MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	GAATT	2	10	601	610	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006129	ATTAT	2	10	3324	3333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006129	CAATT	2	10	6068	6077	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_006129	TAAAA	2	10	6149	6158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006129	TAATA	2	10	9672	9681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006129	TACTT	2	10	11892	11901	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006129	ATTAA	2	10	16339	16348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006129	ATTTT	2	10	17037	17046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006129	ATTTT	2	10	17779	17788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006129	TAAAT	2	10	17923	17932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006129	TTTAA	2	10	18376	18385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006129	AATAA	2	10	18442	18451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006129	AGAAA	2	10	18466	18475	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006129	TATTT	2	10	20453	20462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006129	TTTAA	2	10	21130	21139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006129	TAAAT	2	10	21448	21457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006129	ATATT	2	10	24105	24114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006129	ATAAA	2	10	24290	24299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006129	TTAAT	2	10	25796	25805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006129	TTAAT	2	10	25884	25893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006129	ATAAA	2	10	26181	26190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006129	TTAAT	2	10	32279	32288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006129	ATTTA	2	10	34860	34869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006129	TTAGC	2	10	38581	38590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_006129	ATTTT	2	10	39945	39954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006129	GAAAT	2	10	39989	39998	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006129	TGATT	2	10	40285	40294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006129	GCTTT	2	10	42851	42860	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_006129	GAAGA	2	10	46682	46691	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006129	TTTTA	2	10	47635	47644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006129	GAAGA	2	10	47759	47768	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006129	CTTCT	2	10	47774	47783	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_006129	TTTTA	2	10	48699	48708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006129	GAAGA	2	10	48778	48787	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006129	CTTCT	2	10	48793	48802	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_006129	TAAAA	2	10	49560	49569	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006129	TCCTT	2	10	50576	50585	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_006129	CTTTT	2	10	50675	50684	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_006129	TTTTG	2	10	51737	51746	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006129	TAAAA	2	10	53810	53819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006129	TTAAA	2	10	54121	54130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.