MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	GTTTT	2	10	19	28	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006139	GGTTT	2	10	121	130	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006139	TAAGG	2	10	410	419	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006139	CGCTA	2	10	4519	4528	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_006139	AAATC	2	10	5668	5677	60 %	20 %	0 %	20 %	51246975
6	NC_006139	GTGAG	2	10	6134	6143	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006139	CCACT	2	10	6667	6676	20 %	20 %	0 %	60 %	51246976
8	NC_006139	AAATC	2	10	7018	7027	60 %	20 %	0 %	20 %	51246976
9	NC_006139	ACTTC	2	10	7878	7887	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_006139	TTTTA	2	10	8599	8608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006139	CAAAC	2	10	8961	8970	60 %	0 %	0 %	40 %	51246977
12	NC_006139	AACCT	2	10	12593	12602	40 %	20 %	0 %	40 %	51246982
13	NC_006139	CAAAA	2	10	13294	13303	80 %	0 %	0 %	20 %	51246983
14	NC_006139	GCTTT	2	10	14241	14250	0 %	60 %	20 %	20 %	51246985
15	NC_006139	CAAAC	2	10	14822	14831	60 %	0 %	0 %	40 %	51246985
16	NC_006139	CAACT	2	10	22490	22499	40 %	20 %	0 %	40 %	51246991
17	NC_006139	GAGAA	2	10	24217	24226	60 %	0 %	40 %	0 %	51246993
18	NC_006139	CAAAA	2	10	25007	25016	80 %	0 %	0 %	20 %	51246994
19	NC_006139	ATATG	2	10	25714	25723	40 %	40 %	20 %	0 %	51246994
20	NC_006139	TCTCT	2	10	25883	25892	0 %	60 %	0 %	40 %	51246994
21	NC_006139	ATCTA	2	10	26054	26063	40 %	40 %	0 %	20 %	51246994
22	NC_006139	TTTTG	2	10	26112	26121	0 %	80 %	20 %	0 %	51246994
23	NC_006139	ATTTT	2	10	26381	26390	20 %	80 %	0 %	0 %	51246994
24	NC_006139	GTCAT	2	10	27677	27686	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_006139	CCGAT	2	10	28111	28120	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_006139	TATTT	2	10	29646	29655	20 %	80 %	0 %	0 %	51246999
27	NC_006139	TAATT	2	10	30211	30220	40 %	60 %	0 %	0 %	51246999
28	NC_006139	TCCAT	2	10	30917	30926	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_006139	GATCT	2	10	32081	32090	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_006139	CAATT	2	10	32470	32479	40 %	40 %	0 %	20 %	51247000
31	NC_006139	ACAAA	2	10	32665	32674	80 %	0 %	0 %	20 %	51247000
32	NC_006139	ATTCT	2	10	33655	33664	20 %	60 %	0 %	20 %	51247002
33	NC_006139	TTTAT	2	10	34142	34151	20 %	80 %	0 %	0 %	51247003
34	NC_006139	GTTTT	2	10	36091	36100	0 %	80 %	20 %	0 %	51247006
35	NC_006139	TAGCG	2	10	36103	36112	20 %	20 %	40 %	20 %	51247006
36	NC_006139	GATCA	2	10	40657	40666	40 %	20 %	20 %	20 %	51247010
37	NC_006139	CCGAT	2	10	44355	44364	20 %	20 %	20 %	40 %	51247014
38	NC_006139	CTTTT	2	10	44569	44578	0 %	80 %	0 %	20 %	51247014
39	NC_006139	TTGTT	2	10	46085	46094	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006139	CCAAA	2	10	46356	46365	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_006139	GCAAC	2	10	46962	46971	40 %	0 %	20 %	40 %	51247016
42	NC_006139	TTCTC	2	10	48735	48744	0 %	60 %	0 %	40 %	51247018
43	NC_006139	GATGA	2	10	49345	49354	40 %	20 %	40 %	0 %	51247019
44	NC_006139	CCTTC	2	10	50247	50256	0 %	40 %	0 %	60 %	51247020
45	NC_006139	AGATA	2	10	50812	50821	60 %	20 %	20 %	0 %	51247021
46	NC_006139	TTTGG	2	10	53001	53010	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006139	ATTTC	2	10	53562	53571	20 %	60 %	0 %	20 %	51247025
