MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 321

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	GTTG	2	8	81	88	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006139	GATA	2	8	425	432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006139	TAAA	2	8	935	942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006139	TACA	2	8	2002	2009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006139	CTTT	2	8	2085	2092	0 %	75 %	0 %	25 %	51246972
6	NC_006139	CCAA	2	8	2503	2510	50 %	0 %	0 %	50 %	51246972
7	NC_006139	TCAG	2	8	3200	3207	25 %	25 %	25 %	25 %	51246973
8	NC_006139	ATTT	2	8	3510	3517	25 %	75 %	0 %	0 %	51246974
9	NC_006139	TGTT	2	8	4270	4277	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006139	GCTC	2	8	5272	5279	0 %	25 %	25 %	50 %	51246975
11	NC_006139	CGTA	2	8	6179	6186	25 %	25 %	25 %	25 %	51246976
12	NC_006139	AGAT	2	8	6861	6868	50 %	25 %	25 %	0 %	51246976
13	NC_006139	TGCC	2	8	6920	6927	0 %	25 %	25 %	50 %	51246976
14	NC_006139	GATG	2	8	7158	7165	25 %	25 %	50 %	0 %	51246976
15	NC_006139	TAAA	2	8	7719	7726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006139	CACT	2	8	8083	8090	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006139	CTTC	2	8	8099	8106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006139	CAAA	2	8	8209	8216	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006139	CCCT	2	8	8399	8406	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_006139	AAAT	2	8	8725	8732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006139	GATA	2	8	8868	8875	50 %	25 %	25 %	0 %	51246977
22	NC_006139	ATTC	2	8	9201	9208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006139	AGTA	2	8	9334	9341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006139	GGCT	2	8	9390	9397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006139	GTTT	2	8	9418	9425	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006139	CTGA	2	8	9641	9648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_006139	CAAA	2	8	9908	9915	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006139	TGTT	2	8	10117	10124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006139	AGCA	2	8	10405	10412	50 %	0 %	25 %	25 %	51246978
30	NC_006139	GCTG	2	8	10500	10507	0 %	25 %	50 %	25 %	51246978
31	NC_006139	ACAA	2	8	10676	10683	75 %	0 %	0 %	25 %	51246979
32	NC_006139	AATC	2	8	10810	10817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006139	CAAA	2	8	10833	10840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006139	ATAA	2	8	10980	10987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006139	ATTT	2	8	11036	11043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006139	ATTT	2	8	11078	11085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006139	TAAT	2	8	11787	11794	50 %	50 %	0 %	0 %	51246981
38	NC_006139	GGTA	2	8	11818	11825	25 %	25 %	50 %	0 %	51246981
39	NC_006139	GCAG	2	8	12160	12167	25 %	0 %	50 %	25 %	51246981
40	NC_006139	ACAA	2	8	12284	12291	75 %	0 %	0 %	25 %	51246981
41	NC_006139	AAGA	2	8	12329	12336	75 %	0 %	25 %	0 %	51246981
42	NC_006139	GCTT	2	8	12465	12472	0 %	50 %	25 %	25 %	51246981
43	NC_006139	CCTC	2	8	13075	13082	0 %	25 %	0 %	75 %	51246983
44	NC_006139	CAGA	2	8	13513	13520	50 %	0 %	25 %	25 %	51246983
45	NC_006139	CTGT	2	8	14283	14290	0 %	50 %	25 %	25 %	51246985
46	NC_006139	ATCA	2	8	14566	14573	50 %	25 %	0 %	25 %	51246985
47	NC_006139	CGTT	2	8	16167	16174	0 %	50 %	25 %	25 %	51246985
