MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	ACAA	2	8	1088	1095	75 %	0 %	0 %	25 %	51038625
2	NC_006129	AATA	2	8	1126	1133	75 %	25 %	0 %	0 %	51038625
3	NC_006129	ATTT	2	8	1175	1182	25 %	75 %	0 %	0 %	51038625
4	NC_006129	AGCA	2	8	1338	1345	50 %	0 %	25 %	25 %	51038625
5	NC_006129	AATA	2	8	1509	1516	75 %	25 %	0 %	0 %	51038625
6	NC_006129	ACAA	2	8	1876	1883	75 %	0 %	0 %	25 %	51038626
7	NC_006129	GATT	2	8	2998	3005	25 %	50 %	25 %	0 %	51038627
8	NC_006129	TAAA	2	8	3920	3927	75 %	25 %	0 %	0 %	51038628
9	NC_006129	TCAA	2	8	3996	4003	50 %	25 %	0 %	25 %	51038628
10	NC_006129	ATCA	2	8	4058	4065	50 %	25 %	0 %	25 %	51038628
11	NC_006129	CTTT	2	8	5156	5163	0 %	75 %	0 %	25 %	51038629
12	NC_006129	AGCA	2	8	5189	5196	50 %	0 %	25 %	25 %	51038629
13	NC_006129	AAAT	2	8	6263	6270	75 %	25 %	0 %	0 %	51038631
14	NC_006129	CAAT	2	8	6946	6953	50 %	25 %	0 %	25 %	51038633
15	NC_006129	AGGA	2	8	7361	7368	50 %	0 %	50 %	0 %	51038633
16	NC_006129	AAAT	2	8	7994	8001	75 %	25 %	0 %	0 %	51038634
17	NC_006129	TACA	2	8	8198	8205	50 %	25 %	0 %	25 %	51038634
18	NC_006129	TATT	2	8	8322	8329	25 %	75 %	0 %	0 %	51038634
19	NC_006129	TGGT	2	8	8478	8485	0 %	50 %	50 %	0 %	51038634
20	NC_006129	AAAT	2	8	8757	8764	75 %	25 %	0 %	0 %	51038636
21	NC_006129	ATCA	2	8	9412	9419	50 %	25 %	0 %	25 %	51038637
22	NC_006129	TATT	2	8	9709	9716	25 %	75 %	0 %	0 %	51038638
23	NC_006129	ACAA	2	8	10906	10913	75 %	0 %	0 %	25 %	51038639
24	NC_006129	GAAG	2	8	11098	11105	50 %	0 %	50 %	0 %	51038639
25	NC_006129	TAAA	2	8	12121	12128	75 %	25 %	0 %	0 %	51038640
26	NC_006129	GAAA	2	8	12135	12142	75 %	0 %	25 %	0 %	51038640
27	NC_006129	AAAG	2	8	12282	12289	75 %	0 %	25 %	0 %	51038640
28	NC_006129	AAAT	2	8	12376	12383	75 %	25 %	0 %	0 %	51038640
29	NC_006129	TAAA	2	8	12493	12500	75 %	25 %	0 %	0 %	51038640
30	NC_006129	TAAG	2	8	12505	12512	50 %	25 %	25 %	0 %	51038640
31	NC_006129	ATTT	2	8	13461	13468	25 %	75 %	0 %	0 %	51038641
32	NC_006129	TCAA	2	8	13864	13871	50 %	25 %	0 %	25 %	51038642
33	NC_006129	ATAA	2	8	14563	14570	75 %	25 %	0 %	0 %	51038643
34	NC_006129	ATTT	2	8	14875	14882	25 %	75 %	0 %	0 %	51038643
35	NC_006129	CCAA	2	8	14918	14925	50 %	0 %	0 %	50 %	51038643
36	NC_006129	CTTT	2	8	15006	15013	0 %	75 %	0 %	25 %	51038643
37	NC_006129	GAAA	2	8	16265	16272	75 %	0 %	25 %	0 %	51038644
38	NC_006129	ATTC	2	8	16648	16655	25 %	50 %	0 %	25 %	51038645
39	NC_006129	AGTT	2	8	16921	16928	25 %	50 %	25 %	0 %	51038645
40	NC_006129	TATT	2	8	17074	17081	25 %	75 %	0 %	0 %	51038646
41	NC_006129	TTTC	2	8	18317	18324	0 %	75 %	0 %	25 %	51038647
42	NC_006129	ATTT	2	8	18334	18341	25 %	75 %	0 %	0 %	51038647
43	NC_006129	ATTA	2	8	20149	20156	50 %	50 %	0 %	0 %	51038649
44	NC_006129	AAAG	2	8	20785	20792	75 %	0 %	25 %	0 %	51038650
45	NC_006129	CTTT	2	8	21730	21737	0 %	75 %	0 %	25 %	51038651
