MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	CTATTC	2	12	1791	1802	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	50913348
2	NC_006086	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50913351
3	NC_006086	GATTCA	2	12	6733	6744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50913352
4	NC_006086	ATTTTC	2	12	6979	6990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50913352
5	NC_006086	CTTAAC	2	12	7492	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913352
6	NC_006086	TAGATA	2	12	9995	10006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50913356
7	NC_006086	GTATTG	2	12	11068	11079	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50913357
8	NC_006086	ATCAGA	2	12	11102	11113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913357
9	NC_006086	AGATTT	2	12	11690	11701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50913357
10	NC_006086	TAAAAT	2	12	14007	14018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913359
11	NC_006086	GAATCT	2	12	14734	14745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50913359
12	NC_006086	AGTGTA	2	12	22939	22950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006086	ACTAAT	2	12	22967	22978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_006086	AGTGTA	2	12	28940	28951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006086	ACTAAT	2	12	28968	28979	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006086	CTGCAA	2	12	32697	32708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50913363
17	NC_006086	AAAATC	2	12	36031	36042	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50913366
18	NC_006086	GTGACG	2	12	42525	42536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	50913379
19	NC_006086	ATATTG	2	12	42903	42914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50913380
20	NC_006086	TAAATA	2	12	47446	47457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006086	GCAGAA	2	12	48463	48474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	50913383
22	NC_006086	GATGTG	2	12	49641	49652	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006086	GTAAAC	2	12	52560	52571	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913389
24	NC_006086	TAATCC	2	12	52942	52953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913389
25	NC_006086	ACGCTT	2	12	53185	53196	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50913389
26	NC_006086	TAAAGA	2	12	56378	56389	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50913394
27	NC_006086	AAAGAA	2	12	64168	64179	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50913402
28	NC_006086	AATCCT	2	12	64989	65000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913403
29	NC_006086	ACTGAG	2	12	78315	78326	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50913418
30	NC_006086	CAGGCG	2	12	78769	78780	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	50913418
31	NC_006086	ATATCG	2	12	85418	85429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50913422
32	NC_006086	AAAGCC	2	12	88421	88432	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	50913424
33	NC_006086	AAAAGT	2	12	94151	94162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50913429
34	NC_006086	CGAACA	2	12	96195	96206	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	50913430
35	NC_006086	ATAACT	2	12	96614	96625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50913431
36	NC_006086	AAGGAA	2	12	97120	97131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913432
37	NC_006086	GCCTTT	2	12	103122	103133	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	50913436
38	NC_006086	GCAACA	2	12	104469	104480	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	50913437
39	NC_006086	TATTTT	2	12	105553	105564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006086	AAAGGT	2	12	106024	106035	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50913439
41	NC_006086	CTTGTT	2	12	106794	106805	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	50913440
42	NC_006086	AGCTGA	2	12	107242	107253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50913441
43	NC_006086	CGCAAT	2	12	108645	108656	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50913444
44	NC_006086	ATTGAA	2	12	109057	109068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50913445
45	NC_006086	ACATCA	2	12	109193	109204	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50913445
46	NC_006086	CAAAGG	2	12	113234	113245	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	50913454
47	NC_006086	AAATTA	2	12	114296	114307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913457
48	NC_006086	GCGGTG	2	12	114810	114821	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	50913458
49	NC_006086	TAAAGA	2	12	115171	115182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161761326
50	NC_006086	ATTGAA	2	12	117371	117382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50913461
51	NC_006086	AGTGTA	2	12	125515	125526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006086	ACTAAT	2	12	125543	125554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006086	TTCGGG	2	12	126485	126496	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_006086	CGAAGG	2	12	140187	140198	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	50913478
55	NC_006086	CTGGTA	2	12	142184	142195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50913478
56	NC_006086	ATATTT	2	12	142967	142978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913480
57	NC_006086	CTTTTT	2	12	144176	144187	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50913481
58	NC_006086	ATAAAA	2	12	154729	154740	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006086	CAGCAA	2	12	157637	157648	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	50913501
60	NC_006086	TTGATA	2	12	160426	160437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50913503
61	NC_006086	TATAGA	2	12	163842	163853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50913505
62	NC_006086	TGTATC	2	12	163859	163870	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50913505
63	NC_006086	ATTTTT	2	12	169593	169604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50913509
64	NC_006086	TTTTTA	2	12	170175	170186	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50913509
65	NC_006086	AATAGC	2	12	172992	173003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913513
66	NC_006086	AGATAA	2	12	177108	177119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006086	ATCTTG	2	12	177493	177504	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50913519
68	NC_006086	AAAAGC	2	12	179067	179078	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50913519
69	NC_006086	TTTATT	2	12	179253	179264	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50913519
70	NC_006086	ATGTCA	2	12	179404	179415	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50913519
71	NC_006086	AAAGCT	2	12	180891	180902	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913522
