MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	AC	3	6	2261	2266	50 %	0 %	0 %	50 %	51038626
2	NC_006129	AG	3	6	2624	2629	50 %	0 %	50 %	0 %	51038627
3	NC_006129	TA	3	6	3425	3430	50 %	50 %	0 %	0 %	51038628
4	NC_006129	AT	3	6	6977	6982	50 %	50 %	0 %	0 %	51038633
5	NC_006129	AC	3	6	7268	7273	50 %	0 %	0 %	50 %	51038633
6	NC_006129	AT	3	6	8852	8857	50 %	50 %	0 %	0 %	51038636
7	NC_006129	AG	4	8	9001	9008	50 %	0 %	50 %	0 %	51038636
8	NC_006129	TA	4	8	12184	12191	50 %	50 %	0 %	0 %	51038640
9	NC_006129	AC	4	8	12307	12314	50 %	0 %	0 %	50 %	51038640
10	NC_006129	TA	4	8	12425	12432	50 %	50 %	0 %	0 %	51038640
11	NC_006129	AT	3	6	12434	12439	50 %	50 %	0 %	0 %	51038640
12	NC_006129	AT	3	6	13585	13590	50 %	50 %	0 %	0 %	51038641
13	NC_006129	AT	3	6	13970	13975	50 %	50 %	0 %	0 %	51038642
14	NC_006129	TA	3	6	14212	14217	50 %	50 %	0 %	0 %	51038642
15	NC_006129	CA	3	6	14340	14345	50 %	0 %	0 %	50 %	51038642
16	NC_006129	GA	4	8	14401	14408	50 %	0 %	50 %	0 %	51038642
17	NC_006129	TG	3	6	16541	16546	0 %	50 %	50 %	0 %	51038645
18	NC_006129	AT	3	6	16943	16948	50 %	50 %	0 %	0 %	51038645
19	NC_006129	AT	3	6	19983	19988	50 %	50 %	0 %	0 %	51038649
20	NC_006129	AG	3	6	20084	20089	50 %	0 %	50 %	0 %	51038649
21	NC_006129	TA	3	6	20953	20958	50 %	50 %	0 %	0 %	51038650
22	NC_006129	AT	3	6	23967	23972	50 %	50 %	0 %	0 %	51038653
23	NC_006129	TG	3	6	25182	25187	0 %	50 %	50 %	0 %	51038655
24	NC_006129	TA	4	8	26532	26539	50 %	50 %	0 %	0 %	51038656
25	NC_006129	GA	4	8	27273	27280	50 %	0 %	50 %	0 %	51038657
26	NC_006129	AT	3	6	28588	28593	50 %	50 %	0 %	0 %	51038661
27	NC_006129	AG	3	6	28688	28693	50 %	0 %	50 %	0 %	51038661
28	NC_006129	GA	3	6	29208	29213	50 %	0 %	50 %	0 %	51038661
29	NC_006129	AT	3	6	29328	29333	50 %	50 %	0 %	0 %	51038661
30	NC_006129	GA	3	6	33012	33017	50 %	0 %	50 %	0 %	51038670
31	NC_006129	AG	3	6	33820	33825	50 %	0 %	50 %	0 %	51038671
32	NC_006129	GA	3	6	34394	34399	50 %	0 %	50 %	0 %	51038672
33	NC_006129	AT	3	6	35577	35582	50 %	50 %	0 %	0 %	51038675
34	NC_006129	AT	3	6	36642	36647	50 %	50 %	0 %	0 %	51038676
35	NC_006129	GA	3	6	36709	36714	50 %	0 %	50 %	0 %	51038677
36	NC_006129	AG	3	6	37442	37447	50 %	0 %	50 %	0 %	51038679
37	NC_006129	TG	3	6	37994	37999	0 %	50 %	50 %	0 %	51038679
38	NC_006129	AT	3	6	38163	38168	50 %	50 %	0 %	0 %	51038680
39	NC_006129	CT	3	6	38789	38794	0 %	50 %	0 %	50 %	51038682
40	NC_006129	AT	3	6	40614	40619	50 %	50 %	0 %	0 %	51038684
41	NC_006129	TA	3	6	40730	40735	50 %	50 %	0 %	0 %	51038684
42	NC_006129	AT	3	6	43921	43926	50 %	50 %	0 %	0 %	51038687
43	NC_006129	TA	3	6	44210	44215	50 %	50 %	0 %	0 %	51038688
44	NC_006129	AT	3	6	44444	44449	50 %	50 %	0 %	0 %	51038688
45	NC_006129	AG	3	6	44739	44744	50 %	0 %	50 %	0 %	51038688
46	NC_006129	TG	3	6	45388	45393	0 %	50 %	50 %	0 %	51038689
47	NC_006129	GT	3	6	45602	45607	0 %	50 %	50 %	0 %	51038689
48	NC_006129	TG	3	6	45728	45733	0 %	50 %	50 %	0 %	51038689
49	NC_006129	GT	3	6	46949	46954	0 %	50 %	50 %	0 %	51038690
50	NC_006129	GT	3	6	50041	50046	0 %	50 %	50 %	0 %	51038693
51	NC_006129	TA	3	6	50325	50330	50 %	50 %	0 %	0 %	51038694
52	NC_006129	TA	3	6	51343	51348	50 %	50 %	0 %	0 %	51038695
53	NC_006129	AT	3	6	51953	51958	50 %	50 %	0 %	0 %	51038696
54	NC_006129	AT	3	6	52190	52195	50 %	50 %	0 %	0 %	51038696
55	NC_006129	AT	3	6	52224	52229	50 %	50 %	0 %	0 %	51038696
56	NC_006129	GT	3	6	52273	52278	0 %	50 %	50 %	0 %	51038696
57	NC_006129	TA	3	6	54990	54995	50 %	50 %	0 %	0 %	51038698

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.