MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 327

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	AGA	2	6	33	38	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006139	AAG	2	6	55	60	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006139	GTT	2	6	90	95	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006139	GTT	2	6	111	116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006139	TAA	2	6	265	270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006139	GAC	2	6	302	307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006139	TAA	2	6	354	359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006139	TTA	2	6	466	471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006139	AAG	2	6	489	494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006139	GGT	2	6	566	571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006139	GGT	2	6	588	593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006139	GGT	2	6	610	615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006139	GGT	2	6	631	636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006139	GGT	2	6	652	657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006139	GGT	2	6	673	678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006139	GGT	2	6	745	750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006139	GGT	2	6	850	855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006139	GGT	2	6	871	876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006139	GGT	2	6	891	896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006139	TAA	2	6	972	977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006139	GGT	2	6	982	987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006139	CTT	2	6	1051	1056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006139	CTT	2	6	1075	1080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006139	CTT	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006139	CTT	2	6	1123	1128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006139	CTT	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006139	GGT	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006139	TGT	2	6	1222	1227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006139	GAT	2	6	1285	1290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006139	ATC	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006139	GGT	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006139	GTG	2	6	1375	1380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006139	GGT	2	6	1510	1515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006139	GTG	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006139	GAT	2	6	1605	1610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006139	GGT	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006139	GTG	2	6	1695	1700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006139	TGG	2	6	1711	1716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006139	GAT	2	6	1766	1771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006139	GGT	2	6	1831	1836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006139	GGT	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006139	TGT	2	6	4303	4308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006139	TCC	2	6	4384	4389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_006139	AGG	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006139	TTC	2	6	7537	7542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006139	CAG	2	6	7620	7625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006139	ACC	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_006139	AAC	2	6	7671	7676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006139	ACC	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_006139	TAA	2	6	7842	7847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006139	CTA	2	6	7848	7853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006139	ATC	2	6	7858	7863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006139	TGG	3	9	8258	8266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006139	TTG	2	6	8316	8321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006139	CAA	2	6	8626	8631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006139	AAC	2	6	9157	9162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006139	GCA	2	6	9236	9241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006139	CCA	2	6	9252	9257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_006139	TAA	2	6	9312	9317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006139	TGG	3	9	9554	9562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006139	CAA	2	6	9603	9608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006139	GGT	2	6	9688	9693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006139	ATG	2	6	9727	9732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006139	TGT	2	6	9756	9761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006139	ATC	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006139	AAC	2	6	9917	9922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006139	ATG	2	6	9931	9936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006139	TGT	2	6	9967	9972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006139	CTG	2	6	9973	9978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006139	TCA	2	6	10726	10731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006139	TTC	2	6	10738	10743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006139	ATT	2	6	10765	10770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006139	CAA	2	6	10824	10829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006139	CAT	2	6	10875	10880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006139	TCG	2	6	10920	10925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006139	CCA	2	6	10974	10979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_006139	CTT	2	6	11103	11108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006139	TAT	2	6	11262	11267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006139	CCG	2	6	11302	11307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_006139	AAC	2	6	11364	11369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006139	TTG	2	6	17739	17744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006139	TTA	2	6	19258	19263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006139	GCA	2	6	26418	26423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006139	AAC	2	6	27359	27364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006139	TTG	2	6	27696	27701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006139	CCT	2	6	27714	27719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_006139	AAC	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006139	CAA	3	9	27820	27828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006139	TTC	2	6	27854	27859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006139	TAC	2	6	27908	27913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006139	GTT	2	6	28014	28019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006139	AAG	2	6	28054	28059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006139	GCT	2	6	28082	28087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006139	CAT	2	6	28524	28529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006139	TTC	2	6	28627	28632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006139	CTG	2	6	28636	28641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006139	GGA	2	6	28909	28914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006139	GTT	2	6	28931	28936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006139	ATA	2	6	28988	28993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006139	TTG	2	6	30874	30879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006139	AAC	2	6	30934	30939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006139	GTT	2	6	31091	31096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006139	TAT	2	6	31106	31111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006139	CAT	2	6	31187	31192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_006139	CAA	2	6	31221	31226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006139	TGT	2	6	31369	31374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006139	CCA	2	6	31548	31553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_006139	AAT	2	6	31711	31716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006139	TCC	2	6	32014	32019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_006139	TTG	2	6	32164	32169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006139	AGG	2	6	32200	32205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006139	GTT	2	6	32280	32285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006139	TAA	2	6	35364	35369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006139	GAT	2	6	35821	35826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006139	GGC	2	6	35890	35895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006139	TAA	2	6	36607	36612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006139	TTA	2	6	36614	36619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006139	TAC	2	6	36701	36706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006139	TTG	2	6	36750	36755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006139	TCA	2	6	37242	37247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006139	CGG	2	6	37472	37477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006139	AAG	2	6	37512	37517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006139	CAG	2	6	42864	42869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006139	ACG	2	6	43912	43917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006139	TGG	2	6	43993	43998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006139	CGA	2	6	45712	45717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006139	TTA	2	6	45767	45772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006139	CAC	2	6	45874	45879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_006139	ACC	2	6	45995	46000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_006139	TCC	2	6	46009	46014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_006139	CCT	2	6	46061	46066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_006139	ACT	2	6	46076	46081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_006139	ACT	2	6	46124	46129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006139	TTA	2	6	46138	46143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006139	TCT	2	6	46167	46172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006139	TCG	2	6	46321	46326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006139	GAT	2	6	46329	46334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006139	TCT	2	6	46345	46350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_006139	ACA	2	6	46368	46373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006139	GGT	2	6	46496	46501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006139	GTA	2	6	46528	46533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006139	GTT	2	6	47703	47708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006139	TCT	2	6	47743	47748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_006139	ATC	2	6	47882	47887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_006139	CAT	2	6	107977	107982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_006139	CAT	2	6	110299	110304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_006139	TGC	2	6	112481	112486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.