MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	TG	3	6	181	186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006139	GT	3	6	200	205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006139	GT	3	6	220	225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006139	TG	3	6	1174	1179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006139	TA	3	6	2371	2376	50 %	50 %	0 %	0 %	51246972
6	NC_006139	CA	3	6	2603	2608	50 %	0 %	0 %	50 %	51246972
7	NC_006139	CA	3	6	2928	2933	50 %	0 %	0 %	50 %	51246972
8	NC_006139	AG	3	6	2995	3000	50 %	0 %	50 %	0 %	51246972
9	NC_006139	TC	3	6	3014	3019	0 %	50 %	0 %	50 %	51246972
10	NC_006139	TC	3	6	3115	3120	0 %	50 %	0 %	50 %	51246973
11	NC_006139	CT	3	6	3223	3228	0 %	50 %	0 %	50 %	51246973
12	NC_006139	AT	3	6	3282	3287	50 %	50 %	0 %	0 %	51246973
13	NC_006139	CT	3	6	3502	3507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006139	CG	3	6	4830	4835	0 %	0 %	50 %	50 %	51246975
15	NC_006139	CG	3	6	5374	5379	0 %	0 %	50 %	50 %	51246975
16	NC_006139	AT	3	6	8787	8792	50 %	50 %	0 %	0 %	51246977
17	NC_006139	AT	3	6	9278	9283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006139	AG	3	6	9367	9372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006139	AG	3	6	9446	9451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006139	CA	3	6	9746	9751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006139	AT	3	6	10076	10081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006139	GC	3	6	10590	10595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006139	CT	3	6	12200	12205	0 %	50 %	0 %	50 %	51246981
24	NC_006139	TA	3	6	14150	14155	50 %	50 %	0 %	0 %	51246984
25	NC_006139	CA	3	6	14457	14462	50 %	0 %	0 %	50 %	51246985
26	NC_006139	TA	3	6	16062	16067	50 %	50 %	0 %	0 %	51246985
27	NC_006139	AT	3	6	16864	16869	50 %	50 %	0 %	0 %	51246985
28	NC_006139	CA	3	6	17061	17066	50 %	0 %	0 %	50 %	51246986
29	NC_006139	AT	3	6	17780	17785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006139	CA	3	6	17995	18000	50 %	0 %	0 %	50 %	51246987
31	NC_006139	AT	3	6	18207	18212	50 %	50 %	0 %	0 %	51246987
32	NC_006139	TA	5	10	18460	18469	50 %	50 %	0 %	0 %	51246987
33	NC_006139	GA	4	8	19879	19886	50 %	0 %	50 %	0 %	51246988
34	NC_006139	CA	3	6	20450	20455	50 %	0 %	0 %	50 %	51246989
35	NC_006139	AT	3	6	20666	20671	50 %	50 %	0 %	0 %	51246989
36	NC_006139	TA	3	6	20752	20757	50 %	50 %	0 %	0 %	51246989
37	NC_006139	TA	3	6	21361	21366	50 %	50 %	0 %	0 %	51246990
38	NC_006139	AG	3	6	21751	21756	50 %	0 %	50 %	0 %	51246991
39	NC_006139	GA	3	6	23891	23896	50 %	0 %	50 %	0 %	51246993
40	NC_006139	GA	3	6	24485	24490	50 %	0 %	50 %	0 %	51246993
41	NC_006139	CT	3	6	25654	25659	0 %	50 %	0 %	50 %	51246994
42	NC_006139	CT	4	8	26150	26157	0 %	50 %	0 %	50 %	51246994
43	NC_006139	TC	3	6	27481	27486	0 %	50 %	0 %	50 %	51246997
44	NC_006139	CT	3	6	28710	28715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006139	TA	3	6	29333	29338	50 %	50 %	0 %	0 %	51246999
46	NC_006139	CA	3	6	30067	30072	50 %	0 %	0 %	50 %	51246999
47	NC_006139	GA	3	6	30890	30895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006139	TC	3	6	30908	30913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_006139	CT	3	6	31143	31148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006139	TG	3	6	31170	31175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006139	CT	4	8	31300	31307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006139	CT	4	8	31937	31944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006139	AT	3	6	32638	32643	50 %	50 %	0 %	0 %	51247000
