MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	GTTTT	2	10	19	28	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006139	GGTTT	2	10	121	130	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006139	TAAGG	2	10	410	419	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006139	CGCTA	2	10	4519	4528	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_006139	GTGAG	2	10	6134	6143	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006139	ACTTC	2	10	7878	7887	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_006139	TTTTA	2	10	8599	8608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006139	GTCAT	2	10	27677	27686	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_006139	CCGAT	2	10	28111	28120	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_006139	TCCAT	2	10	30917	30926	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006139	GATCT	2	10	32081	32090	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006139	TTGTT	2	10	46085	46094	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006139	CCAAA	2	10	46356	46365	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_006139	TTTGG	2	10	53001	53010	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006139	CTTCT	2	10	55347	55356	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_006139	TTGTT	2	10	74400	74409	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006139	TTGTT	2	10	77212	77221	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006139	TCTCT	2	10	77470	77479	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_006139	ATAAA	2	10	83972	83981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006139	TCGAC	2	10	86037	86046	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_006139	ATGGA	2	10	86555	86564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006139	ATTTT	2	10	87736	87745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006139	ATGAA	2	10	96743	96752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006139	AAAAT	2	10	98861	98870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006139	ACCTT	2	10	112631	112640	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_006139	TGGAT	2	10	112906	112915	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006139	TACTC	2	10	117133	117142	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.