MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	GTTG	2	8	81	88	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006139	GATA	2	8	425	432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006139	TAAA	2	8	935	942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006139	TACA	2	8	2002	2009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006139	TGTT	2	8	4270	4277	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006139	TAAA	2	8	7719	7726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006139	CACT	2	8	8083	8090	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006139	CTTC	2	8	8099	8106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006139	CAAA	2	8	8209	8216	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006139	CCCT	2	8	8399	8406	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_006139	AAAT	2	8	8725	8732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006139	ATTC	2	8	9201	9208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006139	AGTA	2	8	9334	9341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006139	GGCT	2	8	9390	9397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006139	GTTT	2	8	9418	9425	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006139	CTGA	2	8	9641	9648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006139	CAAA	2	8	9908	9915	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006139	TGTT	2	8	10117	10124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006139	AATC	2	8	10810	10817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006139	CAAA	2	8	10833	10840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006139	ATAA	2	8	10980	10987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006139	ATTT	2	8	11036	11043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006139	ATTT	2	8	11078	11085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006139	CCAA	2	8	27751	27758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006139	AATT	2	8	27804	27811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006139	GACA	2	8	27948	27955	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_006139	CATA	2	8	28176	28183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006139	CTAA	2	8	28754	28761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_006139	GAAA	2	8	28889	28896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006139	ATCA	2	8	31238	31245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_006139	GGCA	2	8	31673	31680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006139	TTGT	2	8	31854	31861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006139	CCAT	2	8	32068	32075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006139	TCCG	2	8	34368	34375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006139	GAAT	2	8	37101	37108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006139	ATTG	2	8	37527	37534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006139	CAGA	2	8	37551	37558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006139	GGCC	2	8	42805	42812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006139	TGCT	2	8	45543	45550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_006139	TGCT	2	8	45554	45561	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006139	TTGC	2	8	45564	45571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006139	GCAA	2	8	45718	45725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_006139	AGCA	2	8	45750	45757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006139	TGTT	2	8	45901	45908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006139	TTTA	2	8	45915	45922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006139	TTGT	2	8	45944	45951	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006139	AAAG	2	8	46035	46042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006139	GGGC	2	8	46578	46585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006139	GTTC	2	8	47808	47815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_006139	CAAA	2	8	48013	48020	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006139	GTAT	2	8	49067	49074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006139	GCCC	2	8	50479	50486	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_006139	CTGT	2	8	52807	52814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006139	GCAA	2	8	55283	55290	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006139	ACCA	2	8	55332	55339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_006139	GAAA	2	8	72164	72171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006139	ATTA	2	8	72717	72724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006139	TTGC	2	8	74167	74174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006139	TGCT	2	8	74179	74186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_006139	TGTT	2	8	74191	74198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006139	TGTT	2	8	74215	74222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006139	TTTG	2	8	74261	74268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006139	AAAG	2	8	74350	74357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006139	TACT	2	8	77152	77159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_006139	GGGC	2	8	77702	77709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_006139	CGTG	2	8	78991	78998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_006139	CTGA	2	8	80263	80270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_006139	ATAA	2	8	84022	84029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006139	CTTC	2	8	84231	84238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_006139	AGAT	2	8	85706	85713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006139	CCAA	2	8	85784	85791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_006139	AGCA	2	8	86388	86395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006139	AATT	2	8	87663	87670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006139	CTGC	2	8	88063	88070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006139	ACTT	2	8	89298	89305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_006139	TGAT	2	8	89490	89497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006139	GAGT	2	8	96387	96394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006139	TGGG	2	8	96944	96951	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006139	TCAG	2	8	97173	97180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_006139	AACG	2	8	100359	100366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_006139	TTAG	2	8	100542	100549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006139	AGTT	2	8	112938	112945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006139	TTGC	2	8	114006	114013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_006139	ATCT	2	8	115458	115465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_006139	AAGA	2	8	117073	117080	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006139	CCTG	2	8	117227	117234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.