72	NC_006086	AAGGTA	2	12	188723	188734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50913529
73	NC_006086	AAAACT	2	12	191338	191349	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50913530
74	NC_006086	TATTGA	2	12	192932	192943	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50913532
75	NC_006086	CCAATC	2	12	200499	200510	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50913539
76	NC_006086	CTTTAT	2	12	201990	202001	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006086	TGCTGT	2	12	203252	203263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	50913540
78	NC_006086	CTCTTT	2	12	203854	203865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006086	GATGTT	2	12	207940	207951	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50913547
80	NC_006086	AGATCA	2	12	207964	207975	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913547
81	NC_006086	GATGTT	2	12	217278	217289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50913553
82	NC_006086	TCTTTG	2	12	217591	217602	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	50913554
83	NC_006086	TGGGAG	2	12	219336	219347	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	50913556
84	NC_006086	TGACTG	2	12	219505	219516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50913556
85	NC_006086	TTGACC	2	12	219967	219978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50913557
86	NC_006086	CCTATC	2	12	220973	220984	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	50913559
87	NC_006086	ATCGGT	2	12	225879	225890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50913565
88	NC_006086	CAGTTC	2	12	227218	227229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006086	TCAACA	2	12	228232	228243	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50913566
90	NC_006086	TTTAAA	2	12	229066	229077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006086	TGAAAA	2	12	233936	233947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50913573
92	NC_006086	AGATGG	2	12	240424	240435	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	50913579
93	NC_006086	ATTAGC	2	12	240439	240450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50913579
94	NC_006086	TCATGC	2	12	247364	247375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50913585
95	NC_006086	TCCCAT	2	12	251301	251312	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	50913590
96	NC_006086	AAGGCC	2	12	255063	255074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913595
97	NC_006086	TTGGCT	2	12	257551	257562	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	50913598
98	NC_006086	TACCCA	2	12	260953	260964	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50913601
99	NC_006086	GATACG	2	12	261981	261992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50913603
100	NC_006086	AGGCAA	2	12	265879	265890	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	50913607
101	NC_006086	GCAAGA	2	12	270000	270011	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	50913610
102	NC_006086	TTCGAA	2	12	271399	271410	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50913610
103	NC_006086	TGGCAA	2	12	274039	274050	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50913613
104	NC_006086	CCAGAA	2	12	274371	274382	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	50913613
105	NC_006086	CAGCAA	2	12	275396	275407	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	50913614
106	NC_006086	TGGCGG	2	12	278146	278157	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	50913615
107	NC_006086	GGCTGT	2	12	280759	280770	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	50913618
108	NC_006086	AGTGAC	2	12	282634	282645	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50913620
109	NC_006086	ACTTAT	2	12	289900	289911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50913626
110	NC_006086	AAAAGC	2	12	290853	290864	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50913626
111	NC_006086	GAAACA	2	12	291034	291045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50913626
112	NC_006086	AAAATC	2	12	295380	295391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50913630
113	NC_006086	AGTGTA	2	12	301876	301887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006086	ACTAAT	2	12	301904	301915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_006086	TAAAAA	2	12	305135	305146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50913635
116	NC_006086	TCAAGA	2	12	311386	311397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913644
117	NC_006086	GGGTTA	2	12	316399	316410	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	50913649
118	NC_006086	GACAAT	2	12	318435	318446	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913651
119	NC_006086	CCAGCT	2	12	320260	320271	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	50913652
120	NC_006086	TTAAAA	2	12	322293	322304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006086	CAATTT	2	12	329161	329172	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50913661
122	NC_006086	ATAACC	2	12	331770	331781	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50913662
123	NC_006086	GCACCT	2	12	334357	334368	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	50913664
124	NC_006086	AGCAGG	2	12	336207	336218	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	50913666
125	NC_006086	TTTAAT	2	12	339371	339382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006086	ATGATT	2	12	349446	349457	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50913685
127	NC_006086	TATCGC	2	12	349679	349690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50913685
128	NC_006086	AAGACC	2	12	350322	350333	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	50913686
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130	NC_006086	GATAAA	2	12	353350	353361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50913689
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133	NC_006086	AAGACC	2	12	365868	365879	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006086	GCAGAG	2	12	374842	374853	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	50913713
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137	NC_006086	ATTTAA	2	12	397732	397743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006086	TATTGA	2	12	397898	397909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50913737
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140	NC_006086	GCTAAA	2	12	407690	407701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913748
141	NC_006086	GAAAAA	2	12	410483	410494	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50913751
142	NC_006086	TTTACC	2	12	410701	410712	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	50913752
143	NC_006086	AGCCCC	2	12	413131	413142	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	50913755
144	NC_006086	AGAAAA	2	12	413146	413157	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50913755
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148	NC_006086	GAGAAG	2	12	425728	425739	50 %	0 %	50 %	0 %	50913774
