MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	AGTGTA	2	12	22939	22950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006086	ACTAAT	2	12	22967	22978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_006086	AGTGTA	2	12	28940	28951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006086	ACTAAT	2	12	28968	28979	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006086	TAAATA	2	12	47446	47457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006086	GATGTG	2	12	49641	49652	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006086	TATTTT	2	12	105553	105564	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006086	AGTGTA	2	12	125515	125526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006086	ACTAAT	2	12	125543	125554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006086	TTCGGG	2	12	126485	126496	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006086	ATAAAA	2	12	154729	154740	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006086	AGATAA	2	12	177108	177119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006086	CTTTAT	2	12	201990	202001	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_006086	CTCTTT	2	12	203854	203865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006086	CAGTTC	2	12	227218	227229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006086	TTTAAA	2	12	229066	229077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006086	AGTGTA	2	12	301876	301887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006086	ACTAAT	2	12	301904	301915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006086	TTAAAA	2	12	322293	322304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006086	TTTAAT	2	12	339371	339382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006086	TTTTAG	2	12	350727	350738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006086	AAGACC	2	12	365868	365879	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006086	ATTTAA	2	12	397732	397743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006086	AGAAAT	2	12	433991	434002	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006086	GAGTAA	2	12	475456	475467	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006086	AGGACT	2	12	489792	489803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_006086	AAAAGA	2	12	502247	502258	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006086	TAAAAA	2	12	509212	509223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006086	AAAAGA	2	12	509395	509406	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006086	GAAAAA	2	12	537715	537726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006086	CCTTGT	2	12	575486	575497	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006086	TAAATA	2	12	690892	690903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006086	AGGTAA	2	12	701692	701703	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006086	TTCGGG	2	12	736792	736803	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_006086	TTAAAA	2	12	856364	856375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006086	TTTAAA	2	12	966686	966697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006086	TTGTTT	2	12	1028129	1028140	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006086	ATATGA	2	12	1053111	1053122	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006086	AGTCTT	2	12	1072333	1072344	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_006086	TCTTTT	2	12	1102200	1102211	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_006086	AGCGTA	2	12	1135623	1135634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_006086	AAAAGT	2	12	1151837	1151848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006086	AAATAT	2	12	1162673	1162684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006086	TCAATC	2	12	1169219	1169230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006086	ATGGAT	2	12	1173380	1173391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006086	CCTTGG	2	12	1192933	1192944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006086	CTAAAA	2	12	1227450	1227461	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_006086	TGACTT	2	12	1247977	1247988	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006086	ATGATA	2	12	1254483	1254494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006086	TAGAAT	2	12	1264327	1264338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006086	TCCTTC	2	12	1329253	1329264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006086	ATTTTC	2	12	1331344	1331355	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006086	AGCCTT	2	12	1349100	1349111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006086	TATTAG	2	12	1358392	1358403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006086	TACACT	2	12	1358421	1358432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006086	GAAAAA	2	12	1363888	1363899	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006086	CAATTC	2	12	1382977	1382988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006086	TATTTT	2	12	1384049	1384060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006086	AATACC	2	12	1393066	1393077	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006086	CTTTTC	2	12	1443424	1443435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006086	AACAAT	2	12	1465667	1465678	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_006086	CTAGTC	2	12	1566628	1566639	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006086	AATATT	2	12	1585164	1585175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006086	TTTGCT	2	12	1600806	1600817	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_006086	TAACAA	2	12	1614752	1614763	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_006086	TTTTTC	2	12	1617140	1617151	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_006086	AGAAAA	2	12	1619836	1619847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006086	TATTAG	2	12	1626155	1626166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006086	TACACT	2	12	1626184	1626195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006086	GTTAAA	2	12	1641329	1641340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006086	ATTTTA	2	12	1812891	1812902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006086	TTTAAG	2	12	1832732	1832743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006086	TTTTCA	2	12	1833919	1833930	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_006086	TAAAAA	2	12	1845900	1845911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006086	AATTTA	3	18	1857356	1857373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006086	TTTTTC	2	12	1877712	1877723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006086	GAAAAA	2	12	1894540	1894551	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.