MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54 plasmid large

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006139	TG	3	6	181	186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006139	GT	3	6	200	205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006139	GT	3	6	220	225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006139	TG	3	6	1174	1179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006139	CT	3	6	3502	3507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006139	AT	3	6	9278	9283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006139	AG	3	6	9367	9372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006139	AG	3	6	9446	9451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006139	CA	3	6	9746	9751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006139	AT	3	6	10076	10081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006139	GC	3	6	10590	10595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_006139	AT	3	6	17780	17785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006139	CT	3	6	28710	28715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006139	GA	3	6	30890	30895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006139	TC	3	6	30908	30913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006139	CT	3	6	31143	31148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006139	TG	3	6	31170	31175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006139	CT	4	8	31300	31307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006139	CT	4	8	31937	31944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006139	AC	3	6	35912	35917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006139	AG	3	6	36759	36764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006139	TA	3	6	45583	45588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006139	CT	3	6	45786	45791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006139	AC	3	6	46469	46474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006139	AC	3	6	48054	48059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006139	AT	3	6	48796	48801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006139	CT	3	6	48819	48824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006139	CT	3	6	48827	48832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006139	TC	4	8	48892	48899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006139	AC	3	6	51470	51475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006139	GA	3	6	51497	51502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006139	TC	3	6	51692	51697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_006139	CT	3	6	52659	52664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006139	GT	3	6	52692	52697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006139	CA	3	6	53210	53215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_006139	CA	3	6	55094	55099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006139	AG	3	6	72464	72469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006139	AG	3	6	72489	72494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006139	AG	3	6	77030	77035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006139	GA	3	6	77050	77055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006139	AC	3	6	77594	77599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006139	AT	3	6	77668	77673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006139	AG	3	6	79056	79061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006139	AG	3	6	79164	79169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006139	TC	3	6	81656	81661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006139	AC	3	6	81726	81731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006139	TA	3	6	83940	83945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006139	AG	3	6	84213	84218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006139	GT	3	6	86400	86405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006139	AC	3	6	89236	89241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006139	TC	3	6	96104	96109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006139	AG	3	6	96755	96760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006139	TC	3	6	96774	96779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_006139	AT	3	6	97001	97006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006139	AG	3	6	107655	107660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006139	AG	3	6	107846	107851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006139	AC	3	6	109592	109597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006139	AT	3	6	110317	110322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006139	CA	3	6	110372	110377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006139	AG	5	10	110755	110764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006139	GT	3	6	110765	110770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006139	TC	3	6	112538	112543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006139	TG	3	6	112674	112679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006139	CA	3	6	112948	112953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006139	CT	4	8	112961	112968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006139	TA	3	6	113128	113133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006139	CT	3	6	118979	118984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.