MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid cp26

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006128	ATTTTT	2	12	2072	2083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51038600
2	NC_006128	AATTTA	2	12	6106	6117	50 %	50 %	0 %	0 %	51038605
3	NC_006128	AAAATT	2	12	6409	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038605
4	NC_006128	AGAAAA	2	12	6755	6766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51038606
5	NC_006128	ATTGAA	2	12	7116	7127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	51038606
6	NC_006128	TAAATT	2	12	7288	7299	50 %	50 %	0 %	0 %	51038606
7	NC_006128	TAAAAT	2	12	7480	7491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038606
8	NC_006128	TAAAAA	3	18	9037	9054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51038608
9	NC_006128	TTAAAA	2	12	10070	10081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038610
10	NC_006128	TAATTT	2	12	10899	10910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038611
11	NC_006128	AATTTA	2	12	13589	13600	50 %	50 %	0 %	0 %	51038612
12	NC_006128	AACTCC	2	12	14980	14991	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	51038613
13	NC_006128	ATTCCT	2	12	15488	15499	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	51038613
14	NC_006128	CCTGGG	2	12	16079	16090	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	51038614
15	NC_006128	TTTATT	2	12	17566	17577	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51038615
16	NC_006128	CAATAC	2	12	19160	19171	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	51038616
17	NC_006128	AAATAA	2	12	20379	20390	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51038617
18	NC_006128	AAATTT	2	12	22260	22271	50 %	50 %	0 %	0 %	51038619
19	NC_006128	ATTAAA	2	12	22916	22927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038620
20	NC_006128	ATCTAT	2	12	25454	25465	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51038623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.