MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	GAATT	2	10	601	610	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006129	CCTTT	2	10	1162	1171	0 %	60 %	0 %	40 %	51038625
3	NC_006129	AAAAG	2	10	2067	2076	80 %	0 %	20 %	0 %	51038626
4	NC_006129	GGCAT	2	10	2843	2852	20 %	20 %	40 %	20 %	51038627
5	NC_006129	ATTAT	2	10	3324	3333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006129	TAAAT	2	10	4573	4582	60 %	40 %	0 %	0 %	51038628
7	NC_006129	TTAAA	2	10	5218	5227	60 %	40 %	0 %	0 %	51038629
8	NC_006129	AAGAA	2	10	5413	5422	80 %	0 %	20 %	0 %	51038629
9	NC_006129	AATAT	2	10	5591	5600	60 %	40 %	0 %	0 %	51038630
10	NC_006129	CTTTA	2	10	5782	5791	20 %	60 %	0 %	20 %	51038630
11	NC_006129	CAATT	2	10	6068	6077	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006129	TAAAA	2	10	6149	6158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006129	TTAAA	2	10	6343	6352	60 %	40 %	0 %	0 %	51038631
14	NC_006129	ATAAA	2	10	9453	9462	80 %	20 %	0 %	0 %	51038637
15	NC_006129	ATTTT	2	10	9598	9607	20 %	80 %	0 %	0 %	51038637
16	NC_006129	TAATA	2	10	9672	9681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006129	TGAAA	2	10	9807	9816	60 %	20 %	20 %	0 %	51038638
18	NC_006129	TACTT	2	10	11892	11901	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_006129	CAAAA	2	10	11977	11986	80 %	0 %	0 %	20 %	51038640
20	NC_006129	ATAAA	2	10	12736	12745	80 %	20 %	0 %	0 %	51038640
21	NC_006129	TTAAA	2	10	14102	14111	60 %	40 %	0 %	0 %	51038642
22	NC_006129	GATTT	2	10	14441	14450	20 %	60 %	20 %	0 %	51038642
23	NC_006129	AAAAT	2	10	15090	15099	80 %	20 %	0 %	0 %	51038643
24	NC_006129	ATTAA	2	10	16339	16348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006129	TCTAG	2	10	16868	16877	20 %	40 %	20 %	20 %	51038645
26	NC_006129	ATTTT	2	10	17037	17046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006129	AAATT	2	10	17615	17624	60 %	40 %	0 %	0 %	51038646
28	NC_006129	ATTTT	2	10	17779	17788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006129	TAAAT	2	10	17923	17932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006129	TATTT	2	10	18111	18120	20 %	80 %	0 %	0 %	51038647
31	NC_006129	TTTAA	2	10	18376	18385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006129	AATAA	2	10	18442	18451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006129	AGAAA	2	10	18466	18475	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006129	TTCTT	2	10	20126	20135	0 %	80 %	0 %	20 %	51038649
35	NC_006129	ATTTC	2	10	20376	20385	20 %	60 %	0 %	20 %	51038649
36	NC_006129	TATTT	2	10	20453	20462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006129	TTTAA	2	10	21130	21139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006129	TAAAT	2	10	21448	21457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006129	AATTT	2	10	23464	23473	40 %	60 %	0 %	0 %	51038652
40	NC_006129	ATATT	2	10	24105	24114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006129	ATAAA	2	10	24290	24299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006129	ATTTT	2	10	25769	25778	20 %	80 %	0 %	0 %	51038655
43	NC_006129	TTAAT	2	10	25796	25805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006129	TTAAT	2	10	25884	25893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006129	ATAAA	2	10	26181	26190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006129	AAAAC	2	10	28480	28489	80 %	0 %	0 %	20 %	51038660
47	NC_006129	CCAAA	2	10	29058	29067	60 %	0 %	0 %	40 %	51038661
48	NC_006129	TAATT	2	10	30827	30836	40 %	60 %	0 %	0 %	51038665
49	NC_006129	TTAAT	2	10	32279	32288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006129	AGTAC	2	10	32407	32416	40 %	20 %	20 %	20 %	51038669
51	NC_006129	TAATG	2	10	32423	32432	40 %	40 %	20 %	0 %	51038669
52	NC_006129	TGGTT	2	10	33110	33119	0 %	60 %	40 %	0 %	51038670
53	NC_006129	ATTTT	2	10	34317	34326	20 %	80 %	0 %	0 %	51038672
54	NC_006129	AATAA	2	10	34646	34655	80 %	20 %	0 %	0 %	51038672
55	NC_006129	AGATT	2	10	34676	34685	40 %	40 %	20 %	0 %	51038672
56	NC_006129	ATTTA	2	10	34860	34869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006129	TATTT	2	10	36730	36739	20 %	80 %	0 %	0 %	51038677
58	NC_006129	TTAGC	2	10	38581	38590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006129	ATTTT	2	10	39945	39954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006129	GAAAT	2	10	39989	39998	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006129	TGATT	2	10	40285	40294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006129	TGATT	2	10	41232	41241	20 %	60 %	20 %	0 %	51038684
63	NC_006129	GCTTT	2	10	42851	42860	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_006129	TTTCA	2	10	43529	43538	20 %	60 %	0 %	20 %	51038687
65	NC_006129	ATTTG	2	10	43694	43703	20 %	60 %	20 %	0 %	51038687
66	NC_006129	TTTGT	2	10	44623	44632	0 %	80 %	20 %	0 %	51038688
67	NC_006129	TGTTA	2	10	45141	45150	20 %	60 %	20 %	0 %	51038689
68	NC_006129	ACTTG	2	10	46078	46087	20 %	40 %	20 %	20 %	51038689
69	NC_006129	GAAGA	2	10	46682	46691	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006129	AGTTT	2	10	47483	47492	20 %	60 %	20 %	0 %	51038690
71	NC_006129	TTTTA	2	10	47635	47644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006129	GAAGA	2	10	47759	47768	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006129	CTTCT	2	10	47774	47783	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_006129	AGTTT	2	10	48590	48599	20 %	60 %	20 %	0 %	51038691
75	NC_006129	TTTTA	2	10	48699	48708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006129	GAAGA	2	10	48778	48787	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006129	CTTCT	2	10	48793	48802	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_006129	TAAAA	2	10	49560	49569	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006129	GTTTT	2	10	49977	49986	0 %	80 %	20 %	0 %	51038693
80	NC_006129	AGTTT	2	10	50557	50566	20 %	60 %	20 %	0 %	51038694
81	NC_006129	TCCTT	2	10	50576	50585	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_006129	CTTTT	2	10	50675	50684	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_006129	TGTCT	2	10	50984	50993	0 %	60 %	20 %	20 %	51038695
84	NC_006129	TTTAG	2	10	51581	51590	20 %	60 %	20 %	0 %	51038695
85	NC_006129	TTTTG	2	10	51737	51746	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006129	TTTGA	2	10	52489	52498	20 %	60 %	20 %	0 %	51038696
87	NC_006129	ATTTT	2	10	53253	53262	20 %	80 %	0 %	0 %	51038697
88	NC_006129	AATAA	2	10	53281	53290	80 %	20 %	0 %	0 %	51038697
89	NC_006129	TCCTT	2	10	53500	53509	0 %	60 %	0 %	40 %	51038697
90	NC_006129	TAAAA	2	10	53810	53819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006129	TTAAA	2	10	54121	54130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.