48	NC_006139	ATTT	2	8	16587	16594	25 %	75 %	0 %	0 %	51246985
49	NC_006139	CTTT	2	8	16761	16768	0 %	75 %	0 %	25 %	51246985
50	NC_006139	GTTT	2	8	16906	16913	0 %	75 %	25 %	0 %	51246986
51	NC_006139	CCAA	2	8	17498	17505	50 %	0 %	0 %	50 %	51246986
52	NC_006139	AGTA	2	8	17556	17563	50 %	25 %	25 %	0 %	51246986
53	NC_006139	TAAT	2	8	18123	18130	50 %	50 %	0 %	0 %	51246987
54	NC_006139	TGGC	2	8	18960	18967	0 %	25 %	50 %	25 %	51246987
55	NC_006139	TTTA	2	8	19425	19432	25 %	75 %	0 %	0 %	51246988
56	NC_006139	CATA	2	8	19522	19529	50 %	25 %	0 %	25 %	51246988
57	NC_006139	ACCA	2	8	19869	19876	50 %	0 %	0 %	50 %	51246988
58	NC_006139	TCTT	2	8	19923	19930	0 %	75 %	0 %	25 %	51246988
59	NC_006139	TTTA	2	8	20572	20579	25 %	75 %	0 %	0 %	51246989
60	NC_006139	ACCA	2	8	20586	20593	50 %	0 %	0 %	50 %	51246989
61	NC_006139	CATT	2	8	20855	20862	25 %	50 %	0 %	25 %	51246989
62	NC_006139	AAAT	2	8	20944	20951	75 %	25 %	0 %	0 %	51246989
63	NC_006139	CAAA	2	8	21574	21581	75 %	0 %	0 %	25 %	51246991
64	NC_006139	TACC	2	8	21605	21612	25 %	25 %	0 %	50 %	51246991
65	NC_006139	GAGG	2	8	22017	22024	25 %	0 %	75 %	0 %	51246991
66	NC_006139	CCTT	2	8	22704	22711	0 %	50 %	0 %	50 %	51246992
67	NC_006139	AATC	2	8	22940	22947	50 %	25 %	0 %	25 %	51246993
68	NC_006139	AAGG	2	8	22960	22967	50 %	0 %	50 %	0 %	51246993
69	NC_006139	GATG	2	8	23093	23100	25 %	25 %	50 %	0 %	51246993
70	NC_006139	AAAC	2	8	23256	23263	75 %	0 %	0 %	25 %	51246993
71	NC_006139	CAAC	2	8	23648	23655	50 %	0 %	0 %	50 %	51246993
72	NC_006139	AAAG	2	8	23791	23798	75 %	0 %	25 %	0 %	51246993
73	NC_006139	CAAA	2	8	23934	23941	75 %	0 %	0 %	25 %	51246993
74	NC_006139	GGCA	2	8	23958	23965	25 %	0 %	50 %	25 %	51246993
75	NC_006139	ACCA	2	8	24011	24018	50 %	0 %	0 %	50 %	51246993
76	NC_006139	GGCT	2	8	24138	24145	0 %	25 %	50 %	25 %	51246993
77	NC_006139	GAAA	2	8	24406	24413	75 %	0 %	25 %	0 %	51246993
78	NC_006139	TTCT	2	8	24558	24565	0 %	75 %	0 %	25 %	51246993
79	NC_006139	ATAC	2	8	25031	25038	50 %	25 %	0 %	25 %	51246994
80	NC_006139	TACC	2	8	25501	25508	25 %	25 %	0 %	50 %	51246994
81	NC_006139	ATGG	2	8	26130	26137	25 %	25 %	50 %	0 %	51246994
82	NC_006139	GTTT	2	8	26206	26213	0 %	75 %	25 %	0 %	51246994
83	NC_006139	TCAA	2	8	26833	26840	50 %	25 %	0 %	25 %	51246995
84	NC_006139	CCCA	2	8	26977	26984	25 %	0 %	0 %	75 %	51246996
85	NC_006139	TACT	2	8	27410	27417	25 %	50 %	0 %	25 %	51246997
86	NC_006139	CCAA	2	8	27751	27758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_006139	AATT	2	8	27804	27811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006139	GACA	2	8	27948	27955	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_006139	CATA	2	8	28176	28183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_006139	CTAA	2	8	28754	28761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_006139	GAAA	2	8	28889	28896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006139	TACT	2	8	29447	29454	25 %	50 %	0 %	25 %	51246999
93	NC_006139	AAAT	2	8	29659	29666	75 %	25 %	0 %	0 %	51246999
94	NC_006139	GAAT	2	8	30096	30103	50 %	25 %	25 %	0 %	51246999
95	NC_006139	TATC	2	8	30305	30312	25 %	50 %	0 %	25 %	51246999
96	NC_006139	TAAA	2	8	30378	30385	75 %	25 %	0 %	0 %	51246999
97	NC_006139	CAAA	2	8	30656	30663	75 %	0 %	0 %	25 %	51246999
98	NC_006139	ATCA	2	8	31238	31245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_006139	GGCA	2	8	31673	31680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_006139	TTGT	2	8	31854	31861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006139	CCAT	2	8	32068	32075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006139	ACAA	2	8	32361	32368	75 %	0 %	0 %	25 %	51247000