46	NC_006129	TAAA	2	8	21881	21888	75 %	25 %	0 %	0 %	51038651
47	NC_006129	AAAT	2	8	22147	22154	75 %	25 %	0 %	0 %	51038651
48	NC_006129	ATTT	2	8	22516	22523	25 %	75 %	0 %	0 %	51038652
49	NC_006129	GAAA	2	8	23034	23041	75 %	0 %	25 %	0 %	51038652
50	NC_006129	ATTT	2	8	23320	23327	25 %	75 %	0 %	0 %	51038652
51	NC_006129	ATCA	2	8	23435	23442	50 %	25 %	0 %	25 %	51038652
52	NC_006129	TATG	2	8	23558	23565	25 %	50 %	25 %	0 %	51038652
53	NC_006129	TTGA	2	8	23988	23995	25 %	50 %	25 %	0 %	51038653
54	NC_006129	ACAG	2	8	24693	24700	50 %	0 %	25 %	25 %	51038654
55	NC_006129	GCAA	2	8	24758	24765	50 %	0 %	25 %	25 %	51038654
56	NC_006129	TGTT	2	8	24811	24818	0 %	75 %	25 %	0 %	51038654
57	NC_006129	TAAA	2	8	25299	25306	75 %	25 %	0 %	0 %	51038655
58	NC_006129	AGCT	2	8	25383	25390	25 %	25 %	25 %	25 %	51038655
59	NC_006129	CAAA	2	8	26875	26882	75 %	0 %	0 %	25 %	51038657
60	NC_006129	TTAA	2	8	27318	27325	50 %	50 %	0 %	0 %	51038657
61	NC_006129	TTAA	2	8	27497	27504	50 %	50 %	0 %	0 %	51038658
62	NC_006129	AAAT	2	8	27588	27595	75 %	25 %	0 %	0 %	51038658
63	NC_006129	GATT	2	8	27760	27767	25 %	50 %	25 %	0 %	51038658
64	NC_006129	ATTA	2	8	28821	28828	50 %	50 %	0 %	0 %	51038661
65	NC_006129	TATG	2	8	29036	29043	25 %	50 %	25 %	0 %	51038661
66	NC_006129	GAAA	2	8	29151	29158	75 %	0 %	25 %	0 %	51038661
67	NC_006129	AATA	2	8	29267	29274	75 %	25 %	0 %	0 %	51038661
68	NC_006129	TGTT	2	8	29728	29735	0 %	75 %	25 %	0 %	51038662
69	NC_006129	GTTG	2	8	29751	29758	0 %	50 %	50 %	0 %	51038662
70	NC_006129	TTAG	2	8	30229	30236	25 %	50 %	25 %	0 %	51038663
71	NC_006129	CAAA	2	8	30471	30478	75 %	0 %	0 %	25 %	51038664
72	NC_006129	AAGA	2	8	31218	31225	75 %	0 %	25 %	0 %	51038666
73	NC_006129	ATTA	2	8	31321	31328	50 %	50 %	0 %	0 %	51038667
74	NC_006129	CAAG	2	8	31813	31820	50 %	0 %	25 %	25 %	51038668
75	NC_006129	AGCA	2	8	32438	32445	50 %	0 %	25 %	25 %	51038669
76	NC_006129	TAAA	2	8	33004	33011	75 %	25 %	0 %	0 %	51038670
77	NC_006129	TAAA	2	8	34350	34357	75 %	25 %	0 %	0 %	51038672
78	NC_006129	GGCA	2	8	34796	34803	25 %	0 %	50 %	25 %	51038672
79	NC_006129	AGCA	2	8	34982	34989	50 %	0 %	25 %	25 %	51038673
80	NC_006129	TATT	2	8	35331	35338	25 %	75 %	0 %	0 %	51038674
81	NC_006129	TTTA	2	8	35411	35418	25 %	75 %	0 %	0 %	51038674
82	NC_006129	AGTT	2	8	35430	35437	25 %	50 %	25 %	0 %	51038674
83	NC_006129	AAAT	2	8	36961	36968	75 %	25 %	0 %	0 %	51038677
84	NC_006129	TTGC	2	8	37570	37577	0 %	50 %	25 %	25 %	51038679
85	NC_006129	ATTT	2	8	37676	37683	25 %	75 %	0 %	0 %	51038679
86	NC_006129	GTTT	2	8	37700	37707	0 %	75 %	25 %	0 %	51038679
87	NC_006129	AAAG	2	8	38237	38244	75 %	0 %	25 %	0 %	51038680
88	NC_006129	AGTT	2	8	38334	38341	25 %	50 %	25 %	0 %	51038680
89	NC_006129	ATGT	2	8	38485	38492	25 %	50 %	25 %	0 %	51038681