54	NC_006139	AT	3	6	33366	33371	50 %	50 %	0 %	0 %	51247002
55	NC_006139	AT	3	6	33745	33750	50 %	50 %	0 %	0 %	51247003
56	NC_006139	CA	3	6	34107	34112	50 %	0 %	0 %	50 %	51247003
57	NC_006139	AT	3	6	35155	35160	50 %	50 %	0 %	0 %	51247004
58	NC_006139	AT	3	6	35646	35651	50 %	50 %	0 %	0 %	51247005
59	NC_006139	AC	3	6	35912	35917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006139	AT	3	6	36152	36157	50 %	50 %	0 %	0 %	51247006
61	NC_006139	AT	3	6	36549	36554	50 %	50 %	0 %	0 %	51247006
62	NC_006139	AG	3	6	36759	36764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006139	GC	3	6	39037	39042	0 %	0 %	50 %	50 %	51247008
64	NC_006139	CG	3	6	39182	39187	0 %	0 %	50 %	50 %	51247008
65	NC_006139	GA	3	6	43245	43250	50 %	0 %	50 %	0 %	51247013
66	NC_006139	GA	3	6	43894	43899	50 %	0 %	50 %	0 %	51247013
67	NC_006139	TC	3	6	44166	44171	0 %	50 %	0 %	50 %	51247014
68	NC_006139	CT	3	6	44453	44458	0 %	50 %	0 %	50 %	51247014
69	NC_006139	CT	3	6	44617	44622	0 %	50 %	0 %	50 %	51247014
70	NC_006139	TA	3	6	45583	45588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006139	CT	3	6	45786	45791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_006139	AC	3	6	46469	46474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006139	TC	3	6	47084	47089	0 %	50 %	0 %	50 %	51247016
74	NC_006139	AC	3	6	48054	48059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006139	AT	3	6	48279	48284	50 %	50 %	0 %	0 %	51247017
76	NC_006139	TC	3	6	48552	48557	0 %	50 %	0 %	50 %	51247018
77	NC_006139	AT	3	6	48796	48801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006139	CT	3	6	48819	48824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006139	CT	3	6	48827	48832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006139	TC	4	8	48892	48899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006139	CT	3	6	49312	49317	0 %	50 %	0 %	50 %	51247019
82	NC_006139	AT	3	6	50745	50750	50 %	50 %	0 %	0 %	51247021
83	NC_006139	AC	3	6	50824	50829	50 %	0 %	0 %	50 %	51247021
84	NC_006139	GT	3	6	50862	50867	0 %	50 %	50 %	0 %	51247021
85	NC_006139	AC	3	6	51470	51475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006139	GA	3	6	51497	51502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006139	TC	3	6	51692	51697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006139	GA	3	6	52101	52106	50 %	0 %	50 %	0 %	51247022
89	NC_006139	CT	3	6	52659	52664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006139	GT	3	6	52692	52697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006139	CA	3	6	53210	53215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006139	TA	3	6	53453	53458	50 %	50 %	0 %	0 %	51247025
93	NC_006139	TA	3	6	54032	54037	50 %	50 %	0 %	0 %	51247025
94	NC_006139	CT	3	6	54096	54101	0 %	50 %	0 %	50 %	51247025
95	NC_006139	AT	3	6	54726	54731	50 %	50 %	0 %	0 %	51247025
96	NC_006139	CA	3	6	55094	55099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006139	TA	3	6	55652	55657	50 %	50 %	0 %	0 %	51247026
98	NC_006139	AG	3	6	56247	56252	50 %	0 %	50 %	0 %	51247026
99	NC_006139	AT	3	6	56267	56272	50 %	50 %	0 %	0 %	51247026
100	NC_006139	AG	4	8	57305	57312	50 %	0 %	50 %	0 %	51247026
