	50 %	0 %	50 %	51473220
7	NC_006142	GA	3	6	3476	3481	50 %	0 %	50 %	0 %	51473220
8	NC_006142	AT	4	8	3914	3921	50 %	50 %	0 %	0 %	51473220
9	NC_006142	AT	3	6	4224	4229	50 %	50 %	0 %	0 %	51473220
10	NC_006142	GA	3	6	4244	4249	50 %	0 %	50 %	0 %	51473220
11	NC_006142	TA	3	6	4583	4588	50 %	50 %	0 %	0 %	51473220
12	NC_006142	AT	3	6	4775	4780	50 %	50 %	0 %	0 %	51473220
13	NC_006142	AT	3	6	5788	5793	50 %	50 %	0 %	0 %	51473220
14	NC_006142	TA	3	6	5952	5957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006142	TC	3	6	6565	6570	0 %	50 %	0 %	50 %	51473221
16	NC_006142	GA	3	6	7018	7023	50 %	0 %	50 %	0 %	51473222
17	NC_006142	AT	3	6	7353	7358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006142	TA	3	6	8071	8076	50 %	50 %	0 %	0 %	51473223
19	NC_006142	TA	3	6	8503	8508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006142	TG	3	6	8680	8685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006142	TA	3	6	8928	8933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006142	TA	4	8	8983	8990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006142	TG	3	6	9502	9507	0 %	50 %	50 %	0 %	51473224
24	NC_006142	AT	3	6	10562	10567	50 %	50 %	0 %	0 %	51473225
25	NC_006142	AT	4	8	11627	11634	50 %	50 %	0 %	0 %	51473226
26	NC_006142	TA	3	6	11650	11655	50 %	50 %	0 %	0 %	51473226
27	NC_006142	AT	3	6	12047	12052	50 %	50 %	0 %	0 %	51473227
28	NC_006142	TA	3	6	12424	12429	50 %	50 %	0 %	0 %	51473227
29	NC_006142	CT	3	6	12515	12520	0 %	50 %	0 %	50 %	51473227
30	NC_006142	TA	3	6	13112	13117	50 %	50 %	0 %	0 %	51473228
31	NC_006142	AT	3	6	13494	13499	50 %	50 %	0 %	0 %	51473228
32	NC_006142	TA	4	8	13886	13893	50 %	50 %	0 %	0 %	51473228
33	NC_006142	TC	3	6	13991	13996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006142	AT	3	6	14063	14068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006142	AT	3	6	14556	14561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006142	AT	3	6	14597	14602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006142	TA	4	8	17671	17678	50 %	50 %	0 %	0 %	51473229
38	NC_006142	AT	3	6	17730	17735	50 %	50 %	0 %	0 %	51473229
39	NC_006142	AT	3	6	18140	18145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006142	TA	4	8	18652	18659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006142	AT	3	6	19235	19240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006142	AT	3	6	19733	19738	50 %	50 %	0 %	0 %	51473230
43	NC_006142	TA	4	8	20110	20117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006142	CT	4	8	20337	20344	0 %	50 %	0 %	50 %	51473231
45	NC_006142	CT	3	6	20459	20464	0 %	50 %	0 %	50 %	51473231
46	NC_006142	TA	3	6	20552	20557	50 %	50 %	0 %	0 %	51473231
47	NC_006142	GA	3	6	20623	20628	50 %	0 %	50 %	0 %	51473231
48	NC_006142	TA	3	6	20794	20799	50 %	50 %	0 %	0 %	51473231
49	NC_006142	AT	3	6	21198	21203	50 %	50 %	0 %	0 %	51473232
50	NC_006142	AT	3	6	21342	21347	50 %	50 %	0 %	0 %	51473232
51	NC_006142	TA	3	6	21432	21437	50 %	50 %	0 %	0 %	51473232
52	NC_006142	AC	3	6	21979	21984	50 %	0 %	0 %	50 %	51473233
53	NC_006142	TA	3	6	22106	22111	50 %	50 %	0 %	0 %	51473233
54	NC_006142	AT	4	8	22149	22156	50 %	50 %	0 %	0 %	51473233
55	NC_006142	TA	3	6	22208	22213	50 %	50 %	0 %	0 %	51473233
56	NC_006142	AT	3	6	22360	22365	50 %	50 %	0 %	0 %	51473233
57	NC_006142	AT	3	6	22633	22638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006142	TA	3	6	22662	22667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006142	AT	3	6	23688	23693	50 %	50 %	0 %	0 %	51473234
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63	NC_006142	AT	3	6	26954	26959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66	NC_006142	AT	3	6	28454	28459	50 %	50 %	0 %	0 %	51473240