103	NC_006139	GATT	2	8	32969	32976	25 %	50 %	25 %	0 %	51247000
104	NC_006139	AAAG	2	8	33692	33699	75 %	0 %	25 %	0 %	51247002
105	NC_006139	GAAT	2	8	33956	33963	50 %	25 %	25 %	0 %	51247003
106	NC_006139	AAAT	2	8	34051	34058	75 %	25 %	0 %	0 %	51247003
107	NC_006139	TCCG	2	8	34368	34375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_006139	TGCT	2	8	34700	34707	0 %	50 %	25 %	25 %	51247004
109	NC_006139	AAAT	2	8	35213	35220	75 %	25 %	0 %	0 %	51247004
110	NC_006139	CTGG	2	8	35606	35613	0 %	25 %	50 %	25 %	51247005
111	NC_006139	TTTC	2	8	36081	36088	0 %	75 %	0 %	25 %	51247006
112	NC_006139	TAAA	2	8	36190	36197	75 %	25 %	0 %	0 %	51247006
113	NC_006139	GAAT	2	8	37101	37108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006139	ATTG	2	8	37527	37534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006139	CAGA	2	8	37551	37558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_006139	GGAC	2	8	37694	37701	25 %	0 %	50 %	25 %	51247008
117	NC_006139	GCTG	2	8	37786	37793	0 %	25 %	50 %	25 %	51247008
118	NC_006139	GCGA	2	8	38089	38096	25 %	0 %	50 %	25 %	51247008
119	NC_006139	GTAC	2	8	38321	38328	25 %	25 %	25 %	25 %	51247008
120	NC_006139	ATTG	2	8	39095	39102	25 %	50 %	25 %	0 %	51247008
121	NC_006139	GCGG	2	8	40413	40420	0 %	0 %	75 %	25 %	51247010
122	NC_006139	CGGG	2	8	40697	40704	0 %	0 %	75 %	25 %	51247010
123	NC_006139	GCCT	2	8	41654	41661	0 %	25 %	25 %	50 %	51247011
124	NC_006139	GCTG	2	8	41994	42001	0 %	25 %	50 %	25 %	51247011
125	NC_006139	GGCC	2	8	42805	42812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_006139	TTAT	2	8	42888	42895	25 %	75 %	0 %	0 %	51247013
127	NC_006139	CAGA	2	8	43061	43068	50 %	0 %	25 %	25 %	51247013
128	NC_006139	GACT	2	8	43391	43398	25 %	25 %	25 %	25 %	51247013
129	NC_006139	ATCA	2	8	44683	44690	50 %	25 %	0 %	25 %	51247014
130	NC_006139	TTAT	2	8	45079	45086	25 %	75 %	0 %	0 %	51247015
131	NC_006139	AGTT	2	8	45155	45162	25 %	50 %	25 %	0 %	51247015
132	NC_006139	CTTT	2	8	45395	45402	0 %	75 %	0 %	25 %	51247015
133	NC_006139	TGCT	2	8	45543	45550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_006139	TGCT	2	8	45554	45561	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_006139	TTGC	2	8	45564	45571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_006139	GCAA	2	8	45718	45725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_006139	AGCA	2	8	45750	45757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_006139	TGTT	2	8	45901	45908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006139	TTTA	2	8	45915	45922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006139	TTGT	2	8	45944	45951	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006139	AAAG	2	8	46035	46042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006139	GGGC	2	8	46578	46585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_006139	GCAA	2	8	46753	46760	50 %	0 %	25 %	25 %	51247016
144	NC_006139	TCCT	2	8	47203	47210	0 %	50 %	0 %	50 %	51247016
145	NC_006139	GTTC	2	8	47808	47815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_006139	CAAA	2	8	48013	48020	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_006139	ATTT	2	8	48458	48465	25 %	75 %	0 %	0 %	51247017
148	NC_006139	ATGA	2	8	48694	48701	50 %	25 %	25 %	0 %	51247018
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.