MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	ATTA	2	8	299	306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006129	ACAA	2	8	342	349	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_006129	ATAC	2	8	402	409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_006129	ATTA	2	8	454	461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006129	CTAT	2	8	714	721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006129	GTAA	2	8	888	895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006129	ACAA	2	8	1088	1095	75 %	0 %	0 %	25 %	51038625
8	NC_006129	AATA	2	8	1126	1133	75 %	25 %	0 %	0 %	51038625
9	NC_006129	ATTT	2	8	1175	1182	25 %	75 %	0 %	0 %	51038625
10	NC_006129	AGCA	2	8	1338	1345	50 %	0 %	25 %	25 %	51038625
11	NC_006129	AATA	2	8	1509	1516	75 %	25 %	0 %	0 %	51038625
12	NC_006129	AATT	2	8	1549	1556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006129	TTAA	2	8	1664	1671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006129	ACAA	2	8	1876	1883	75 %	0 %	0 %	25 %	51038626
15	NC_006129	AATT	2	8	2368	2375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006129	GATT	2	8	2998	3005	25 %	50 %	25 %	0 %	51038627
17	NC_006129	TAAA	2	8	3920	3927	75 %	25 %	0 %	0 %	51038628
18	NC_006129	TCAA	2	8	3996	4003	50 %	25 %	0 %	25 %	51038628
19	NC_006129	ATCA	2	8	4058	4065	50 %	25 %	0 %	25 %	51038628
20	NC_006129	TAAA	2	8	4605	4612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006129	TACA	2	8	4627	4634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006129	AAAT	2	8	4916	4923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006129	CTTT	2	8	5156	5163	0 %	75 %	0 %	25 %	51038629
24	NC_006129	AGCA	2	8	5189	5196	50 %	0 %	25 %	25 %	51038629
25	NC_006129	TAAA	2	8	5501	5508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006129	AAAT	2	8	6263	6270	75 %	25 %	0 %	0 %	51038631
27	NC_006129	AAAC	2	8	6442	6449	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006129	CAAT	2	8	6946	6953	50 %	25 %	0 %	25 %	51038633
29	NC_006129	AGGA	2	8	7361	7368	50 %	0 %	50 %	0 %	51038633
30	NC_006129	ATTT	2	8	7851	7858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006129	AAAT	2	8	7994	8001	75 %	25 %	0 %	0 %	51038634
32	NC_006129	TACA	2	8	8198	8205	50 %	25 %	0 %	25 %	51038634
33	NC_006129	TATT	2	8	8322	8329	25 %	75 %	0 %	0 %	51038634
34	NC_006129	TGGT	2	8	8478	8485	0 %	50 %	50 %	0 %	51038634
35	NC_006129	AAAT	2	8	8548	8555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006129	AAAT	2	8	8757	8764	75 %	25 %	0 %	0 %	51038636
37	NC_006129	ATCA	2	8	9412	9419	50 %	25 %	0 %	25 %	51038637
38	NC_006129	TATT	2	8	9709	9716	25 %	75 %	0 %	0 %	51038638
39	NC_006129	ACAA	2	8	10906	10913	75 %	0 %	0 %	25 %	51038639
40	NC_006129	GAAG	2	8	11098	11105	50 %	0 %	50 %	0 %	51038639
41	NC_006129	TAAA	2	8	11420	11427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006129	TAAA	3	12	11693	11704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006129	TAAA	2	8	11756	11763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006129	ATTA	2	8	11919	11926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006129	TAAA	2	8	12121	12128	75 %	25 %	0 %	0 %	51038640
46	NC_006129	GAAA	2	8	12135	12142	75 %	0 %	25 %	0 %	51038640
47	NC_006129	AAAG	2	8	12282	12289	75 %	0 %	25 %	0 %	51038640
48	NC_006129	AAAT	2	8	12376	12383	75 %	25 %	0 %	0 %	51038640
49	NC_006129	TAAA	2	8	12493	12500	75 %	25 %	0 %	0 %	51038640
50	NC_006129	TAAG	2	8	12505	12512	50 %	25 %	25 %	0 %	51038640