67	NC_006142	TA	3	6	29325	29330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006142	AT	3	6	30558	30563	50 %	50 %	0 %	0 %	51473241
69	NC_006142	AT	3	6	31695	31700	50 %	50 %	0 %	0 %	51473241
70	NC_006142	AT	3	6	31884	31889	50 %	50 %	0 %	0 %	51473241
71	NC_006142	AT	4	8	31948	31955	50 %	50 %	0 %	0 %	51473241
72	NC_006142	TA	4	8	32250	32257	50 %	50 %	0 %	0 %	51473241
73	NC_006142	TA	3	6	32904	32909	50 %	50 %	0 %	0 %	51473241
74	NC_006142	AT	3	6	33263	33268	50 %	50 %	0 %	0 %	51473242
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82	NC_006142	TA	3	6	37959	37964	50 %	50 %	0 %	0 %	51473243
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90	NC_006142	AT	3	6	42983	42988	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
91	NC_006142	AT	3	6	43124	43129	50 %	50 %	0 %	0 %	51473245
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99	NC_006142	AT	3	6	45037	45042	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
100	NC_006142	AT	3	6	45057	45062	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
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104	NC_006142	AT	3	6	46557	46562	50 %	50 %	0 %	0 %	51473246
105	NC_006142	TA	3	6	47085	47090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_006142	TA	3	6	48944	48949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006142	AT	3	6	48965	48970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006142	AT	3	6	49529	49534	50 %	50 %	0 %	0 %	51473250
111	NC_006142	TA	3	6	49593	49598	50 %	50 %	0 %	0 %	51473250
112	NC_006142	AT	3	6	49784	49789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006142	TA	3	6	49871	49876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006142	AT	4	8	50627	50634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006142	AT	3	6	50841	50846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006142	TA	3	6	51983	51988	50 %	50 %	0 %	0 %	51473252
117	NC_006142	TA	3	6	52285	52290	50 %	50 %	0 %	0 %	51473253
118	NC_006142	TA	3	6	52414	52419	50 %	50 %	0 %	0 %	51473253
119	NC_006142	AT	4	8	52975	52982	50 %	50 %	0 %	0 %	51473254
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122	NC_006142	TA	3	6	54949	54954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006142	TA	3	6	56091	56096	50 %	50 %	0 %	0 %	51473256
124	NC_006142	TA	3	6	56246	56251	50 %	50 %	0 %	0 %	51473256
125	NC_006142	AT	3	6	56263	56268	50 %	50 %	0 %	0 %	51473256
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127	NC_006142	AT	3	6	56838	56843	50 %	50 %	0 %	0 %	51473257
128	NC_006142	TA	3	6	57168	57173	50 %	50 %	0 %	0 %	51473257
129	NC_006142	GA	3	6	57213	57218	50 %	0 %	50 %	0 %	51473257
130	NC_006142	TA	3	6	57238	57243	50 %	50 %	0 %	0 %	51473257
131	NC_006142	AT	3	6	57880	57885	50 %	50 %	0 %	0 %	51473258
132	NC_006142	TA	3	6	58438	58443	50 %	50 %	0 %	0 %	51473258
133	NC_006142	AT	3	6	58507	58512	50 %	50 %	0 %	0 %	51473258
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136	NC_006142	CT	3	6	59862	59867	0 %	50 %	0 %	50 %	51473260
137	NC_006142	TA	3	6	60571	60576	50 %	50 %	0 %	0 %	51473260
138	NC_006142	AC	3	6	60794	60799	50 %	0 %	0 %	50 %	51473260
139	NC_006142	AT	3	6	61102	61107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006142	AT	3	6	61453	61458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006142	TA	3	6	61679	61684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_006142	CA	3	6	63113	63118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_006142	AT	3	6	63831	63836	50 %	50 %	0 %	0 %	51473262
147	NC_006142	AT	4	8	63909	63916	50 %	50 %	0 %	0 %	51473262
148	NC_006142	AT	3	6	64169	64174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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