149	NC_006086	ACGCAT	2	12	428231	428242	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50913779
150	NC_006086	AGAAAT	2	12	433991	434002	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006086	TTGATA	2	12	434564	434575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50913787
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176	NC_006086	TAAGGT	2	12	513670	513681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913871
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188	NC_006086	GAAAAA	2	12	537715	537726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_006086	CCACAA	2	12	664885	664896	50 %	0 %	0 %	50 %	161761316
236	NC_006086	TTTAGA	2	12	671086	671097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50914012
237	NC_006086	TGCTTT	2	12	674459	674470	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	50914016
238	NC_006086	AAATTG	2	12	676238	676249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50914017
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338	NC_006086	TTTAAA	2	12	966686	966697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
339	NC_006086	AGTCTT	2	12	969545	969556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50914313
340	NC_006086	CATTGC	2	12	973630	973641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50914317
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343	NC_006086	GAAATC	2	12	976684	976695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50914319
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350	NC_006086	ATTGTA	2	12	985723	985734	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50914326
351	NC_006086	TTAATA	2	12	985982	985993	50 %	50 %	0 %	0 %	50914326
352	NC_006086	TGATTT	2	12	994476	994487	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50914337
353	NC_006086	TTTATT	2	12	996639	996650	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50914339
354	NC_006086	ACCAAT	2	12	1002421	1002432	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50914342
355	NC_006086	GGAATG	2	12	1004272	1004283	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	50914344
356	NC_006086	TCTGCT	2	12	1008065	1008076	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	50914352
357	NC_006086	TATTCT	2	12	1010663	1010674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50914357
358	NC_006086	CGATTA	2	12	1013196	1013207	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50914359
359	NC_006086	ATCTAC	2	12	1014336	1014347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914361
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361	NC_006086	TTGTTT	2	12	1028129	1028140	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
362	NC_006086	TTAAGT	2	12	1029925	1029936	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50914380
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391	NC_006086	CTCAGT	2	12	1105334	1105345	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50914454
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447	NC_006086	TGCGAC	2	12	1223010	1223021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	50914569
448	NC_006086	CCCATA	2	12	1223597	1223608	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50914569
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451	NC_006086	TTCCCT	2	12	1228655	1228666	0 %	50 %	0 %	50 %	50914581
452	NC_006086	TCTGCT	2	12	1230501	1230512	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	50914586
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454	NC_006086	AGCAAT	2	12	1236096	1236107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50914594
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456	NC_006086	CGCAAT	2	12	1246217	1246228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50914604
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458	NC_006086	TGACTT	2	12	1247977	1247988	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
459	NC_006086	TCGCAA	2	12	1248688	1248699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50914607
460	NC_006086	TCCCTG	2	12	1253328	1253339	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	50914610
461	NC_006086	ATGATA	2	12	1254483	1254494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_006086	GCTTTA	2	12	1254997	1255008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50914611
463	NC_006086	ATCAAA	2	12	1256403	1256414	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50914614
464	NC_006086	TTGATT	2	12	1257883	1257894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50914616
465	NC_006086	TCAAAA	2	12	1257947	1257958	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50914616
466	NC_006086	CCAATC	2	12	1258355	1258366	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50914616
467	NC_006086	TTCTTT	2	12	1261709	1261720	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50914618
468	NC_006086	GCCATC	2	12	1262123	1262134	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	50914619
469	NC_006086	AATCAA	2	12	1263183	1263194	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50914620
470	NC_006086	AATATT	2	12	1264195	1264206	50 %	50 %	0 %	0 %	50914620
471	NC_006086	TAGAAT	2	12	1264327	1264338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
472	NC_006086	ACCGAT	2	12	1266122	1266133	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50914622
473	NC_006086	AGGTAA	2	12	1268856	1268867	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50914626
474	NC_006086	GTTACT	2	12	1269722	1269733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50914627
475	NC_006086	TTTGAT	2	12	1271468	1271479	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50914629
476	NC_006086	CTTAAG	2	12	1272182	1272193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50914630
477	NC_006086	TCAAAA	2	12	1272659	1272670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50914631
478	NC_006086	ACCTTC	2	12	1276604	1276615	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	50914636
479	NC_006086	GAGATA	2	12	1282235	1282246	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50914641
480	NC_006086	ACCACA	2	12	1282887	1282898	50 %	0 %	0 %	50 %	50914642
481	NC_006086	AGCTGA	2	12	1288742	1288753	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50914647
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488	NC_006086	TAGTCA	2	12	1315103	1315114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50914672
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494	NC_006086	TCCTTC	2	12	1329253	1329264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_006086	ACTTGT	2	12	1330718	1330729	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50914683
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499	NC_006086	TTTATT	2	12	1338993	1339004	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50914694
500	NC_006086	TCCTCT	2	12	1346060	1346071	0 %	50 %	0 %	50 %	50914697

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