MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	ATTAAT	2	12	1041	1052	50 %	50 %	0 %	0 %	51038625
2	NC_006129	TTAAAC	2	12	2014	2025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51038626
3	NC_006129	TTTATT	2	12	3046	3057	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51038627
4	NC_006129	CAAAAA	2	12	3367	3378	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006129	ACAATA	2	12	5899	5910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51038630
6	NC_006129	ATTGAG	2	12	6425	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006129	TAAAAG	2	12	7482	7493	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006129	TTTTTA	2	12	9166	9177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006129	TTTTTC	2	12	9511	9522	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	51038637
10	NC_006129	TTATAT	2	12	9650	9661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006129	ACTCTA	2	12	10307	10318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038638
12	NC_006129	TAAACT	2	12	12073	12084	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51038640
13	NC_006129	CAAAAA	2	12	13238	13249	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	51038641
14	NC_006129	AATTAA	2	12	13251	13262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038641
15	NC_006129	ATTATA	2	12	14138	14149	50 %	50 %	0 %	0 %	51038642
16	NC_006129	AATTTA	2	12	16975	16986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006129	AGAAAA	2	12	19442	19453	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51038648
18	NC_006129	ATAATT	2	12	22883	22894	50 %	50 %	0 %	0 %	51038652
19	NC_006129	TTCCAA	2	12	23797	23808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038652
20	NC_006129	CCTTTT	3	18	23913	23930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038653
21	NC_006129	TAGAGT	2	12	24037	24048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038653
22	NC_006129	TTTTGA	2	12	25435	25446	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	51038655
23	NC_006129	ATTATG	2	12	26629	26640	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006129	CAAATA	2	12	28888	28899	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51038661
25	NC_006129	TTTTAA	2	12	29791	29802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038662
26	NC_006129	CAAAAG	2	12	30657	30668	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	51038664
27	NC_006129	GTTTTA	2	12	31170	31181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	51038666
28	NC_006129	TTAAGT	2	12	32227	32238	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006129	AAATAT	2	12	35847	35858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038675
30	NC_006129	AAGATG	2	12	36274	36285	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	51038675
31	NC_006129	TTTTAA	2	12	36805	36816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038677
32	NC_006129	TTTTCT	2	12	38868	38879	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	51038682
33	NC_006129	TCAGAT	2	12	39540	39551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51038682
34	NC_006129	ATTTTA	2	12	39886	39897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006129	AGCTTT	2	12	41345	41356	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	51038684
36	NC_006129	AGCATT	2	12	43655	43666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51038687
37	NC_006129	TTTTCA	2	12	47145	47156	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51038690
38	NC_006129	TTTTCT	2	12	48326	48337	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	51038691
39	NC_006129	TTCATT	2	12	53462	53473	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51038697
40	NC_006129	AATATA	2	12	53759	53770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006129	GGAATT	2	12	54745	54756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038698

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.