MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	ATTA	2	8	299	306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006129	ACAA	2	8	342	349	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_006129	ATAC	2	8	402	409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_006129	ATTA	2	8	454	461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006129	CTAT	2	8	714	721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006129	GTAA	2	8	888	895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006129	AATT	2	8	1549	1556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006129	TTAA	2	8	1664	1671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006129	AATT	2	8	2368	2375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006129	TAAA	2	8	4605	4612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006129	TACA	2	8	4627	4634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006129	AAAT	2	8	4916	4923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006129	TAAA	2	8	5501	5508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006129	AAAC	2	8	6442	6449	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006129	ATTT	2	8	7851	7858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006129	AAAT	2	8	8548	8555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006129	TAAA	2	8	11420	11427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006129	TAAA	3	12	11693	11704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006129	TAAA	2	8	11756	11763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006129	ATTA	2	8	11919	11926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006129	ATTT	2	8	15100	15107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006129	AGAA	2	8	15386	15393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006129	TTAA	2	8	15406	15413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006129	TAAA	2	8	15640	15647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006129	GTAA	2	8	15765	15772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006129	ATTT	2	8	15974	15981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006129	ATTT	2	8	16417	16424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006129	AGCC	2	8	17862	17869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006129	TTAA	2	8	18434	18441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006129	ATAC	2	8	18729	18736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_006129	AGAC	2	8	18894	18901	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006129	TTTA	2	8	20481	20488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006129	AATA	2	8	20518	20525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006129	AATT	2	8	20614	20621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006129	GGGA	2	8	21245	21252	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006129	AGAA	2	8	21458	21465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006129	ATGT	2	8	21543	21550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006129	AAAT	2	8	21582	21589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006129	AAAT	2	8	22191	22198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006129	AATA	3	12	24215	24226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006129	AGTA	2	8	25945	25952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006129	AATT	2	8	26285	26292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006129	CTTA	2	8	26297	26304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006129	ATTT	2	8	26706	26713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006129	TATT	2	8	28048	28055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006129	TAAA	2	8	30364	30371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006129	TGAT	2	8	31994	32001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006129	TTAA	2	8	32775	32782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006129	ATTA	2	8	35491	35498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006129	TAAT	2	8	36669	36676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006129	AATT	2	8	37007	37014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006129	TAAT	2	8	41486	41493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006129	GATT	2	8	41687	41694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006129	ATTT	2	8	42513	42520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006129	AAAT	2	8	42588	42595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006129	TCTT	2	8	42980	42987	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006129	TAAT	2	8	43992	43999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006129	ATTA	2	8	44001	44008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006129	ATTA	2	8	46493	46500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006129	ATTA	2	8	46510	46517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006129	TAAT	2	8	46519	46526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006129	TAAA	2	8	46564	46571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006129	TAAA	2	8	47682	47689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006129	TAAA	2	8	47693	47700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006129	TAAA	2	8	48712	48719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006129	AATA	2	8	49720	49727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006129	TATT	2	8	50180	50187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006129	TAAA	2	8	51784	51791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006129	ATAC	2	8	52819	52826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_006129	GTTT	2	8	53776	53783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006129	GCAA	2	8	53901	53908	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006129	AACC	2	8	55542	55549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.