MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotalea psychrophila LSv54

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006138	GCAGTG	2	12	4509	4520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006138	CTTTTT	2	12	24837	24848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_006138	AAAAAG	2	12	51805	51816	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006138	AAAAAG	2	12	52744	52755	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006138	AAGAGG	2	12	58955	58966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006138	AACAGC	2	12	67780	67791	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006138	AGCAAC	7	42	76196	76237	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006138	GCAACA	14	84	80356	80439	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006138	ATTTTA	2	12	80517	80528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006138	GGCAGT	2	12	80634	80645	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006138	ACAAGG	6	36	91999	92034	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_006138	CAACAG	2	12	94088	94099	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006138	CAGACA	2	12	129247	129258	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006138	ATTTCT	2	12	129341	129352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_006138	ATTTCT	2	12	153133	153144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006138	GCCCCT	2	12	162945	162956	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_006138	TGGTGT	2	12	225746	225757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006138	AAGGGC	2	12	242416	242427	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006138	AGCCAA	2	12	248134	248145	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006138	CAACCA	2	12	294167	294178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006138	CCTTAT	2	12	297764	297775	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006138	TCTGGA	2	12	332657	332668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_006138	CAAGTC	2	12	357242	357253	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006138	AATAAC	2	12	359217	359228	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_006138	TCTTCC	3	18	363387	363404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006138	ATTTCT	2	12	441079	441090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_006138	GCCTAA	2	12	488825	488836	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006138	CTCAGC	2	12	545349	545360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006138	CCTTCG	2	12	598475	598486	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006138	GTGCAG	2	12	670959	670970	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006138	GAAGGG	2	12	671796	671807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006138	TTATTT	2	12	690304	690315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006138	TCGGCA	2	12	703082	703093	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006138	GAGGTA	2	12	718694	718705	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006138	CTTTCT	2	12	729704	729715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006138	TTTTAA	2	12	732775	732786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006138	AATTAA	2	12	763879	763890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006138	GTGTAG	2	12	773334	773345	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006138	CTTTTC	2	12	786073	786084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006138	CGAACG	2	12	806276	806287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006138	AAGCGA	2	12	808996	809007	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_006138	CAGTAA	2	12	811850	811861	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_006138	CGAACG	2	12	814628	814639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006138	AAGCGA	2	12	817101	817112	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_006138	TTCCCA	2	12	819748	819759	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006138	CGAACG	2	12	822198	822209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006138	AAGCGA	2	12	824671	824682	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_006138	CTAAAA	2	12	827513	827524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006138	AGAGCA	2	12	827811	827822	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_006138	TTTTAG	2	12	931681	931692	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006138	GCCCTT	2	12	974242	974253	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006138	GTCCTT	2	12	978559	978570	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006138	GGTGGG	2	12	980860	980871	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006138	CCTTGC	2	12	985542	985553	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006138	TTTTAT	2	12	1033329	1033340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006138	CTTTTA	2	12	1039393	1039404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_006138	TTTGTA	2	12	1060310	1060321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006138	GTTTGT	2	12	1060389	1060400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006138	ATTAAA	2	12	1071076	1071087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006138	CGAACG	2	12	1098941	1098952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006138	AAGCGA	2	12	1101415	1101426	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_006138	CAGTAA	2	12	1104250	1104261	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_006138	TAAAGG	2	12	1115610	1115621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006138	AAGTAA	2	12	1128419	1128430	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006138	ATTTTT	2	12	1172669	1172680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006138	GAGTTG	2	12	1242748	1242759	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006138	TGTTTG	2	12	1245702	1245713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006138	CGAGTC	2	12	1254056	1254067	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006138	GGCAGT	2	12	1331511	1331522	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_006138	CTTGCT	2	12	1451995	1452006	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006138	TCGCTT	2	12	1461075	1461086	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006138	CGTTCG	2	12	1463777	1463788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006138	ATTTTT	2	12	1494933	1494944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006138	TAGTTA	2	12	1494981	1494992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006138	TATTGA	2	12	1533032	1533043	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006138	TAAAGG	2	12	1568703	1568714	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006138	ACTTGA	2	12	1570617	1570628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_006138	