48	NC_006139	CTTCT	2	10	55347	55356	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_006139	ATATT	2	10	55636	55645	40 %	60 %	0 %	0 %	51247026
50	NC_006139	GATTT	2	10	58397	58406	20 %	60 %	20 %	0 %	51247027
51	NC_006139	CTGCC	2	10	60930	60939	0 %	20 %	20 %	60 %	51247027
52	NC_006139	CCCGT	2	10	61976	61985	0 %	20 %	20 %	60 %	51247027
53	NC_006139	CCATA	2	10	63432	63441	40 %	20 %	0 %	40 %	51247027
54	NC_006139	ACCAC	2	10	66806	66815	40 %	0 %	0 %	60 %	51247027
55	NC_006139	TGTCG	2	10	67459	67468	0 %	40 %	40 %	20 %	51247027
56	NC_006139	CCATT	2	10	70323	70332	20 %	40 %	0 %	40 %	51247027
57	NC_006139	CCGAT	2	10	72985	72994	20 %	20 %	20 %	40 %	51247028
58	NC_006139	TTGTT	2	10	74400	74409	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006139	CAGTA	2	10	75570	75579	40 %	20 %	20 %	20 %	51247032
60	NC_006139	TTGTT	2	10	77212	77221	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006139	TCTCT	2	10	77470	77479	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_006139	ATAAA	2	10	83972	83981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006139	TCGAC	2	10	86037	86046	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_006139	ATGGA	2	10	86555	86564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006139	ATTTT	2	10	87736	87745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006139	CAAAA	2	10	89883	89892	80 %	0 %	0 %	20 %	51247045
67	NC_006139	TATTT	2	10	90638	90647	20 %	80 %	0 %	0 %	51247046
68	NC_006139	TAAAA	2	10	90788	90797	80 %	20 %	0 %	0 %	51247046
69	NC_006139	TCTTA	2	10	91028	91037	20 %	60 %	0 %	20 %	51247046
70	NC_006139	AAATG	2	10	92411	92420	60 %	20 %	20 %	0 %	51247047
71	NC_006139	TAAAA	2	10	92536	92545	80 %	20 %	0 %	0 %	51247047
72	NC_006139	TAATA	2	10	92696	92705	60 %	40 %	0 %	0 %	51247047
73	NC_006139	AGAAT	2	10	93958	93967	60 %	20 %	20 %	0 %	51247048
74	NC_006139	ATGAA	2	10	96743	96752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006139	CCTGC	2	10	97339	97348	0 %	20 %	20 %	60 %	51247050
76	NC_006139	TACAA	2	10	97407	97416	60 %	20 %	0 %	20 %	51247050
77	NC_006139	GCCAG	2	10	97658	97667	20 %	0 %	40 %	40 %	51247050
78	NC_006139	GAAAA	2	10	98208	98217	80 %	0 %	20 %	0 %	51247050
79	NC_006139	AAAAT	2	10	98861	98870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006139	AACCG	2	10	99164	99173	40 %	0 %	20 %	40 %	51247051
81	NC_006139	GCATG	2	10	99390	99399	20 %	20 %	40 %	20 %	51247051
82	NC_006139	AAAAC	2	10	99700	99709	80 %	0 %	0 %	20 %	51247051
83	NC_006139	GGGCA	2	10	103726	103735	20 %	0 %	60 %	20 %	51247054
84	NC_006139	CCGAG	2	10	103855	103864	20 %	0 %	40 %	40 %	51247054
85	NC_006139	GCTCA	2	10	105994	106003	20 %	20 %	20 %	40 %	51247056
86	NC_006139	AAAAC	2	10	109797	109806	80 %	0 %	0 %	20 %	51247061
87	NC_006139	AAACG	2	10	112341	112350	60 %	0 %	20 %	20 %	51247062
88	NC_006139	ACCTT	2	10	112631	112640	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_006139	TGGAT	2	10	112906	112915	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006139	GCGAG	2	10	116137	116146	20 %	0 %	60 %	20 %	51247066
91	NC_006139	TACTC	2	10	117133	117142	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_006139	ATCTC	2	10	118628	118637	20 %	40 %	0 %	40 %	51247069
93	NC_006139	AACCA	2	10	119806	119815	60 %	0 %	0 %	40 %	51247071
94	NC_006139	GAGCA	2	10	120382	120391	40 %	0 %	40 %	20 %	51247071
95	NC_006139	GGTGG	2	10	121354	121363	0 %	20 %	80 %	0 %	51247072

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.