51	NC_006129	ATTT	2	8	13461	13468	25 %	75 %	0 %	0 %	51038641
52	NC_006129	TCAA	2	8	13864	13871	50 %	25 %	0 %	25 %	51038642
53	NC_006129	ATAA	2	8	14563	14570	75 %	25 %	0 %	0 %	51038643
54	NC_006129	ATTT	2	8	14875	14882	25 %	75 %	0 %	0 %	51038643
55	NC_006129	CCAA	2	8	14918	14925	50 %	0 %	0 %	50 %	51038643
56	NC_006129	CTTT	2	8	15006	15013	0 %	75 %	0 %	25 %	51038643
57	NC_006129	ATTT	2	8	15100	15107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006129	AGAA	2	8	15386	15393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006129	TTAA	2	8	15406	15413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006129	TAAA	2	8	15640	15647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006129	GTAA	2	8	15765	15772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006129	ATTT	2	8	15974	15981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006129	GAAA	2	8	16265	16272	75 %	0 %	25 %	0 %	51038644
64	NC_006129	ATTT	2	8	16417	16424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006129	ATTC	2	8	16648	16655	25 %	50 %	0 %	25 %	51038645
66	NC_006129	AGTT	2	8	16921	16928	25 %	50 %	25 %	0 %	51038645
67	NC_006129	TATT	2	8	17074	17081	25 %	75 %	0 %	0 %	51038646
68	NC_006129	AGCC	2	8	17862	17869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006129	TTTC	2	8	18317	18324	0 %	75 %	0 %	25 %	51038647
70	NC_006129	ATTT	2	8	18334	18341	25 %	75 %	0 %	0 %	51038647
71	NC_006129	TTAA	2	8	18434	18441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006129	ATAC	2	8	18729	18736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006129	AGAC	2	8	18894	18901	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_006129	ATTA	2	8	20149	20156	50 %	50 %	0 %	0 %	51038649
75	NC_006129	TTTA	2	8	20481	20488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006129	AATA	2	8	20518	20525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006129	AATT	2	8	20614	20621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006129	AAAG	2	8	20785	20792	75 %	0 %	25 %	0 %	51038650
79	NC_006129	GGGA	2	8	21245	21252	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006129	AGAA	2	8	21458	21465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006129	ATGT	2	8	21543	21550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006129	AAAT	2	8	21582	21589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006129	CTTT	2	8	21730	21737	0 %	75 %	0 %	25 %	51038651
84	NC_006129	TAAA	2	8	21881	21888	75 %	25 %	0 %	0 %	51038651
85	NC_006129	AAAT	2	8	22147	22154	75 %	25 %	0 %	0 %	51038651
86	NC_006129	AAAT	2	8	22191	22198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006129	ATTT	2	8	22516	22523	25 %	75 %	0 %	0 %	51038652
88	NC_006129	GAAA	2	8	23034	23041	75 %	0 %	25 %	0 %	51038652
89	NC_006129	ATTT	2	8	23320	23327	25 %	75 %	0 %	0 %	51038652
90	NC_006129	ATCA	2	8	23435	23442	50 %	25 %	0 %	25 %	51038652
91	NC_006129	TATG	2	8	23558	23565	25 %	50 %	25 %	0 %	51038652
92	NC_006129	TTGA	2	8	23988	23995	25 %	50 %	25 %	0 %	51038653
93	NC_006129	AATA	3	12	24215	24226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006129	ACAG	2	8	24693	24700	50 %	0 %	25 %	25 %	51038654
95	NC_006129	GCAA	2	8	24758	24765	50 %	0 %	25 %	25 %	51038654
96	NC_006129	TGTT	2	8	24811	24818	0 %	75 %	25 %	0 %	51038654
97	NC_006129	TAAA	2	8	25299	25306	75 %	25 %	0 %	0 %	51038655
98	NC_006129	AGCT	2	8	25383	25390	25 %	25 %	25 %	25 %	51038655
