MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid cp26

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006128	TA	3	6	763	768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006128	AT	3	6	769	774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006128	TC	4	8	1512	1519	0 %	50 %	0 %	50 %	51038600
4	NC_006128	AT	3	6	1967	1972	50 %	50 %	0 %	0 %	51038600
5	NC_006128	TA	3	6	2264	2269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006128	TA	3	6	2380	2385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006128	AG	3	6	2405	2410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006128	CT	3	6	2425	2430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006128	AT	3	6	2880	2885	50 %	50 %	0 %	0 %	51038601
10	NC_006128	AT	3	6	3837	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006128	AT	3	6	3909	3914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006128	AT	3	6	4353	4358	50 %	50 %	0 %	0 %	51038603
13	NC_006128	TA	3	6	4698	4703	50 %	50 %	0 %	0 %	51038604
14	NC_006128	CA	3	6	5288	5293	50 %	0 %	0 %	50 %	51038604
15	NC_006128	AT	3	6	5716	5721	50 %	50 %	0 %	0 %	51038604
16	NC_006128	AT	3	6	5889	5894	50 %	50 %	0 %	0 %	51038605
17	NC_006128	TA	3	6	6308	6313	50 %	50 %	0 %	0 %	51038605
18	NC_006128	TA	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006128	AT	3	6	6738	6743	50 %	50 %	0 %	0 %	51038606
20	NC_006128	AT	3	6	7084	7089	50 %	50 %	0 %	0 %	51038606
21	NC_006128	AT	3	6	7524	7529	50 %	50 %	0 %	0 %	51038606
22	NC_006128	AT	4	8	9359	9366	50 %	50 %	0 %	0 %	51038609
23	NC_006128	AT	3	6	10243	10248	50 %	50 %	0 %	0 %	51038610
24	NC_006128	AT	3	6	10310	10315	50 %	50 %	0 %	0 %	51038610
25	NC_006128	TA	3	6	10606	10611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006128	TA	3	6	10618	10623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006128	TA	3	6	10724	10729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006128	TA	3	6	10735	10740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006128	TA	3	6	11109	11114	50 %	50 %	0 %	0 %	51038611
30	NC_006128	AT	3	6	11731	11736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006128	TA	4	8	12137	12144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006128	AT	3	6	12164	12169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006128	AT	3	6	12496	12501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006128	AG	3	6	13513	13518	50 %	0 %	50 %	0 %	51038612
35	NC_006128	AT	3	6	13786	13791	50 %	50 %	0 %	0 %	51038612
36	NC_006128	CT	3	6	16658	16663	0 %	50 %	0 %	50 %	51038614
37	NC_006128	AG	3	6	18215	18220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006128	TG	3	6	18473	18478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006128	GC	3	6	18491	18496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006128	GA	3	6	18652	18657	50 %	0 %	50 %	0 %	51038616
41	NC_006128	AT	3	6	18848	18853	50 %	50 %	0 %	0 %	51038616
42	NC_006128	AT	3	6	18990	18995	50 %	50 %	0 %	0 %	51038616
43	NC_006128	AT	3	6	19316	19321	50 %	50 %	0 %	0 %	51038616
44	NC_006128	CT	3	6	20289	20294	0 %	50 %	0 %	50 %	51038617
45	NC_006128	AT	3	6	20313	20318	50 %	50 %	0 %	0 %	51038617
46	NC_006128	CT	3	6	21042	21047	0 %	50 %	0 %	50 %	51038617
47	NC_006128	GC	3	6	21257	21262	0 %	0 %	50 %	50 %	51038617
48	NC_006128	AT	3	6	21310	21315	50 %	50 %	0 %	0 %	51038617
49	NC_006128	AG	3	6	22134	22139	50 %	0 %	50 %	0 %	51038619
50	NC_006128	AT	3	6	22218	22223	50 %	50 %	0 %	0 %	51038619
51	NC_006128	AT	3	6	22697	22702	50 %	50 %	0 %	0 %	51038620
52	NC_006128	TA	4	8	22723	22730	50 %	50 %	0 %	0 %	51038620
53	NC_006128	AT	3	6	22879	22884	50 %	50 %	0 %	0 %	51038620
54	NC_006128	AG	3	6	22947	22952	50 %	0 %	50 %	0 %	51038620
55	NC_006128	TA	3	6	23250	23255	50 %	50 %	0 %	0 %	51038621
56	NC_006128	TA	3	6	23606	23611	50 %	50 %	0 %	0 %	51038621
57	NC_006128	AT	3	6	23841	23846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006128	AT	3	6	24225	24230	50 %	50 %	0 %	0 %	51038622
59	NC_006128	CA	3	6	24546	24551	50 %	0 %	0 %	50 %	51038622
60	NC_006128	TC	3	6	25909	25914	0 %	50 %	0 %	50 %	51038623
61	NC_006128	AT	3	6	26206	26211	50 %	50 %	0 %	0 %	51038623
62	NC_006128	AT	3	6	26287	26292	50 %	50 %	0 %	0 %	51038623
63	NC_006128	TA	3	6	26549	26554	50 %	50 %	0 %	0 %	51038623
64	NC_006128	AC	3	6	26586	26591	50 %	0 %	0 %	50 %	51038623
65	NC_006128	AT	3	6	26885	26890	50 %	50 %	0 %	0 %	51038623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.