MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	AAGAAA	2	12	312	323	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006139	TTGAGC	2	12	2890	2901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	51246972
3	NC_006139	TTCGCT	2	12	8065	8076	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006139	AGCAAA	2	12	11551	11562	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	51246980
5	NC_006139	ATTTTT	2	12	15912	15923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51246985
6	NC_006139	GCTGGT	2	12	19088	19099	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	51246987
7	NC_006139	AACAAA	2	12	20063	20074	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	51246989
8	NC_006139	AAGATG	2	12	24975	24986	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	51246993
9	NC_006139	GATAGA	2	12	25404	25415	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	51246994
10	NC_006139	TTTTCT	2	12	35987	35998	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	51247006
11	NC_006139	GATCGA	2	12	41491	41502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	51247011
12	NC_006139	GCCCTG	2	12	42071	42082	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	51247011
13	NC_006139	TTGACC	2	12	43663	43674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	51247013
14	NC_006139	AATATG	2	12	44701	44712	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	51247014
15	NC_006139	TATGTT	3	18	45923	45940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006139	GGAGAA	2	12	51872	51883	50 %	0 %	50 %	0 %	51247022
17	NC_006139	AACAAA	2	12	52477	52488	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	51247024
18	NC_006139	TGACTT	2	12	52720	52731	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006139	TATCAA	2	12	53734	53745	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51247025
20	NC_006139	GTTGCC	2	12	57081	57092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51247026
21	NC_006139	GAAACA	2	12	57456	57467	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	51247026
22	NC_006139	CGGTAA	2	12	58287	58298	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	51247027
23	NC_006139	CGGTAT	2	12	61422	61433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	51247027
24	NC_006139	AAGCCC	2	12	63706	63717	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	51247027
25	NC_006139	CCGCCA	2	12	68195	68206	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	51247027
26	NC_006139	GCAATA	2	12	68276	68287	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	51247027
27	NC_006139	GTCACA	2	12	69473	69484	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	51247027
28	NC_006139	ATTAAT	2	12	70420	70431	50 %	50 %	0 %	0 %	51247027
29	NC_006139	CTCAAA	2	12	75720	75731	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	51247032
30	NC_006139	TTTTAC	2	12	78904	78915	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006139	TTTTTG	2	12	87675	87686	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006139	TTGCAT	2	12	89102	89113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	51247044
33	NC_006139	CAAAAA	2	12	100341	100352	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_006139	GACCTG	2	12	107172	107183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	51247057
35	NC_006139	AAAGGT	2	12	118428	118439	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	51247069
36	NC_006139	TTTTTG	2	12	120402	120413	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	51247071

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.