90	NC_006129	ATTT	2	8	38983	38990	25 %	75 %	0 %	0 %	51038682
91	NC_006129	TGTT	2	8	39037	39044	0 %	75 %	25 %	0 %	51038682
92	NC_006129	ATTT	2	8	41048	41055	25 %	75 %	0 %	0 %	51038684
93	NC_006129	TTCT	2	8	41069	41076	0 %	75 %	0 %	25 %	51038684
94	NC_006129	TTGT	2	8	41198	41205	0 %	75 %	25 %	0 %	51038684
95	NC_006129	ACTT	2	8	41864	41871	25 %	50 %	0 %	25 %	51038685
96	NC_006129	AATA	2	8	41902	41909	75 %	25 %	0 %	0 %	51038685
97	NC_006129	TTTA	2	8	41918	41925	25 %	75 %	0 %	0 %	51038685
98	NC_006129	ATTT	2	8	42013	42020	25 %	75 %	0 %	0 %	51038685
99	NC_006129	ATAA	2	8	42146	42153	75 %	25 %	0 %	0 %	51038685
100	NC_006129	TTGC	2	8	42714	42721	0 %	50 %	25 %	25 %	51038686
101	NC_006129	ATGA	2	8	42758	42765	50 %	25 %	25 %	0 %	51038686
102	NC_006129	AAAC	2	8	42818	42825	75 %	0 %	0 %	25 %	51038686
103	NC_006129	TATT	2	8	43039	43046	25 %	75 %	0 %	0 %	51038687
104	NC_006129	GTTT	2	8	43246	43253	0 %	75 %	25 %	0 %	51038687
105	NC_006129	AATT	2	8	43943	43950	50 %	50 %	0 %	0 %	51038687
106	NC_006129	TGCT	2	8	44169	44176	0 %	50 %	25 %	25 %	51038688
107	NC_006129	ATTA	2	8	44637	44644	50 %	50 %	0 %	0 %	51038688
108	NC_006129	TTTC	2	8	45580	45587	0 %	75 %	0 %	25 %	51038689
109	NC_006129	CTTG	2	8	46093	46100	0 %	50 %	25 %	25 %	51038689
110	NC_006129	CTTG	2	8	46102	46109	0 %	50 %	25 %	25 %	51038689
111	NC_006129	TGTT	2	8	46265	46272	0 %	75 %	25 %	0 %	51038689
112	NC_006129	TCAT	2	8	46787	46794	25 %	50 %	0 %	25 %	51038690
113	NC_006129	AAAG	2	8	47031	47038	75 %	0 %	25 %	0 %	51038690
114	NC_006129	ATTT	2	8	47349	47356	25 %	75 %	0 %	0 %	51038690
115	NC_006129	ATAG	2	8	47827	47834	50 %	25 %	25 %	0 %	51038691
116	NC_006129	ATTT	2	8	48456	48463	25 %	75 %	0 %	0 %	51038691
117	NC_006129	CTTT	2	8	49051	49058	0 %	75 %	0 %	25 %	51038692
118	NC_006129	TCTT	2	8	49335	49342	0 %	75 %	0 %	25 %	51038692
119	NC_006129	TTTA	2	8	49406	49413	25 %	75 %	0 %	0 %	51038692
120	NC_006129	GTTT	2	8	49531	49538	0 %	75 %	25 %	0 %	51038692
121	NC_006129	ATTT	2	8	50420	50427	25 %	75 %	0 %	0 %	51038694
122	NC_006129	TAAT	2	8	50846	50853	50 %	50 %	0 %	0 %	51038695
123	NC_006129	CTAT	2	8	51092	51099	25 %	50 %	0 %	25 %	51038695
124	NC_006129	TATT	2	8	51198	51205	25 %	75 %	0 %	0 %	51038695
125	NC_006129	AATT	2	8	51309	51316	50 %	50 %	0 %	0 %	51038695
126	NC_006129	ATTT	2	8	51334	51341	25 %	75 %	0 %	0 %	51038695
127	NC_006129	TTGT	2	8	51352	51359	0 %	75 %	25 %	0 %	51038695
128	NC_006129	TATT	2	8	52261	52268	25 %	75 %	0 %	0 %	51038696
129	NC_006129	GATT	2	8	52515	52522	25 %	50 %	25 %	0 %	51038696
130	NC_006129	TATT	2	8	53362	53369	25 %	75 %	0 %	0 %	51038697
131	NC_006129	AATT	2	8	53453	53460	50 %	50 %	0 %	0 %	51038697
132	NC_006129	AAAT	2	8	54724	54731	75 %	25 %	0 %	0 %	51038698

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.