MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	TAA	2	6	85	90	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006129	TAA	2	6	107	112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006129	ACT	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006129	AAT	2	6	217	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006129	ATT	2	6	244	249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006129	TAA	2	6	327	332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006129	ACA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006129	AAG	2	6	494	499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006129	CTC	2	6	669	674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_006129	GAA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006129	TCT	2	6	745	750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006129	TTA	3	9	999	1007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006129	ATA	2	6	1012	1017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006129	AAT	2	6	1523	1528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006129	ATT	2	6	1675	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006129	TAA	3	9	1708	1716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006129	ATA	2	6	1717	1722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006129	ATT	2	6	1726	1731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006129	CAT	2	6	1749	1754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006129	ATT	3	9	1776	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006129	TAA	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006129	ACT	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006129	ATT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006129	AAC	2	6	2425	2430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006129	TAA	2	6	3355	3360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006129	TTA	2	6	4660	4665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006129	ATT	2	6	4686	4691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006129	TAA	2	6	4737	4742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006129	ATT	2	6	4757	4762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006129	AAT	2	6	4765	4770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006129	TAA	2	6	4794	4799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006129	ATT	2	6	4805	4810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006129	ATA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006129	AGA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006129	ATA	2	6	6084	6089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006129	TGA	2	6	7599	7604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006129	TAG	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006129	ACA	2	6	7673	7678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006129	CAC	2	6	7799	7804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_006129	CAA	2	6	8596	8601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006129	AGG	2	6	8627	8632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006129	AGA	2	6	9225	9230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006129	CAT	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006129	GTT	2	6	11458	11463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006129	GAA	2	6	11687	11692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006129	ATA	2	6	11705	11710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006129	TAA	2	6	11719	11724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006129	TAA	2	6	11739	11744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006129	AAT	2	6	11778	11783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006129	TTA	2	6	11811	11816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006129	ACT	2	6	11943	11948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006129	TAA	2	6	15372	15377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006129	ATA	2	6	15431	15436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006129	TAT	2	6	15525	15530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006129	ACT	2	6	15532	15537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006129	TAA	2	6	15610	15615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006129	ATT	2	6	15667	15672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006129	TAA	2	6	15811	15816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006129	AAG	2	6	15822	15827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006129	TTG	2	6	16317	16322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006129	AAC	2	6	16357	16362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006129	GTT	2	6	16376	16381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006129	TAA	2	6	16999	17004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006129	TAA	3	9	17666	17674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006129	TAA	2	6	17722	17727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006129	TTA	2	6	17767	17772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006129	TAA	2	6	17825	17830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006129	TAT	2	6	17831	17836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006129	AAT	2	6	17900	17905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006129	TAT	2	6	18352	18357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006129	TTA	2	6	18386	18391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006129	TAA	2	6	18393	18398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006129	ATT	2	6	18743	18748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006129	TTG	2	6	18769	18774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006129	ATA	2	6	18781	18786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006129	TGC	2	6	18922	18927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006129	AAG	2	6	18935	18940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006129	TTA	2	6	18965	18970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006129	GAT	2	6	18988	18993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006129	AGT	2	6	19027	19032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006129	TAA	2	6	19854	19859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006129	TAA	2	6	20446	20451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006129	ATT	2	6	20645	20650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006129	GTT	2	6	20695	20700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006129	TAT	2	6	21170	21175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006129	TAA	2	6	21177	21182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006129	TAA	2	6	21312	21317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006129	TAT	2	6	21335	21340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006129	TTA	2	6	21472	21477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006129	TGG	2	6	21524	21529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006129	TAG	3	9	21648	21656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006129	TAT	2	6	22162	22167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006129	TTA	2	6	22203	22208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006129	TGG	2	6	22228	22233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006129	TAT	2	6	24129	24134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006129	AAG	2	6	24183	24188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006129	TTG	2	6	24200	24205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006129	GGC	2	6	24351	24356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006129	AAT	3	9	25156	25164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006129	CAA	2	6	25929	25934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006129	ATT	2	6	26071	26076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006129	ATA	2	6	26079	26084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006129	ATA	2	6	26093	26098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006129	ATA	2	6	26127	26132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006129	CAG	2	6	26260	26265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006129	AAG	2	6	26362	26367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006129	TAA	2	6	26614	26619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006129	CTT	2	6	26679	26684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006129	TAA	2	6	27978	27983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006129	TAA	2	6	28020	28025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006129	AGT	2	6	29864	29869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006129	AGA	2	6	29914	29919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006129	GAA	2	6	30398	30403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006129	TAT	2	6	32017	32022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006129	TTA	2	6	32048	32053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006129	TAG	2	6	32070	32075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006129	CAT	2	6	32327	32332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006129	ATT	2	6	33308	33313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006129	TAT	2	6	33354	33359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006129	TAA	2	6	33455	33460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006129	GGA	2	6	33461	33466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006129	GAT	2	6	34097	34102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006129	GGA	2	6	34870	34875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006129	TGA	3	9	34878	34886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006129	AGA	2	6	35085	35090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006129	TAA	2	6	35189	35194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006129	TAA	2	6	35196	35201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006129	TAA	2	6	35234	35239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006129	TAA	2	6	36347	36352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006129	AAT	2	6	36368	36373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006129	TTA	2	6	36701	36706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006129	AGA	2	6	36972	36977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006129	ATG	2	6	36994	36999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006129	TAG	2	6	38570	38575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006129	AGC	2	6	39765	39770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006129	TAC	2	6	39858	39863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006129	TAT	2	6	39968	39973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006129	AGT	2	6	40045	40050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006129	TTC	2	6	40093	40098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006129	TAA	2	6	40170	40175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006129	TTA	2	6	41479	41484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006129	AAG	2	6	41558	41563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006129	TAA	2	6	41573	41578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.