99	NC_006129	AGTA	2	8	25945	25952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006129	AATT	2	8	26285	26292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006129	CTTA	2	8	26297	26304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_006129	ATTT	2	8	26706	26713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006129	CAAA	2	8	26875	26882	75 %	0 %	0 %	25 %	51038657
104	NC_006129	TTAA	2	8	27318	27325	50 %	50 %	0 %	0 %	51038657
105	NC_006129	TTAA	2	8	27497	27504	50 %	50 %	0 %	0 %	51038658
106	NC_006129	AAAT	2	8	27588	27595	75 %	25 %	0 %	0 %	51038658
107	NC_006129	GATT	2	8	27760	27767	25 %	50 %	25 %	0 %	51038658
108	NC_006129	TATT	2	8	28048	28055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006129	ATTA	2	8	28821	28828	50 %	50 %	0 %	0 %	51038661
110	NC_006129	TATG	2	8	29036	29043	25 %	50 %	25 %	0 %	51038661
111	NC_006129	GAAA	2	8	29151	29158	75 %	0 %	25 %	0 %	51038661
112	NC_006129	AATA	2	8	29267	29274	75 %	25 %	0 %	0 %	51038661
113	NC_006129	TGTT	2	8	29728	29735	0 %	75 %	25 %	0 %	51038662
114	NC_006129	GTTG	2	8	29751	29758	0 %	50 %	50 %	0 %	51038662
115	NC_006129	TTAG	2	8	30229	30236	25 %	50 %	25 %	0 %	51038663
116	NC_006129	TAAA	2	8	30364	30371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006129	CAAA	2	8	30471	30478	75 %	0 %	0 %	25 %	51038664
118	NC_006129	AAGA	2	8	31218	31225	75 %	0 %	25 %	0 %	51038666
119	NC_006129	ATTA	2	8	31321	31328	50 %	50 %	0 %	0 %	51038667
120	NC_006129	CAAG	2	8	31813	31820	50 %	0 %	25 %	25 %	51038668
121	NC_006129	TGAT	2	8	31994	32001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006129	AGCA	2	8	32438	32445	50 %	0 %	25 %	25 %	51038669
123	NC_006129	TTAA	2	8	32775	32782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006129	TAAA	2	8	33004	33011	75 %	25 %	0 %	0 %	51038670
125	NC_006129	TAAA	2	8	34350	34357	75 %	25 %	0 %	0 %	51038672
126	NC_006129	GGCA	2	8	34796	34803	25 %	0 %	50 %	25 %	51038672
127	NC_006129	AGCA	2	8	34982	34989	50 %	0 %	25 %	25 %	51038673
128	NC_006129	TATT	2	8	35331	35338	25 %	75 %	0 %	0 %	51038674
129	NC_006129	TTTA	2	8	35411	35418	25 %	75 %	0 %	0 %	51038674
130	NC_006129	AGTT	2	8	35430	35437	25 %	50 %	25 %	0 %	51038674
131	NC_006129	ATTA	2	8	35491	35498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006129	TAAT	2	8	36669	36676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006129	AAAT	2	8	36961	36968	75 %	25 %	0 %	0 %	51038677
134	NC_006129	AATT	2	8	37007	37014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006129	TTGC	2	8	37570	37577	0 %	50 %	25 %	25 %	51038679
136	NC_006129	ATTT	2	8	37676	37683	25 %	75 %	0 %	0 %	51038679
137	NC_006129	GTTT	2	8	37700	37707	0 %	75 %	25 %	0 %	51038679
138	NC_006129	AAAG	2	8	38237	38244	75 %	0 %	25 %	0 %	51038680
139	NC_006129	AGTT	2	8	38334	38341	25 %	50 %	25 %	0 %	51038680
140	NC_006129	ATGT	2	8	38485	38492	25 %	50 %	25 %	0 %	51038681
141	NC_006129	ATTT	2	8	38983	38990	25 %	75 %	0 %	0 %	51038682
142	NC_006129	TGTT	2	8	39037	39044	0 %	75 %	25 %	0 %	51038682
143	NC_006129	ATTT	2	8	41048	41055	25 %	75 %	0 %	0 %	51038684
144	NC_006129	TTCT	2	8	41069	41076	0 %	75 %	0 %	25 %	51038684
145	NC_006129	TTGT	2	8	41198	41205	0 %	75 %	25 %	0 %	51038684
146	NC_006129	TAAT	2	8	41486	41493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006129	GATT	2	8	41687	41694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006129	ACTT	2	8	41864	41871	25 %	50 %	0 %	25 %	51038685
149	NC_006129	AATA	2	8	41902	41909	75 %	25 %	0 %	0 %	51038685
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.