101	NC_006139	AG	3	6	60277	60282	50 %	0 %	50 %	0 %	51247027
102	NC_006139	AC	3	6	60714	60719	50 %	0 %	0 %	50 %	51247027
103	NC_006139	GT	3	6	61770	61775	0 %	50 %	50 %	0 %	51247027
104	NC_006139	GC	3	6	64737	64742	0 %	0 %	50 %	50 %	51247027
105	NC_006139	GC	3	6	66297	66302	0 %	0 %	50 %	50 %	51247027
106	NC_006139	AG	3	6	69352	69357	50 %	0 %	50 %	0 %	51247027
107	NC_006139	AG	3	6	69937	69942	50 %	0 %	50 %	0 %	51247027
108	NC_006139	GA	3	6	70192	70197	50 %	0 %	50 %	0 %	51247027
109	NC_006139	TA	3	6	70311	70316	50 %	50 %	0 %	0 %	51247027
110	NC_006139	AG	3	6	72464	72469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006139	AG	3	6	72489	72494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006139	CT	3	6	73083	73088	0 %	50 %	0 %	50 %	51247028
113	NC_006139	CT	3	6	73247	73252	0 %	50 %	0 %	50 %	51247028
114	NC_006139	TG	3	6	73515	73520	0 %	50 %	50 %	0 %	51247028
115	NC_006139	AT	3	6	75585	75590	50 %	50 %	0 %	0 %	51247032
116	NC_006139	GA	3	6	75817	75822	50 %	0 %	50 %	0 %	51247032
117	NC_006139	CA	3	6	76350	76355	50 %	0 %	0 %	50 %	51247033
118	NC_006139	AG	3	6	76910	76915	50 %	0 %	50 %	0 %	51247033
119	NC_006139	AG	3	6	77030	77035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006139	GA	3	6	77050	77055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006139	AC	3	6	77594	77599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_006139	AT	3	6	77668	77673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006139	TC	3	6	78221	78226	0 %	50 %	0 %	50 %	51247034
124	NC_006139	AG	3	6	79056	79061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006139	AG	3	6	79164	79169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006139	AG	3	6	80207	80212	50 %	0 %	50 %	0 %	51247035
127	NC_006139	GA	3	6	81363	81368	50 %	0 %	50 %	0 %	51247038
128	NC_006139	TC	3	6	81656	81661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_006139	AC	3	6	81726	81731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_006139	GA	3	6	82237	82242	50 %	0 %	50 %	0 %	51247039
131	NC_006139	GA	3	6	83404	83409	50 %	0 %	50 %	0 %	51247040
132	NC_006139	TA	3	6	83940	83945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006139	AG	3	6	84213	84218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006139	AG	3	6	84406	84411	50 %	0 %	50 %	0 %	51247041
135	NC_006139	AG	3	6	84671	84676	50 %	0 %	50 %	0 %	51247041
136	NC_006139	AT	3	6	85074	85079	50 %	50 %	0 %	0 %	51247041
137	NC_006139	AG	3	6	85335	85340	50 %	0 %	50 %	0 %	51247041
138	NC_006139	CA	3	6	85558	85563	50 %	0 %	0 %	50 %	51247041
139	NC_006139	GT	3	6	86400	86405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006139	TA	3	6	87014	87019	50 %	50 %	0 %	0 %	51247042
141	NC_006139	AT	3	6	87146	87151	50 %	50 %	0 %	0 %	51247043
142	NC_006139	CT	3	6	89034	89039	0 %	50 %	0 %	50 %	51247044
143	NC_006139	AC	3	6	89236	89241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_006139	AT	3	6	89650	89655	50 %	50 %	0 %	0 %	51247045
145	NC_006139	AT	3	6	89767	89772	50 %	50 %	0 %	0 %	51247045
146	NC_006139	AT	3	6	89864	89869	50 %	50 %	0 %	0 %	51247045
147	NC_006139	TA	3	6	89970	89975	50 %	50 %	0 %	0 %	51247045
148	NC_006139	AT	3	6	90473	90478	50 %	50 %	0 %	0 %	51247045
149	NC_006139	AT	3	6	90480	90485	50 %	50 %	0 %	0 %	51247045
150	NC_006139	TA	3	6	91044	91049	50 %	50 %	0 %	0 %	51247046
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.