TTGGGG	2	12	1651663	1651674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006138	TTACCT	3	18	1656509	1656526	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006138	CTGATC	2	12	1689588	1689599	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006138	AAATTT	2	12	1729709	1729720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006138	TCTTGA	2	12	1748140	1748151	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_006138	GCGTTT	2	12	1764270	1764281	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_006138	GAATAG	2	12	1800860	1800871	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006138	ATTTTC	2	12	1830947	1830958	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_006138	AAAAGA	2	12	1857241	1857252	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006138	GAAAAA	2	12	1867900	1867911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006138	ATTTTA	2	12	1887877	1887888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006138	GTTATA	2	12	1909018	1909029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006138	TTTGTT	2	12	1911824	1911835	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006138	CGAACG	2	12	1925406	1925417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006138	AAGCGA	2	12	1927905	1927916	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_006138	GGAATC	2	12	1934188	1934199	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_006138	TTGCCT	2	12	1953731	1953742	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006138	TTTCTC	2	12	1985908	1985919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006138	AAAACA	2	12	2029434	2029445	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_006138	TGGAGA	2	12	2067785	2067796	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006138	AAAATT	2	12	2070135	2070146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006138	AAGGAT	2	12	2106060	2106071	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006138	ATTAGG	2	12	2119673	2119684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006138	TTTGAT	2	12	2150737	2150748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006138	CGAACG	2	12	2154732	2154743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006138	AAGCGA	2	12	2157230	2157241	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_006138	ATTGTT	2	12	2173593	2173604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006138	CATATT	2	12	2206311	2206322	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_006138	CTTATA	2	12	2222101	2222112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_006138	AAGAGA	2	12	2222185	2222196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006138	TGTAGA	2	12	2224339	2224350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006138	CTTTCT	2	12	2227035	2227046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006138	AAAATA	2	12	2296106	2296117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006138	GGGGGT	2	12	2317170	2317181	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006138	ATAAAT	2	12	2327195	2327206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006138	TTGCTC	2	12	2381331	2381342	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006138	CGTAAG	2	12	2397300	2397311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_006138	AAATTT	2	12	2449584	2449595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006138	TTCCCT	2	12	2449637	2449648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_006138	TTTTGT	2	12	2476196	2476207	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006138	ATTTAT	2	12	2497459	2497470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006138	GGCATT	2	12	2540381	2540392	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_006138	ATGCCT	2	12	2600835	2600846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006138	CTCTTT	2	12	2606877	2606888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006138	TTATAT	2	12	2622914	2622925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006138	CACCTT	2	12	2630013	2630024	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_006138	TAAAGG	2	12	2642384	2642395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006138	ACTGCA	4	24	2699742	2699765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006138	ACGGCA	2	12	2719756	2719767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006138	CCCTCT	2	12	2726493	2726504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_006138	AATATA	2	12	2886500	2886511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006138	CCTCAC	2	12	2924920	2924931	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_006138	AAATTG	2	12	2949447	2949458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006138	ATTTAA	2	12	2994658	2994669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006138	AAGGAA	2	12	3018455	3018466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006138	CAAAGA	2	12	3019657	3019668	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_006138	AGGTAT	2	12	3089284	3089295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006138	CAACAT	2	12	3099821	3099832	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006138	TCCTGA	2	12	3101769	3101780	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006138	AAAGTT	2	12	3121642	3121653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_006138	CCATAT	2	12	3217205	3217216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006138	GTAGGA	2	12	3228840	3228851	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006138	CTATAG	2	12	3251888	3251899	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_006138	AGCAGA	2	12	3286188	3286199	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_006138	ACAGAG	2	12	3337345	3337356	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_006138	CCCTGC	2	12	3351524	3351535	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_006138	CTTCCT	2	12	3356114	3356125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_006138	GAGGAA	2	12	3372612	3372623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006138	AGCAAC	2	12	3383720	3383731	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_006138	TCCAAT	2	12	3423325	3423336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_006138	CCTTTT	2	12	3428569	3428580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_006138	ATATTT	2	12	3486152	3486163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_006138	AACAAA	2	12	3486197	3486208	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_006138	TTTGCC	2	12	3492070	3492081	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_006138	GAAAAG	2	12	3500684	3500695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_006138	AAGCAT	2	12	3506947	3506958	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_006138	AAAAGC	6	36	3523149	3523184	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.