MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	TA	3	6	255	260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006129	AG	3	6	465	470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006129	TA	3	6	1649	1654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006129	AC	3	6	2261	2266	50 %	0 %	0 %	50 %	51038626
5	NC_006129	AG	3	6	2624	2629	50 %	0 %	50 %	0 %	51038627
6	NC_006129	TA	3	6	3425	3430	50 %	50 %	0 %	0 %	51038628
7	NC_006129	CT	3	6	4935	4940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006129	AG	3	6	4947	4952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006129	AT	3	6	5536	5541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006129	AT	3	6	6977	6982	50 %	50 %	0 %	0 %	51038633
11	NC_006129	AC	3	6	7268	7273	50 %	0 %	0 %	50 %	51038633
12	NC_006129	AG	3	6	7533	7538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006129	AT	3	6	7746	7751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006129	AC	3	6	7869	7874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006129	AT	3	6	8852	8857	50 %	50 %	0 %	0 %	51038636
16	NC_006129	AG	4	8	9001	9008	50 %	0 %	50 %	0 %	51038636
17	NC_006129	AT	3	6	9693	9698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006129	TA	4	8	12184	12191	50 %	50 %	0 %	0 %	51038640
19	NC_006129	AC	4	8	12307	12314	50 %	0 %	0 %	50 %	51038640
20	NC_006129	TA	4	8	12425	12432	50 %	50 %	0 %	0 %	51038640
21	NC_006129	AT	3	6	12434	12439	50 %	50 %	0 %	0 %	51038640
22	NC_006129	AT	3	6	13585	13590	50 %	50 %	0 %	0 %	51038641
23	NC_006129	AT	3	6	13970	13975	50 %	50 %	0 %	0 %	51038642
24	NC_006129	TA	3	6	14212	14217	50 %	50 %	0 %	0 %	51038642
25	NC_006129	CA	3	6	14340	14345	50 %	0 %	0 %	50 %	51038642
26	NC_006129	GA	4	8	14401	14408	50 %	0 %	50 %	0 %	51038642
27	NC_006129	AT	3	6	15706	15711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006129	TG	3	6	16541	16546	0 %	50 %	50 %	0 %	51038645
29	NC_006129	AT	3	6	16943	16948	50 %	50 %	0 %	0 %	51038645
30	NC_006129	AT	3	6	18356	18361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006129	AT	3	6	18477	18482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006129	AG	3	6	18631	18636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006129	TA	4	8	18785	18792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006129	AG	3	6	18939	18944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006129	AG	3	6	18982	18987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006129	AT	3	6	19983	19988	50 %	50 %	0 %	0 %	51038649
37	NC_006129	AG	3	6	20084	20089	50 %	0 %	50 %	0 %	51038649
38	NC_006129	AT	3	6	20722	20727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006129	TA	3	6	20953	20958	50 %	50 %	0 %	0 %	51038650
40	NC_006129	AG	4	8	21351	21358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006129	AG	3	6	21418	21423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006129	AT	3	6	21508	21513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006129	AT	3	6	21608	21613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006129	AT	3	6	21622	21627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006129	TA	4	8	22183	22190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006129	AT	3	6	23967	23972	50 %	50 %	0 %	0 %	51038653
47	NC_006129	TA	3	6	24225	24230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006129	TC	3	6	24231	24236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_006129	AT	3	6	25163	25168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006129	TG	3	6	25182	25187	0 %	50 %	50 %	0 %	51038655
51	NC_006129	CT	3	6	25844	25849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006129	AG	3	6	26328	26333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006129	TA	4	8	26532	26539	50 %	50 %	0 %	0 %	51038656
54	NC_006129	GA	4	8	27273	27280	50 %	0 %	50 %	0 %	51038657
55	NC_006129	AT	3	6	28588	28593	50 %	50 %	0 %	0 %	51038661
56	NC_006129	AG	3	6	28688	28693	50 %	0 %	50 %	0 %	51038661
57	NC_006129	GA	3	6	29208	29213	50 %	0 %	50 %	0 %	51038661
58	NC_006129	AT	3	6	29328	29333	50 %	50 %	0 %	0 %	51038661
59	NC_006129	AT	3	6	30385	30390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006129	AG	4	8	32166	32173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006129	GA	3	6	33012	33017	50 %	0 %	50 %	0 %	51038670
62	NC_006129	AG	3	6	33820	33825	50 %	0 %	50 %	0 %	51038671
63	NC_006129	GA	3	6	34394	34399	50 %	0 %	50 %	0 %	51038672
64	NC_006129	TC	3	6	35094	35099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006129	AT	3	6	35577	35582	50 %	50 %	0 %	0 %	51038675
66	NC_006129	AT	3	6	36642	36647	50 %	50 %	0 %	0 %	51038676
67	NC_006129	GA	3	6	36709	36714	50 %	0 %	50 %	0 %	51038677
68	NC_006129	AG	3	6	37442	37447	50 %	0 %	50 %	0 %	51038679
69	NC_006129	TG	3	6	37994	37999	0 %	50 %	50 %	0 %	51038679
70	NC_006129	AT	3	6	38163	38168	50 %	50 %	0 %	0 %	51038680
71	NC_006129	CT	3	6	38789	38794	0 %	50 %	0 %	50 %	51038682
72	NC_006129	AT	3	6	40211	40216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006129	AT	3	6	40219	40224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006129	TA	3	6	40548	40553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006129	AT	3	6	40581	40586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006129	AT	3	6	40614	40619	50 %	50 %	0 %	0 %	51038684
77	NC_006129	TA	3	6	40730	40735	50 %	50 %	0 %	0 %	51038684
78	NC_006129	TA	3	6	41462	41467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006129	GT	3	6	41756	41761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006129	AT	3	6	43921	43926	50 %	50 %	0 %	0 %	51038687
81	NC_006129	CT	3	6	44091	44096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006129	TA	3	6	44210	44215	50 %	50 %	0 %	0 %	51038688
83	NC_006129	AT	3	6	44444	44449	50 %	50 %	0 %	0 %	51038688
84	NC_006129	AG	3	6	44739	44744	50 %	0 %	50 %	0 %	51038688
85	NC_006129	TG	3	6	45388	45393	0 %	50 %	50 %	0 %	51038689
86	NC_006129	GT	3	6	45602	45607	0 %	50 %	50 %	0 %	51038689
87	NC_006129	TG	3	6	45728	45733	0 %	50 %	50 %	0 %	51038689
88	NC_006129	GT	3	6	46949	46954	0 %	50 %	50 %	0 %	51038690
89	NC_006129	TA	3	6	48648	48653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006129	GT	3	6	50041	50046	0 %	50 %	50 %	0 %	51038693
91	NC_006129	TA	3	6	50325	50330	50 %	50 %	0 %	0 %	51038694
92	NC_006129	TA	3	6	51343	51348	50 %	50 %	0 %	0 %	51038695
93	NC_006129	AT	3	6	51953	51958	50 %	50 %	0 %	0 %	51038696
94	NC_006129	AT	3	6	52190	52195	50 %	50 %	0 %	0 %	51038696
95	NC_006129	AT	3	6	52224	52229	50 %	50 %	0 %	0 %	51038696
96	NC_006129	GT	3	6	52273	52278	0 %	50 %	50 %	0 %	51038696
97	NC_006129	AT	3	6	52726	52731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006129	AT	4	8	54157	54164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006129	TA	3	6	54990	54995	50 %	50 %	0 %	0 %	51038698
100	NC_006129	TA	3	6	55010	55015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006129	AG	3	6	55554	55559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.